Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000108.5
Sequence Length
3537 nt
GC Content
0.3794
CUUGGCGGAGCGGCGGAGGCGCCCAGCGGAGGUGAAAGUAUUGGCGGAAAGGAAAAUACAGCGGAAAAAUGCAGAGCUGGAGUCGUGUGUACUGCUCCUUGGCCAAGAGAGGCCAUUUCAAUCGAAUAUCUCAUGGCCUACAGGGACUUUCUGCAGUGCCUCUGAGAACUUACGCAGAUCAGCCGAUUGAUGCUGAUGUAACAGUUAUAGGUUCUGGUCCUGGAGGAUAUGUUGCUGCUAUUAAAGCUGCCCAGUUAGGCUUCAAGACAGUCUGCAUUGAGAAAAAUGAAACACUUGGUGGAACAUGCUUGAAUGUUGGUUGUAUUCCUUCUAAGGCUUUAUUGAACAACUCUCAUUAUUACCAUAUGGCCCAUGGAAAAGAUUUUGCAUCUAGAGGAAUUGAAAUGUCCGAAGUUCGCUUGAAUUUAGACAAGAUGAUGGAGCAGAAGAGUACUGCAGUAAAAGCUUUAACAGGUGGAAUUGCCCACUUAUUCAAACAGAAUAAGGUUGUUCAUGUCAAUGGAUAUGGAAAGAUAACUGGCAAAAAUCAAGUCACUGCUACGAAAGCUGAUGGCGGCACUCAGGUUAUUGAUACAAAGAACAUUCUUAUAGCCACGGGUUCAGAAGUUACUCCUUUUCCUGGAAUCACGAUAGAUGAAGAUACAAUAGUGUCAUCUACAGGUGCUUUAUCUUUAAAAAAAGUUCCAGAAAAGAUGGUUGUUAUUGGUGCAGGAGUAAUAGGUGUAGAAUUGGGUUCAGUUUGGCAAAGACUUGGUGCAGAUGUGACAGCAGUUGAAUUUUUAGGUCAUGUAGGUGGAGUUGGAAUUGAUAUGGAGAUAUCUAAAAACUUUCAACGCAUCCUUCAAAAACAGGGGUUUAAAUUUAAAUUGAAUACAAAGGUUACUGGUGCUACCAAGAAGUCAGAUGGAAAAAUUGAUGUUUCUAUUGAAGCUGCUUCUGGUGGUAAAGCUGAAGUUAUCACUUGUGAUGUACUCUUGGUUUGCAUUGGCCGACGACCCUUUACUAAGAAUUUGGGACUAGAAGAGCUGGGAAUUGAACUAGAUCCCAGAGGUAGAAUUCCAGUCAAUACCAGAUUUCAAACUAAAAUUCCAAAUAUCUAUGCCAUUGGUGAUGUAGUUGCUGGUCCAAUGCUGGCUCACAAAGCAGAGGAUGAAGGCAUUAUCUGUGUUGAAGGAAUGGCUGGUGGUGCUGUGCACAUUGACUACAAUUGUGUGCCAUCAGUGAUUUACACACACCCUGAAGUUGCUUGGGUUGGCAAAUCAGAAGAGCAGUUGAAAGAAGAGGGUAUUGAGUACAAAGUUGGGAAAUUCCCAUUUGCUGCUAACAGCAGAGCUAAGACAAAUGCUGACACAGAUGGCAUGGUGAAGAUCCUUGGGCAGAAAUCGACAGACAGAGUACUGGGAGCACAUAUUCUUGGACCAGGUGCUGGAGAAAUGGUAAAUGAAGCUGCUCUUGCUUUGGAAUAUGGAGCAUCCUGUGAAGAUAUAGCUAGAGUCUGUCAUGCACAUCCGACCUUAUCAGAAGCUUUUAGAGAAGCAAAUCUUGCUGCGUCAUUUGGCAAAUCAAUCAACUUUUGAAUUAGAAGAUUAUAUAUAUUUUUUUCUGAAAUUUCCUGGGAGCUUUUGUAGAAGUCACAUUCCUGAACAGGAUAUUCUCACAGCUCCAAGAAUUUCUAGGACUGAAUUAUGAAACUUUUGGAAGGUAUUUAAUAGGUUUGGACAAAAUGGAAUACUCUUAUAUCUAUAUUUUACAUAAAUUUAGUAUUUUGUUUCAGUGCACUAAUGUGUAAGACAAAAAGCUACUUAUUGUAGCAUCCUGGAAUAUCUCCGUCAACUCAUAUUUUCAUGCUGUUCAUGAAAGAUUCAAUGCCCCUGAAUUUAAAUAGCUUUUUUCUCUGAUACAGAAAAGUUGAAUUUUACAUGGCUGGAGCUAGAAUUUGAUAUGUGAACAGUUGUGUUUGAAGCACAGUGAUCAAGUUAUUUUUAAUUUGGUUUUCACAUUGGAAACAAGUCAGUCAUUCAGAUAUGAUUCAAAUGUCUAUAAACCGAACUGAUGUAAGUAAACGGUCUCUCACUUGUUUUAUUUAACCUCUAAAUUCUUUCAUUUUAGGGGUAGCAUUUGUGUUGAAGAGGUUUUAAAGCUUCCAUUGUUGUCUGCAACUCUGAAGGGUAAUUAUAUAGUUACCCAAAUUAAGAGAGUCUAUUUACGGAACUCAAAUACGUGGGCAUUCAAAUGUAUUACAGUGGGGAAUGAAGAUACUGAAAUAAACGUCUUAAAUAUUCAUUUACUGGUUAUCAUGAGUACGUGUUGAGAUGGUCAUAGUUUUUUUUAUGACUACUUCUAGUGUAUAUUCUAAUUUCUUUUCUAGGCCUGAAUGUAUCUUUAUUUUCAUGUUAUAGGACAAUAUUAAGGCAUUUUAAAGGUCAUCAUCCUUUCAUCUAUUUUAGAUACACCUACUAAAUGUUUAAUAUAUACUUUUGGAGAAGUACAACAUAAGGGAGUCUUUAAUCUGUGUUUUCCUUGGCUGGGUUAAUGACUGUUUAUUUAAAGAGUGUUGUAAAAUUGGAUGUGUGGUGUUUAAAAUGGCCAUGUCCUGAGGAAACUUAAGUAACAAAGUACUAAAUGCUAAGUAGGCUUUUGCAUAUUGUAACUAAAUUUAAGAAUAAUUCAGAUUAAGUAGUUCUGAAAUUUGGUAUAGAUAGCAUAGAUUGUCUCAUGCUCAUGAGUGACAUAAUGACCCUGGAUUCUGUUACAUACUUCUAAAGAAAAUUGAUUGUUGUCUUAGGAGGCAGUUAACUUGGCUGAACACCAACUCCACACUCUGUCUUGUUUGUAGGUGGCAGCAGCUGAAAUCUCUUCUCAGUUGUUUUAGCUUUAGCUAUGCUGCUGGAAGUCUUUCCCAUGCAAGUGUGUAGUUCAGGGGUCAACCAGAGUUUGGGCAGAAGGAAGUCUGCCCCUUCUGUGCCUCCUGUUUUUUGGGGGUUUCCCCUUUAUGUUCCAGCUGUUGUGGUUGCCCCAUAUUCUGCCUUCUGAUCCUUAACCAAUAAAACUUGGCUUUUGUUUCCCCCUCAAGUGAGAACCCGUUAAAAAUGAGACAUUGAGCCAGUGCUGUUCACUUUUUAAGUGCCAACUUCCCUCUACUUUCCACUUGUUUAUAGUUGUUUCCAGUGCCUUUAGUUUUUUCUAAAAUAUAUUUGUUCAGAGUUUGCAGUUGCUAUCAGCAGGAGGGUUGGUCUGAUAUCUGUGUGCUACUUUGCCAUUAUUGGAAGUGAACUCUGCAUCUUUUUAAAAAUUUGAAAUCCCGGUAUCAUGUGAAGUGCUGUUUAUGUAAAUCUCAACAUAUCCCUUACUCAGGGAAAAAAAAGUUUUUAGUUAGGGAAUAGUGAAAUAUAAUUUAAUAUGGAAUUCUAGCUGUAGAGUUAAAUCCAUCUUUAAGUGUUUACAUUCAGUAUGAGAAUGCAAAUUUAUCUGUAUGGGGAAUAAAGUCCUAGGAAUAAAACAAGUUUUAAGUGUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-947.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1018.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 868.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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