Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0371040
Sequence Length
290 nt
GC Content
0.5552
GGCAAGGGGAGCAGAUAGAUGCUCAGGAGCGAAAGACGCAGAGAAUUGGAUCUGGCGCCUCCUAACGCAGCCCGCACAGGAGCGAAGGAGAGUGUGACGAUCCCCCUGAUGCGGCUGAGAUGUUCUGAAAUGAAGACGUUGGCUCUCAUCCCCAGCCUGAAGAGAGAAAAUUCUGAGAUGGCUCCCUUACAGAUUGAGAGCAGGCACUGGGUAGGAACACAGCCAAGAACGAUUGCAGGAUGGGUCCUUCCAGGACACUGACGUCUCAGCUUGCGCACUGUGAGUCCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-95.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -101.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 56.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((.(..((((.((((((((.(((.....)))........((((((.(((((((((..(((...((.....)).))).))))).)))).).))))).))))).((((((((((((((((.......))..(((.(((((((((...((((.....(((......))).....))))........)).))))))).))).(((((.((((.(.((.((.............)).))).)))))))))......))))))))))).))))))))))..)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((((.{..((((.((((((((.(((.....)))........((((((.(((((((((..(((...((.....)).))).))))).)))).).))))).))))).((((((((((((((({,..,,......{({,(((((({{{,..((((,,...{({,....,))).....}}))..,.....),.)))))))}})}.{{|||.{{||.{.{|,||,,......},.,.)).}}|||||}}}})),,}.,,}))))))))))},)))))))))..}))))).
Back