Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000163.5
Sequence Length
4899 nt
GC Content
0.4256
AGUUGAGAGUGACACGCACCAACUCCAGCUCCUCGCCGGGAAGACUUCAUCCCAGCAACUCGGAAUGCUUGGCCCGGGCGGCACUCGGCCUCUCCGCAGCAGUUCUCGAACUGGCCUCCUUGAACGUCCGCUUCGCCUUCGCUUCUGCAACCUGGAUCUGGGGGACUGCGGGCCAGGCGCGGCGUGACCCCUGGUGAACGGUGGCCGCCUUUUCCCACCCCUGCCCUCCCAUCCUCCCUUCCCGUUUCACCCCGCCCCCUCUCUCCUCCCCAAGCCUGACAGCCCGCGAGCUGCCAAGCAGGGCGCAGCCAUGGGAAGAGGAGGAGGGCUAGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCAGCAGCUGCUACAGUGGCGGUGGCGGCGGCGGCUGCUGCUGAGCCCGGGCGGCGGCGGGGACCCCGGGCUGGGGCCACGCGGGCCGGAGGCCCCGGCACCAUUGGCCCCAGCGCAGACGCGAACCCGCGCUCUCUGAUCAGAGGCGAAGCUCGGAGGUCCUACAGGUAUGGAUCUCUGGCAGCUGCUGUUGACCUUGGCACUGGCAGGAUCAAGUGAUGCUUUUUCUGGAAGUGAGGCCACAGCAGCUAUCCUUAGCAGAGCACCCUGGAGUCUGCAAAGUGUUAAUCCAGGCCUAAAGACAAAUUCUUCUAAGGAGCCUAAAUUCACCAAGUGCCGUUCACCUGAGCGAGAGACUUUUUCAUGCCACUGGACAGAUGAGGUUCAUCAUGGUACAAAGAACCUAGGACCCAUACAGCUGUUCUAUACCAGAAGGAACACUCAAGAAUGGACUCAAGAAUGGAAAGAAUGCCCUGAUUAUGUUUCUGCUGGGGAAAACAGCUGUUACUUUAAUUCAUCGUUUACCUCCAUCUGGAUACCUUAUUGUAUCAAGCUAACUAGCAAUGGUGGUACAGUGGAUGAAAAGUGUUUCUCUGUUGAUGAAAUAGUGCAACCAGAUCCACCCAUUGCCCUCAACUGGACUUUACUGAACGUCAGUUUAACUGGGAUUCAUGCAGAUAUCCAAGUGAGAUGGGAAGCACCACGCAAUGCAGAUAUUCAGAAAGGAUGGAUGGUUCUGGAGUAUGAACUUCAAUACAAAGAAGUAAAUGAAACUAAAUGGAAAAUGAUGGACCCUAUAUUGACAACAUCAGUUCCAGUGUACUCAUUGAAAGUGGAUAAGGAAUAUGAAGUGCGUGUGAGAUCCAAACAACGAAACUCUGGAAAUUAUGGCGAGUUCAGUGAGGUGCUCUAUGUAACACUUCCUCAGAUGAGCCAAUUUACAUGUGAAGAAGAUUUCUACUUUCCAUGGCUCUUAAUUAUUAUCUUUGGAAUAUUUGGGCUAACAGUGAUGCUAUUUGUAUUCUUAUUUUCUAAACAGCAAAGGAUUAAAAUGCUGAUUCUGCCCCCAGUUCCAGUUCCAAAGAUUAAAGGAAUCGAUCCAGAUCUCCUCAAGGAAGGAAAAUUAGAGGAGGUGAACACAAUCUUAGCCAUUCAUGAUAGCUAUAAACCCGAAUUCCACAGUGAUGACUCUUGGGUUGAAUUUAUUGAGCUAGAUAUUGAUGAGCCAGAUGAAAAGACUGAGGAAUCAGACACAGACAGACUUCUAAGCAGUGACCAUGAGAAAUCACAUAGUAACCUAGGGGUGAAGGAUGGCGACUCUGGACGUACCAGCUGUUGUGAACCUGACAUUCUGGAGACUGAUUUCAAUGCCAAUGACAUACAUGAGGGUACCUCAGAGGUUGCUCAGCCACAGAGGUUAAAAGGGGAAGCAGAUCUCUUAUGCCUUGACCAGAAGAAUCAAAAUAACUCACCUUAUCAUGAUGCUUGCCCUGCUACUCAGCAGCCCAGUGUUAUCCAAGCAGAGAAAAACAAACCACAACCACUUCCUACUGAAGGAGCUGAGUCAACUCACCAAGCUGCCCAUAUUCAGCUAAGCAAUCCAAGUUCACUGUCAAACAUCGACUUUUAUGCCCAGGUGAGCGACAUUACACCAGCAGGUAGUGUGGUCCUUUCCCCGGGCCAAAAGAAUAAGGCAGGGAUGUCCCAAUGUGACAUGCACCCGGAAAUGGUCUCACUCUGCCAAGAAAACUUCCUUAUGGACAAUGCCUACUUCUGUGAGGCAGAUGCCAAAAAGUGCAUCCCUGUGGCUCCUCACAUCAAGGUUGAAUCACACAUACAGCCAAGCUUAAACCAAGAGGACAUUUACAUCACCACAGAAAGCCUUACCACUGCUGCUGGGAGGCCUGGGACAGGAGAACAUGUUCCAGGUUCUGAGAUGCCUGUCCCAGACUAUACCUCCAUUCAUAUAGUACAGUCCCCACAGGGCCUCAUACUCAAUGCGACUGCCUUGCCCUUGCCUGACAAAGAGUUUCUCUCAUCAUGUGGCUAUGUGAGCACAGACCAACUGAACAAAAUCAUGCCUUAGCCUUUCUUUGGUUUCCCAAGAGCUACGUAUUUAAUAGCAAAGAAUUGACUGGGGCAAUAACGUUUAAGCCAAAACAAUGUUUAAACCUUUUUUGGGGGAGUGACAGGAUGGGGUAUGGAUUCUAAAAUGCCUUUUCCCAAAAUGUUGAAAUAUGAUGUUAAAAAAAUAAGAAGAAUGCUUAAUCAGAUAGAUAUUCCUAUUGUGCAAUGUAAAUAUUUUAAAGAAUUGUGUCAGACUGUUUAGUAGCAGUGAUUGUCUUAAUAUUGUGGGUGUUAAUUUUUGAUACUAAGCAUUGAAUGGCUAUGUUUUUAAUGUAUAGUAAAUCACGCUUUUUGAAAAAGCGAAAAAAUCAGGUGGCUUUUGCGGUUCAGGAAAAUUGAAUGCAAACCAUAGCACAGGCUAAUUUUUUGUUGUUUCUUAAAUAAGAAACUUUUUUAUUUAAAAAACUAAAAACUAGAGGUGAGAAAUUUAAACUAUAAGCAAGAAGGCAAAAAUAGUUUGGAUAUGUAAAACAUUUAUUUUGACAUAAAGUUGAUAAAGAUUUUUUAAUAAUUUAGACUUCAAGCAUGGCUAUUUUAUAUUACACUACACACUGUGUACUGCAGUUGGUAUGACCCCUCUAAGGAGUGUAGCAACUACAGUCUAAAGCUGGUUUAAUGUUUUGGCCAAUGCACCUAAAGAAAAACAAACUCGUUUUUUACAAAGCCCUUUUAUACCUCCCCAGACUCCUUCAACAAUUCUAAAAUGAUUGUAGUAAUCUGCAUUAUUGGAAUAUAAUUGUUUUAUCUGAAUUUUUAAACAAGUAUUUGUUAAUUUAGAAAACUUUAAAGCGUUUGCACAGAUCAACUUACCAGGCACCAAAAGAAGUAAAAGCAAAAAAGAAAACCUUUCUUCACCAAAUCUUGGUUGAUGCCAAAAAAAAAUACAUGCUAAGAGAAGUAGAAAUCAUAGCUGGUUCACACUGACCAAGAUACUUAAGUGCUGCAAUUGCACGCGGAGUGAGUUUUUUAGUGCGUGCAGAUGGUGAGAGAUAAGAUCUAUAGCCUCUGCAGCGGAAUCUGUUCACACCCAACUUGGUUUUGCUACAUAAUUAUCCAGGAAGGGAAUAAGGUACAAGAAGCAUUUUGUAAGUUGAAGCAAAUCGAAUGAAAUUAACUGGGUAAUGAAACAAAGAGUUCAAGAAAUAAGUUUUUGUUUCACAGCCUAUAACCAGACACAUACUCAUUUUUCAUGAUAAUGAACAGAACAUAGACAGAAGAAACAAGGUUUUCAGUCCCCACAGAUAACUGAAAAUUAUUUAAACCGCUAAAAGAAACUUUCUUUCUCACUAAAUCUUUUAUAGGAUUUAUUUAAAAUAGCAAAAGAAGAAGUUUCAUCAUUUUUUACUUCCUCUCUGAGUGGACUGGCCUCAAAGCAAGCAUUCAGAAGAAAAAGAAGCAACCUCAGUAAUUUAGAAAUCAUUUUGCAAUCCCUUAAUAUCCUAAACAUCAUUCAUUUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGAGACAGAGUCUCGCUCUGUCGCCAGGCUAGAGUGCGGUGGCGCGAUCUUGACUCACUGCAAUCUCCACCUCCCACAGGUUCAGGCGAUUCCCGUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACUACAGGCACGCACCACCAUGCCAGGCUAAUUUUUUUGUAUUUUAGCAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCACCCGACUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUAAGCCACCGUGCCCAGCCCUAAACAUCAUUCUUGAGAGCAUUGGGAUAUCUCCUGAAAAGGUUUAUGAAAAAGAAGAAUCUCAUCUCAGUGAAGAAUACUUCUCAUUUUUUAAAAAAGCUUAAAACUUUGAAGUUAGCUUUAACUUAAAUAGUAUUUCCCAUUUAUCGCAGACCUUUUUUAGGAAGCAAGCUUAAUGGCUGAUAAUUUUAAAUUCUCUCUCUUGCAGGAAGGACUAUGAAAAGCUAGAAUUGAGUGUUUAAAGUUCAACAUGUUAUUUGUAAUAGAUGUUUGAUAGAUUUUCUGCUACUUUGCUGCUAUGGUUUUCUCCAAGAGCUACAUAAUUUAGUUUCAUAUAAAGUAUCAUCAGUGUAGAACCUAAUUCAAUUCAAAGCUGUGUGUUUGGAAGACUAUCUUACUAUUUCACAACAGCCUGACAACAUUUCUAUAGCCAAAAAUAGCUAAAUACCUCAAUCAGUCUCAGAAUGUCAUUUUGGUACUUUGGUGGCCACAUAAGCCAUUAUUCACUAGUAUGACUAGUUGUGUCUGGCAGUUUAUAUUUAACUCUCUUUAUGUCUGUGGAUUUUUUCCUUCAAAGUUUAAUAAAUUUAUUUUCUUGGAUUCCUGAUAGUGUGCUUCUGUUAUCAAACACCAACAUAAAAAUGAUCUAAACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1390.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1483.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 1334.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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