Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000062.3

Sequence Length

1830 nt

GC Content

0.5415

AGUCUGCACUGGAGCUGCCUGGUGACCAGAAGUUUGGAGUCCGCUGACGUCGCCGCCCAGAUGGCCUCCAGGCUGACCCUGCUGACCCUCCUGCUGCUGCUGCUGGCUGGGGAUAGAGCCUCCUCAAAUCCAAAUGCUACCAGCUCCAGCUCCCAGGAUCCAGAGAGUUUGCAAGACAGAGGCGAAGGGAAGGUCGCAACAACAGUUAUCUCCAAGAUGCUAUUCGUUGAACCCAUCCUGGAGGUUUCCAGCUUGCCGACAACCAACUCAACAACCAAUUCAGCCACCAAAAUAACAGCUAAUACCACUGAUGAACCCACCACACAACCCACCACAGAGCCCACCACCCAACCCACCAUCCAACCCACCCAACCAACUACCCAGCUCCCAACAGAUUCUCCUACCCAGCCCACUACUGGGUCCUUCUGCCCAGGACCUGUUACUCUCUGCUCUGACUUGGAGAGUCAUUCAACAGAGGCCGUGUUGGGGGAUGCUUUGGUAGAUUUCUCCCUGAAGCUCUACCACGCCUUCUCAGCAAUGAAGAAGGUGGAGACCAACAUGGCCUUUUCCCCAUUCAGCAUCGCCAGCCUCCUUACCCAGGUCCUGCUCGGGGCUGGGGAGAACACCAAAACAAACCUGGAGAGCAUCCUCUCUUACCCCAAGGACUUCACCUGUGUCCACCAGGCCCUGAAGGGCUUCACGACCAAAGGUGUCACCUCAGUCUCUCAGAUCUUCCACAGCCCAGACCUGGCCAUAAGGGACACCUUUGUGAAUGCCUCUCGGACCCUGUACAGCAGCAGCCCCAGAGUCCUAAGCAACAACAGUGACGCCAACUUGGAGCUCAUCAACACCUGGGUGGCCAAGAACACCAACAACAAGAUCAGCCGGCUGCUAGACAGUCUGCCCUCCGAUACCCGCCUUGUCCUCCUCAAUGCUAUCUACCUGAGUGCCAAGUGGAAGACAACAUUUGAUCCCAAGAAAACCAGAAUGGAACCCUUUCACUUCAAAAACUCAGUUAUAAAAGUGCCCAUGAUGAAUAGCAAGAAGUACCCUGUGGCCCAUUUCAUUGACCAAACUUUGAAAGCCAAGGUGGGGCAGCUGCAGCUCUCCCACAAUCUGAGUUUGGUGAUCCUGGUACCCCAGAACCUGAAACAUCGUCUUGAAGACAUGGAACAGGCUCUCAGCCCUUCUGUUUUCAAGGCCAUCAUGGAGAAACUGGAGAUGUCCAAGUUCCAGCCCACUCUCCUAACACUACCCCGCAUCAAAGUGACGACCAGCCAGGAUAUGCUCUCAAUCAUGGAGAAAUUGGAAUUCUUCGAUUUUUCUUAUGACCUUAACCUGUGUGGGCUGACAGAGGACCCAGAUCUUCAGGUUUCUGCGAUGCAGCACCAGACAGUGCUGGAACUGACAGAGACUGGGGUGGAGGCGGCUGCAGCCUCCGCCAUCUCUGUGGCCCGCACCCUGCUGGUCUUUGAAGUGCAGCAGCCCUUCCUCUUCGUGCUCUGGGACCAGCAGCACAAGUUCCCUGUCUUCAUGGGGCGAGUAUAUGACCCCAGGGCCUGAGACCUGCAGGAUCAGGUUAGGGCGAGCGCUACCUCUCCAGCCUCAGCUCUCAGUUGCAGCCCUGCUGCUGCCUGCCUGGACUUGGCCCCUGCCACCUCCUGCCUCAGGUGUCCGCUAUCCACCAAAAGGGCUCCCUGAGGGUCUGGGCAAGGGACCUGCUUCUAUUAGCCCUUCUCCAUGGCCCUGCCAUGCUCUCCAAACCACUUUUUGCAGCUUUCUCUAGUUCAAGUUCACCAGACUCUAUAAAUAAAACCUGACAGACCAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-607.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -637.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 322.90

