Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0374188
Sequence Length
6001 nt
GC Content
0.3659
GAUGCCUGGACAGCAUCAGUAGUAGUUGCCCGAGGGAGGGGGGCAGUCCUCGUCCGGGGACAGGUCCCAAAAGGCUGUUUAUUUGUUAGAGUUCUACGCUCUUCAAAUGAACCCAAAUCAAGGGCAAGUUAUCACGCACCAUGUGACACCCGGCAGCUCCAGACUAGAACAAGGCUCUGCACUGAACGUGAUAAUUGAACUUUUAAUGCCAAGUGUCACUUUUCUUUCAGAUGCCAAUAUUUUACCUCUUGGGUACUUUCUGUGUAGAAGAUUCAUAACAAGAACAAUACUUAUUCUGCAAUUCUUUAUAUAAAGUAAGAAGAAAGCCCAAAGACAAAACCAGAGGCAACUGGCUGCUGCAUCGCCCACCUAGUGGCAGUAGUGUGAGCUAUGGACAAAAGAUCUAAGUCUCCAGGACAAAGAGUUGUGCAGCUGCUCAUUUUCCUGUUGACUUCUGUCUAAGACUUGGAGAUGUUUGUAAGAUUGGGACCUACCUACAGAGGUAUCACACUCCUCUUGGUCUAACUCACUCUUGAACUGACAUUCGUGGUGAAUUUCUUUUGUCACUUAGCAUAUUAGAAGAGAUGUUUUACUAUAAUUCUCACAAUCAAUCCAUAAGCAAGUGGUUAAAGGCCUUUUUGUACUUAGUUAUCUCAGCACUGUCAGGGAUGGCUAAAGAGAAUAAGCAUGGCCUCUGCUUUCCAUUUUUUAACAUAUGACAACUAAAAUACAAAAAAACACAAGUUAUGACAAACAUAUAAUGCUUCCUCUAGACAAGCAUUGCAGCUUGGCAUUGCACUAAGUGUUUUGAUACUAAUCCAUUAAAUUCUCCCACCACCCAACAACGUAGAAUAUAUCAGAGAGUGAAGCAUGGAGAAUUUAUAUAAUUUGCUCAAGGCUACAAAGCUAAUAAAUGUGGAGCCAGGAUUCAAAUGUAGGCAUUCUGAUUCCCUAGUCUAUGCUCUUACCCAGCAUGUUAUGCUGAUGCUCAAAACAGUUGAGUGUUAUAUUAAUUUAAAUAAAAAAGAUAAAUUAGAGCUAGAGAGUGUGUAAUAGGCUCCAUGGAGAAAGUCAAAUGGACUUGGAACUUGGCAACUGAAGAGACCAUGGCCAGACAAAUGGCAAGAAAUUCUGGCAAGAAGAACAAUAGGCAUGGAGUGUCCGCAGCAGAGGAAAGAAGCCAAUCUCACUACAGUGGACGGAAACAAGGAGAAAUUAAAUGAGAUCAUUAGAAUGGAAAAGAUUGUAGAAAUCCAGAUAAUUUAUAGUGAAAAUUGAAUUUCUAAGAGGGUGAAGUUAAAAUUGGGUUAAUAGACACUAUCUCAAAAAUGUAAUCUGUUACAUUACAACAGAAACAAAGCUUCUCAUGACAUGCAGAGAUCCAUAAAUGACUGUUUUACUUUUGGCAAAAUUGAAAAGAGAAUAAUAGUGACUGCAGGGUCAAGAUUAAUGCAUGCUGAUUUUUAGGUAACAUGGGAGAAUUAAAGAGCCAGAGUUUCACUACUGGCCACCAACAGUCCAUUUUAAUGUGUACUCAGUCUUUGUGACCUCUGUCCAUUAGAGAUAUAUCAAACUUGUAUUUAAACUGAAAUGUGAUUAGAGCCAUGAGGCCUGCCUGGAGGUAAAGCAGGUUGAGAAAAAUUUCCUCAAUGACACAUUCUCUAUGGAAAGUCUUUCUCAAAGGAAAAGAAAUUGUGUCCUACUGGCAAAAAGCAGAAAAGGAAGUGGGGAGGGGAAAUGGAAAAACAUCUAAACCAUCUCUGGGGAAAAGGUGAUACUAAAUAUAAACUGGCCAUCAACAUAGUGAAGCUGAAGAAGGCAAGGGGUGUCUAAAUGUAUCAUCAGAAAAGUUAAGAAACAGGGCAAAGUAGGCUAGCUUAGGAACAUCAACAGAAUAUUGGAAGAAGAACAGGGGGCAAUUUUAUAACCUCUCAAUCAUUUCCAACUUCUUACAGUGCUCCAGAAAAGAAAAAGUGUCCUUGAUAAGAAUGAUUUAUUGAACAAUUAUCUCUUUCCGCCCUCAGCUCUCUGGAACUGGACAACAGACAGAUCUGGUGAAUUAUAAUUAUGGAGUUCUCCAGAAGAACUUCCUCUCAAGGAUGCACAAUUUUCCAGUUAGUCACAAGGCAGCAUCACAAGCAAAAUGGGGCUCUCUCUUUAUUUAACAAGGCCUAUCUUCUACACACAGUUUCUGCAAUUUCCGCUUCUCCUUAUGUGUAUCUUUCUCUGCCCUUUUGUAUGUUCCACUUAUGUAGGAUUGUUUGCCCCACAGUCACACACAAUACAAUCAUCAUGCUAACCCCCUCCCCAAAAACUCCCUACUCCCUUUUCAUCUCUCCCAUUGCUCCUCCACACUGGUCCUGCGCUGGCCUGUUUGCUCCCUGAGUAAAUUAGAUCCCUGCAUGUGCUGCUCAUCUUCCCUCCCUCCACCUUCCACCAUACUCUCUUCAUGUCCACAUCUGCCUCUUGGCAAAUGCCCUGUGGAAGAGAGAUUUUUCCCAGGCUCUCCUCCCUUGUAGGUCUCUUUGUGCCUCCGCAUCCUGAGUUUCCUCUGACUCUUGUUUCUUUCUGCUUCUUGUGACAGCUAUGGUUACAGCUAACAAGCAUGGGAGGAAGGAUCUGAGGGAAAGUUGUGCUUUUGGUUCACUAAAUCCUUAGAUUUGAUUUGGGUAGUCAGAAAGUGCUAAAAAGUUUGUUUCAAUGGAACAUCCUGCAGUCCCAAAUGGGGUAAACUUAUCUUGUUUUUCAUCUGCUGUCAUGGUUAACUGGCAACUUCCAGGUACAAGGUGACUGUCUGGCAUCUCAGGUGCACACAUGAAGGCAAUUUCAGAAAGAAUGCCUAUGGAUUACAGACCAUUCAGCUGAGUUUUAUCUGGGGCUUUCUGGCACGGAAUAUGUACCAGCAUCUUAGAUCAAUUCUGGCACAUUAUUUUAAAAGUUUUUUGUUCCUGAGUUCCUUGGUACCUGAUCAUUCCAAUAUUUUCUGCCUUACAAAGUCACAGGAAAACAGGUUUGGAGCUGAGUAUUUUCAAUCACCACUGACUUGGUGACAGACACUAAACUCAUUUCACUUAGGAUUAUAGGUUGAACUCAAAUUGGGAUCCCUGAAGAGAAAGACCAGUCCUUUAUCCAGUACCUUAAGGAAAACAUUUCUUAUUUCCAUUAACAACCAGAAAAGGAAAGACAGUGCAACAGCUGGAAGAGCACUGCAAAUAUCAGGGUUACAAAGAGUAACCCAGAAACCUUUAAAAUAAUUUAAAGUGGUGAUAAAACCAGUAACACACUGCACUUCUAUUAAUGCAGUAAUCCUUAACCCUUGAACCUAACUUGUACUUACACUAAGAAGUCAGAAGAACUGUUUUUACUUGAUCUACCAAGGCAAUUUCCCAUAGUUUGAUUGGAAAUAGUGCUGAUGAUUUUCUCAUUUAAGUUAUCUACAAAGCACUAAAAAAAAGUGACUCUGCUGGAAUUAUCCUUCUAAGAAAAUAAGAAAAAAAUAGAAAUUUCUUACAACUAAGAAAUGGAUCAAGAUAACAUUGGUCUGUGAGAUUUAAAUCUAUCAAAAUAUGUGAGCAUACCACAGAUAUGAUUUCUUCAGUUCUCUGCAAGGUAACCAAAGCAAUUCCAAGAAGUCUUAUUUUAUUAGAACUCAAAUUUAUUAAGUAUGACCUAUCUAAGAUCAUAGUGGGCAGACAACUACCUUGGACGUGGGGUUAAGAGAAGAUAAAAUUCAAAAGUUUGAAAGUAAGUAAAGGAUAAGCAAGAUUCUUUGAAUGAUCAACAGCACUCCACAGGCACACAGAGACACAAAAACAGCUAAAAAGGCAAGGACAAAAUUAAACAGUAAUGAUGAUUUAUAGUAAGAUACUCUGAGACAUGAUAGAAGUCUCAGUACACCAAAAGGAAAAUCUUGUUUGCUCAAAUUAUUUGUUUCUUCUGUCUAAUGAAUGUAAUUCUAAUAUACAAGUGAUAACACUGGCAUUUCUUUGAAAUGUUGAUUCAGUUUAAUUAUGAAAAUCACCAAGGUAUUUUCUAGCUGCUGCAUCACUCCCUGUACUAAGAUUAAUCACAUCAACAUCAUUCAUUUAAUCUUCAAAGAGGAAGCAGUUGUCCACAAAAGCCUUCAAAUAGCUUCAUUAGUGCAAUUUUUCAGUCUCAAACACUUAGCUAGCAGCAUAUGAUUGAGAGUAAGGUCAUUAUAUUCAUCUAUUUCCUAAUCUAAUUUUUGUAAUGUUUCUACAUUUAAUGUAGGAAUGUGUAAGUGUGGAGUUUUUGCCUUCUCUUUGUUUGUAAAACAGCUCAAAACAUGAAGAAAAUAAUGAUUCUAAUUAUAAAAUAUUUGAUUGCUAUGGUUUUAAGUCAUGAAAUUUAAUGUACAGGCCCAUGGCCAGUUCAUUUUUUCUUUUUUCUUUUUUUAAUGUGAAAAGAAUUUAGUGUAGAAAUGCUCUAUUUUCUUGUCUCUUGUAGACAAAGAAAAACUUAGCGCAUGAGAGACGUGUCUGACUUCAGAAACUGGAAUUACAAAAGUCACUGCAAAUAAAAUUUCUUUGGUGUUUUAAAAUGCAAGAUGAAUUCUAUAUUUAAAAACAGAAGCCUCACUUAUGUUUCUCUAAUAAGACCCAUUCUUAACAUCCUUUUCUUUGAUGAAAGCAUUAAUAUUCCCUUUCCUUAUUGGAAACCAACAGGUAUCAGAGUCCCACAAAAUAACACUGUAUUGUUGAUGCACCGAUCAAAUCAUUCUUUUAAUCAUUAAAAAUUAUGCAGUUGCAAUCAAAAACAUUCUCAGAGAGACUUAGAGCAGAGCCUGGCACCAGCAGGGUGUGGUGAUAUAGUCAUUUGUAAUUACUGUACCUACUCUGAAGGGUUAUAAAAUGUGUCAGAAAGUAAAAUUUGCUGAGCCCCAUUACCAAGAAGCAAAACUUACUAACUGGUGCUUUAAACUUUGCAUCUUAUAAAGGAAUGAUUUAUUUGACUUUUGACUGGUCCACUUGCAGAAAUCA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1435.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1558.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 1483.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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