Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0393693
Sequence Length
645 nt
GC Content
0.7721
AGCACACGCGCGCACACCCGCGUGGAGACGGCUGUCCUCGCCCGUCUGCCCCGCGCCCCAGCUGGGACUCACCGUUGUCCAGGCGCGCGAUCUGGGGCAGCCGGUAAGUGCUGACCAGGAGGUCGAGCGGCACGGCCACCGAGCUCCACUUCACAUCCUUGAGGCUGCAGCCCAGCGAGGGCGCCGGGUCCAUCUUCCCCGAAGCCUCCUGUCCCGCGCUCCCCCGCCGCCGCCACCGGCACCACCCGCGCCUCGGCGGCCGCCGCUGCUCGCGCUCGCGGUCUGGGGCGCGCGGGAGGCGCCGGGCAGCUCCGGCCGCGGGCAGCCGGGGGGGCGCGGCGACUGGGGCGGCCCGGAGGGAGGGGGCCGGCGCCCGGCUCAGCUGCCGCUGCGGGGCAUGGCUGGGGCGCCCCGCGUGCCCUCACGCCCGGAGAAGACUCAGAGCAGCCGCGCGGCUGCGGGCGGCGGCGGCGGCCCGGGUGGCUGCGGCGGCUCCCGCUCCGCCUCCUCCUCUGGCCCUGGGUCUGCAGCUGCGGCGGCCGCCCGCUCGCCUCCUCCUCCUCUUACCCCUCCUUCCCUCCGCCUCGAGCGUGUGAGGAGGAGCCGCGGGUCUGAGAAACGCCAUAGCAGCGCUCCCAGCACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-370.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -381.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((........)))))).....(((.((.((((.(((.(((((((((((....(((.((((........)))).))))))).....))))))).)))...(((((((((....))))....)))))((((..((.(((((.((((((((.((((((((.((.((((.....))))))((((.........))))..(((.((.((((((((((((((((..((.(((.(((((.((.((((((((((.(.(((((((((.....)))...))))))).))).))))))).)).)))))((.((....)).)).))).))))))))))))))).))).)))))((...(((((((((((((((.((((((...(((((((((((((.((((.((...(((((((.....))))))))).)))).(((....)))...)))).)).))))))))))))).))))((.(((.(((((((((((.(((((((..((((.(((.........)))...))))..).)))))).)))))))))))...))).))...........)))))))))))..)))))))))).)))))))).)))))))..))))))))..)))))....(((.(((...))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((.{......)))))),.,.(((({({{(({((,(({(((((({(({,....||,}||((........)}})})))).))),...}))))))})),..(((((((...((((((.(((((((..(((((.((({{,....{{(((......)))||{((((((((((...(((((((((,(((.{((((((((..((({((,((((((((((((((((,.(({(({.(((((.((.((((((((((,(.(((((((((.....)))...))))))),))),)))}))}.)).)))))((.((....)).)).))).))))))))))))))).))).)))),}}}.))).)))))))))))))))))){{{...(((((((((((((((((({,{.(((...,))})))))))))..(((((.(((....)))...((((((....)))))))))))))))))))|||{.(((.((..((((,(({..,,))})))),.)).}},..))))))))).)))))))).))).))))).)))))))))))))....(((..((((((((({{{({((((.....),)}).)))))))))....))))..)))...{((.......))),...)))))))..
Back