Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0385365
Sequence Length
659 nt
GC Content
0.5190
CCCUCCGCGCAGGCCUCCGGGGGGCCGGGGCUUACCAUGUAGGGGAGGGGAGAUCUAUCCACAUACCUCAGGUGGCCAUGGUGGAGGUGCAGCUGGAGAGUGACCACGAGUACCCACCAGGCCUGCUGGUGGCCUUCAGUGCCUGCACCACCGUGCUGGUGGCUGUGCACCUCUUUGCACUCAUGGUCUCCACGUGUCUGCUGCCCCACAUUGAAGCUGUGAGCAACAUCCACAACCUCAACUCUGUCCACCAGUCGCCACACCAGAGACUGCACCGCUACGUGGAGCUGGCCUGGGGCUUCUCCACUGCCCUGGGCACCUUUCUCUUCCUUGCUGAAGUUGUCCUGAGAUAAGGAAACAGGCCCAAGAAGGCUGAAGAUCUUGCCCAAAACCACACAGCUAGUCCAUGAAACUGAACUUGGACUAUCUACCCCUCACACGGGAAUCUCUCUUUGAUUUGAGAAAAGGAACCAGUGCCUUUCAACUGGAACAGAAAGGAAUCUGAUCUCAACACCUAUGCCUCCACGUAAAUUAUUUUUUUCAGCCUUAUUUCCCUCAAAAUUGUAGAGUCCUAAUCUUCUUCUAUCUUGUGGUGUGAGACCUUGGAUAAGUCUCCCUUCCACCUUUUCCUAUUACUUAAAAUGGUGAAUUUGCAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-218.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -230.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 119.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((.(.((((((...)))))).).))(((((((..((((((((((((((.((((((.....(((..(((((..(((((((((.(((((.(((.((((((((.((((..(((((((.....)))))))......((((..((((((((.....))))).)))))))........)))).)))))...)).).)))))))).))...((((.(.((((.........)))).).)))).....)))))))...)))))....))).(((((((((((((((((((..(((((((((.........))))))))).(((((((.((((((((((..((.((..((.(.(((((.....((((......)))).....)))))).))..)).)).))))(((((((.(........).))))))).....(((......)))....((((........)))).))))))(((((........)))))...)))))))....................).)))))))))..................................((((((...........))))))...))))))).))....)))))).))))))))))).)))................)))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{,{{{((((.((((....)))))))|{{{{{{..((((((((((((((.((((((.....(((.{(((((..(((((((((.(((((.(((.{(((((((.((((..(((((((.....)))))))....,,((((,.(((({{{{},,,.))))),))}|||}.....,},)))).)))))..,)).}.))}))))),)}...((((.(.((((........,)))).).)))).....)))))))...))))).,,.}}}.,{(((((((((((((((({..(((((((((.........))))))))).(((((((.((((((((((..((.((..((.(.{{(({.....((((......)))).....})))),,}}..}}.}}.))))(((((((.{........}.))))))).....(((......)))....((((........)))).})))),(((((........)))))...)))))))....,,..............),}))))))))..................................{{((({...........}})})}...)))))))},}....)))))).))))))))))).)))...,,,,,,.......))))}))...,}}.....
Back