Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0374184
Sequence Length
573 nt
GC Content
0.4572
AUAGUUACUUGGGACAACAGUUUUAGCAGGGCUCUCUUUCUCCUUUCCUGAUCUCUCUGUUAAGCUGCCUGGCUCAUUUGAUAUCACAUCCAAAUUAUCAGCUGAUUGCUCUAUUGUUUUGGACAAUGCCCUGAAGCAUACCAAAAUGUGUCUGGAAUUGGUGGGUUCUUGGUCUUACUGACUUUAAGAAUGAAGUUGCGGACUUUUGCGGUGAUCCACCCUACCACAUAUUGUCUCCUAAUGGCCGUCCAGUUUAUCCUGGAGCCCUUGCAUGACACAGGCCUAUCGAAGCAUAGGAGAUGCCAAUAUUUUACCUCUUGGGUACUUUCUGUGUAGAAGAUUCAUAACAAGAACAAUACUUAUUCUGCAAUUCUUUAUAUAAAGCUCCAGAGGGAAGUGAGAAGGAUGUUCACUUGCUGGUGAGAGAAGGAGCUGGUUCCAUCCAUUACGCAGUCCCCUGGGAGCGCUAAAUGCAACUUUAUCUCAACGGGGAGUGGACGAUGAGCAGGACGUCGCUAGAGGGAAAGAGCCUCACUUCCCGUUUCCUUUGGCAGCGCCCUUUUCCCGACCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-160.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -171.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((................((((((((((((((.......((((((((...((((((((((((((.((((((............)))))).)))..))......(((((((...((((......)))).)))))))..(((((.((((.....((((((((((.....))))..))))))..)))).)))))...((.((((........)))).))...((((...(((.(((..(((((......)))))))).)))...)))))))))........(((((((((.((((................)))).))))))))).(((((((((.((.(((.......))).)).)).)).)))))......)))).)))))))))).)))))))).((((((((.(((.(((((((((..(((((......)))....((..(((....)))..)).....))..)))).))))).))).))))))))...))))(((.(((.(((((((((((.(((......)))...))))))))))).))).)))..)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
........((((((...,,{{...,||,{{({{((({{{{(({{{{,,.,,,,,|||{{,,,|({{{(((((((((,((((((............))))}|,}}}..)),.....{((((((...((((......)))).))))))}{{({,{({,,.,(((((((((({(((({...,|||{{{|,,,,)}}))))},)))),...,.||,|}}})))).,,))}})}},{(((...(({.(((..(((((......)))))))).}}}...)})}}})))........|||||||||}|{{{.........,,,,,,|||}},||}}|||||{(({(({{{{.,,.{((.......})}.)).)).}}})}))),,,,,,))}),)))))))))).)))))))}.((((((((.(((.(((((((((..(((((......))).,,,((..(((....))),,)},,...))..)))).))))).))).))))))))},,)))){((.(((.(((((((((((.(({......}))...))))))))))).))).)))..)))))).....
Back