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((..((((((((((((...))))..((((((((((.((((((...(((((((((((((.((((((((((....((((....(((.((..(((((((((((((((((....(((................))).....)))))))...((((.(((.(((((...(((.((((.(((.((((((...(((((((.....(..(((((((.((((...(((...)))..)))).)))))))..)....))).))))..))...(((.((........(((.............)))........)).)))..............................................................((.(((((((((...((((.......((((((.......))))))...))))..(((((((((..((((((((........)))))))).........(((((((((((((((((.....(((((((((((.....)))).)))))))((((((((((....)).))))))))(((.(((...))).))).)))))...))))).))...)))))......)))))))))...))))))))).))..............(((((((((....)))))).......))).)))).))).))))....((((((....))))))......((((((((((.(((.......((((.(((..........))).)))).....)))))))))))))....))))))))))).))))..))))))))))..))))).....))))....))).........))))))).)))))......))))))))..................).))))).)))).))))))((.(((((((..((((...((.(((.......))).))))))...((((((...(((((((((....(((((................))))).....))))))))).....))))))........((((...((........))....))))(((.((((...(((((..(......)..)))))))))))).)))))))))))))))))..........(((((((((((..((((....)))).............((((((((((((.(((...((((...)))).)))))))))))))))......(((((..((((((.........)))))).....)))))............(((..((((((..(((((((.(((............((((((((((((((((....))))))))))).))))).........(((((((((.((((((............(.((((((((((.(.((((((......)))))).)..)).)))))))).)(((((((((.......)))))))))..)))))))))))))))))))))))))...((((.((....)).))))......((((((((....))).)))))..(((((.((....)).)))))(((..((((....(((((((.((((...((((((.((((((((((((((.(((........)))))).))))).....(((((...)))))..(((((((((((.((((....)))).......(((((((.((((..............))))..))))))))))))))).))))))))).))))....))...))))...))))))).))))..))).....)))))).)))((((......)))).....))))))))))).............)).))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((({..((((((((((((...))))..((((((((((.(((((,.,,(((((((((((((.((((((((((....((((,,..((,,((..(((((((((((((((((,,.{(({...,,,...,,,....||}...,,)})))))...((((.(((.(((((...(((.((((.(((.((((((...(((((((.....(..(((((((.((((...{({...))}..)))).)))))))..}....)))},)))..,}...,,..........,.(((.............))}.......,||.||.......................|.......................................{,.(((((({((...((((.......((((((.......))))))...))))..(((((((((..((((((((........})))))))........,((((((((((((({{,,..,..(((((((((((.....)))).)))))))((((((((((....)),}))))))).,,.||}}}})))}))),,,,,,...,}||,..,...)),,,......)))))))))...))))))))).})...............,,((((((....))))))...,....)).)))).))).))))....,(((((....)))))|{{{,..,{((((((((.(((..,,...,(((.(((..........))).))))...,.)))))))))))))})}.})))))))))).))))..))))))))))..)))}),....))))....)))}.....,..})))))).))))}.....,))))))))...,..............}.))))).)))).)))))){(.((((((,,,{.....,{{((((,..,,.,||..{{|,|,,,.((((((...(((((((((....(((((,.............,.))))).....))))))))).....)))))).,,....,|{||...||}.}}...})),}..,,,,{{{.{(((...(((((..{......)..)))))))))))),))))))))))))))))}..........(((((((((((.,((((....)))).....,,......((((((((((((.(((...((((...)))).)))))))))))))))......(((((..((((({.{.....,.}))))).....)))))............(({..{{({{{..(((((({,(((............((((((((((((((((....)))))))))))},)))).........(((((((((.((((((,..,,....,.,{,((((((((({.{.((((((......)))))).}.,}).))))))))))(((((((((.......))))))))).,)))))))))))))))))))))))))...((((.((....)).))))..,,,.((((((((....))).))))),,|,,((,((....)).)))|,((({,,.{{....(((((((,((((...((((((.((((((((((((((.(((........)))))).))))),,{,.((({{...))})),}{((((((((((.((((....)))).......(((((((.((((..............))))..)))))))))))))))},)))))))).}))}....))...)))),,.))))))),))))}}).,.....)))))).))){(((......)))),,.}.))))))))))).............}).))))).....