Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000142.5
Sequence Length
4301 nt
GC Content
0.6201
AGUGCGCGGUGGCGGCGGCGUCGCGGGCAGCUGGCGCCGCGCGGUCCUGCUCUGCCGGUCGCACGGACGCACCGGCGGGCCGCCGGCCGGAGGGACGGGGCGGGAGCUGGGCCCGCGGACAGCGAGCCGGAGCGGGAGCCGCGCGUAGCGAGCCGGGCUCCGGCGCUCGCCAGUCUCCCGAGCGGCGCCCGCCUCCCGCCGGUGCCCGCGCCGGGCCGUGGGGGGCAGCAUGCCCGCGCGCGCUGCCUGAGGACGCCGCGGCCCCCGCCCCCGCCAUGGGCGCCCCUGCCUGCGCCCUCGCGCUCUGCGUGGCCGUGGCCAUCGUGGCCGGCGCCUCCUCGGAGUCCUUGGGGACGGAGCAGCGCGUCGUGGGGCGAGCGGCAGAAGUCCCGGGCCCAGAGCCCGGCCAGCAGGAGCAGUUGGUCUUCGGCAGCGGGGAUGCUGUGGAGCUGAGCUGUCCCCCGCCCGGGGGUGGUCCCAUGGGGCCCACUGUCUGGGUCAAGGAUGGCACAGGGCUGGUGCCCUCGGAGCGUGUCCUGGUGGGGCCCCAGCGGCUGCAGGUGCUGAAUGCCUCCCACGAGGACUCCGGGGCCUACAGCUGCCGGCAGCGGCUCACGCAGCGCGUACUGUGCCACUUCAGUGUGCGGGUGACAGACGCUCCAUCCUCGGGAGAUGACGAAGACGGGGAGGACGAGGCUGAGGACACAGGUGUGGACACAGGGGCCCCUUACUGGACACGGCCCGAGCGGAUGGACAAGAAGCUGCUGGCCGUGCCGGCCGCCAACACCGUCCGCUUCCGCUGCCCAGCCGCUGGCAACCCCACUCCCUCCAUCUCCUGGCUGAAGAACGGCAGGGAGUUCCGCGGCGAGCACCGCAUUGGAGGCAUCAAGCUGCGGCAUCAGCAGUGGAGCCUGGUCAUGGAAAGCGUGGUGCCCUCGGACCGCGGCAACUACACCUGCGUCGUGGAGAACAAGUUUGGCAGCAUCCGGCAGACGUACACGCUGGACGUGCUGGAGCGCUCCCCGCACCGGCCCAUCCUGCAGGCGGGGCUGCCGGCCAACCAGACGGCGGUGCUGGGCAGCGACGUGGAGUUCCACUGCAAGGUGUACAGUGACGCACAGCCCCACAUCCAGUGGCUCAAGCACGUGGAGGUGAAUGGCAGCAAGGUGGGCCCGGACGGCACACCCUACGUUACCGUGCUCAAGACGGCGGGCGCUAACACCACCGACAAGGAGCUAGAGGUUCUCUCCUUGCACAACGUCACCUUUGAGGACGCCGGGGAGUACACCUGCCUGGCGGGCAAUUCUAUUGGGUUUUCUCAUCACUCUGCGUGGCUGGUGGUGCUGCCAGCCGAGGAGGAGCUGGUGGAGGCUGACGAGGCGGGCAGUGUGUAUGCAGGCAUCCUCAGCUACGGGGUGGGCUUCUUCCUGUUCAUCCUGGUGGUGGCGGCUGUGACGCUCUGCCGCCUGCGCAGCCCCCCCAAGAAAGGCCUGGGCUCCCCCACCGUGCACAAGAUCUCCCGCUUCCCGCUCAAGCGACAGGUGUCCCUGGAGUCCAACGCGUCCAUGAGCUCCAACACACCACUGGUGCGCAUCGCAAGGCUGUCCUCAGGGGAGGGCCCCACGCUGGCCAAUGUCUCCGAGCUCGAGCUGCCUGCCGACCCCAAAUGGGAGCUGUCUCGGGCCCGGCUGACCCUGGGCAAGCCCCUUGGGGAGGGCUGCUUCGGCCAGGUGGUCAUGGCGGAGGCCAUCGGCAUUGACAAGGACCGGGCCGCCAAGCCUGUCACCGUAGCCGUGAAGAUGCUGAAAGACGAUGCCACUGACAAGGACCUGUCGGACCUGGUGUCUGAGAUGGAGAUGAUGAAGAUGAUCGGGAAACACAAAAACAUCAUCAACCUGCUGGGCGCCUGCACGCAGGGCGGGCCCCUGUACGUGCUGGUGGAGUACGCGGCCAAGGGUAACCUGCGGGAGUUUCUGCGGGCGCGGCGGCCCCCGGGCCUGGACUACUCCUUCGACACCUGCAAGCCGCCCGAGGAGCAGCUCACCUUCAAGGACCUGGUGUCCUGUGCCUACCAGGUGGCCCGGGGCAUGGAGUACUUGGCCUCCCAGAAGUGCAUCCACAGGGACCUGGCUGCCCGCAAUGUGCUGGUGACCGAGGACAACGUGAUGAAGAUCGCAGACUUCGGGCUGGCCCGGGACGUGCACAACCUCGACUACUACAAGAAGACGACCAACGGCCGGCUGCCCGUGAAGUGGAUGGCGCCUGAGGCCUUGUUUGACCGAGUCUACACUCACCAGAGUGACGUCUGGUCCUUUGGGGUCCUGCUCUGGGAGAUCUUCACGCUGGGGGGCUCCCCGUACCCCGGCAUCCCUGUGGAGGAGCUCUUCAAGCUGCUGAAGGAGGGCCACCGCAUGGACAAGCCCGCCAACUGCACACACGACCUGUACAUGAUCAUGCGGGAGUGCUGGCAUGCCGCGCCCUCCCAGAGGCCCACCUUCAAGCAGCUGGUGGAGGACCUGGACCGUGUCCUUACCGUGACGUCCACCGACGAGUACCUGGACCUGUCGGCGCCUUUCGAGCAGUACUCCCCGGGUGGCCAGGACACCCCCAGCUCCAGCUCCUCAGGGGACGACUCCGUGUUUGCCCACGACCUGCUGCCCCCGGCCCCACCCAGCAGUGGGGGCUCGCGGACGUGAAGGGCCACUGGUCCCCAACAAUGUGAGGGGUCCCUAGCAGCCCACCCUGCUGCUGGUGCACAGCCACUCCCCGGCAUGAGACUCAGUGCAGAUGGAGAGACAGCUACACAGAGCUUUGGUCUGUGUGUGUGUGUGUGCGUGUGUGUGUGUGUGUGUGCACAUCCGCGUGUGCCUGUGUGCGUGCGCAUCUUGCCUCCAGGUGCAGAGGUACCCUGGGUGUCCCCGCUGCUGUGCAACGGUCUCCUGACUGGUGCUGCAGCACCGAGGGGCCUUUGUUCUGGGGGGACCCAGUGCAGAAUGUAAGUGGGCCCACCCGGUGGGACCCCCGUGGGGCAGGGAGCUGGGCCCGACAUGGCUCCGGCCUCUGCCUUUGCACCACGGGACAUCACAGGGUGGGCCUCGGCCCCUCCCACACCCAAAGCUGAGCCUGCAGGGAAGCCCCACAUGUCCAGCACCUUGUGCCUGGGGUGUUAGUGGCACCGCCUCCCCACCUCCAGGCUUUCCCACUUCCCACCCUGCCCCUCAGAGACUGAAAUUACGGGUACCUGAAGAUGGGAGCCUUUACCUUUUAUGCAAAAGGUUUAUUCCGGAAACUAGUGUACAUUUCUAUAAAUAGAUGCUGUGUAUAUGGUAUAUAUACAUAUAUAUAUAUAACAUAUAUGGAAGAGGAAAAGGCUGGUACAACGGAGGCCUGCGACCCUGGGGGCACAGGAGGCAGGCAUGGCCCUGGGCGGGGCGUGGGGGGGCGUGGAGGGAGGCCCCAGGGGGUCUCACCCAUGCAAGCAGAGGACCAGGGCCUUUUCUGGCACCGCAGUUUUGUUUUAAAACUGGACCUGUAUAUUUGUAAAGCUAUUUAUGGGCCCCUGGCACUCUUGUUCCCACACCCCAACACUUCCAGCAUUUAGCUGGCCACAUGGCGGAGAGUUUUAAUUUUUAACUUAUUGACAACCGAGAAGGUUUAUCCCGCCGAUAGAGGGACGGCCAAGAAUGUACGUCCAGCCUGCCCCGGAGCUGGAGGAUCCCCUCCAAGCCUAAAAGGUUGUUAAUAGUUGGAGGUGAUUCCAGUGAAGAUAUUUUAUUUCCUUUGUCCUUUUUCAGGAGAAUUAGAUUUCUAUAGGAUUUUUCUUUAGGAGAUUUAUUUUUUGGACUUCAAAGCAAGCUGGUAUUUUCAUACAAAUUCUUCUAAUUGCUGUGUGUCCCAGGCAGGGAGACGGUUUCCAGGGAGGGGCCGGCCCUGUGUGCAGGUUCCGAUGUUAUUAGAUGUUACAAGUUUAUAUAUAUCUAUAUAUAUAAUUUAUUGAGUUUUUACAAGAUGUAUUUGUUGUAGACUUAACACUUCUUACGCAAUGCUUCUAGAGUUUUAUAGCCUGGACUGCUACCUUUCAAAGCUUGGAGGGAAGCCGUGAAUUCAGUUGGUUCGUUCUGUACUGUUACUGGGCCCUGAGUCUGGGCAGCUGUCCCUUGCUUGCCUGCAGGGCCAUGGCUCAGGGUGGUCUCUUCUUGGGGCCCAGUGCAUGGUGGCCAGAGGUGUCACCCAAACCGGCAGGUGCGAUUUUGUUAACCCAGCGACGAACUUUCCGAAAAAUAAAGACACCUGGUUGCUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1955.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2030.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 1466.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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