Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0375696
Sequence Length
410 nt
GC Content
0.6171
UCCUCGGCCUGGCGCUUGUAGGCCUUGACCUUCAGUUGCAGCUUGUCCACCAGCUCCUUGAUGCGCCGCUCGCUCUUCCUCAUGCCCUUCACCGACUCUGCGUUGCGCUUCUGCUCGGCCUCCAGCUCACCCUCCAGCUCCCGCACCCGCGCUUCCAGCUUCUGCAGCUGCUUCUUGCCUCCCUUGAGGGCGAUCUGCUCGGCCUCGUCCAGCCGGUGCUGCAGGUCCUUAAUGGUCUGCUCCAUGUUCUUCUUCAUGCGCUCCAGCUUCUGCAGCUGCUUCUUGCCGCCCUUGAGGGCGAUCUGCUCGGCUUCGUCCAGCCGGUGCUGCAGCAGCAUUGGAGCGCUCUACGUCCACCAUCAAGUCCUCGAUCUCAUUCUGUAGCCGGUGCUUGGUCUUCUCCAGCGAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-135.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -142.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 78.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.......))))))...(((....(((((((..((......((...(((((((....((..((..........))........(((.(((((..(((((.(((..(((((..(((.((.(((((.((.....(((...(((((..(((...))).))).))....)))....)).))))).)).)))...))))..)..)))..)))))))))))))....((((......))))............(((((((((((.(((((((.((.....))(((((....)))))....((.(((((......)))))))))))))).)))..)))))))).....))....)))))))..))......))..))))))).)))(((.((......)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((({,....,}}||}}..,(((....(((((((..((......{{...(((((((.(,.{,..{{..........}}........(((.{{(({..(((({.{{(,.{((((..(((.((.(((((.((.....(((...(({{{..,{({...})}))),)}....}))....}}.))))).)).)))...))))..}..}))..))))),||||}}},...{{||,,,,,.}}||,........,,.(((((((((((.(((((((.((.....))(((((....)))))....{{.(((((......))))))}))))))).)))..)))))))).....,.....)))))))..}}.,....))..))))))).))){{,,((......)))))))))
Back