Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000224.3

Sequence Length

1413 nt

GC Content

0.5824

GCCGCCACCGUCGUCCGCAAAGCCUGAGUCCUGUCCUUUCUCUCUCCCCGGACAGCAUGAGCUUCACCACUCGCUCCACCUUCUCCACCAACUACCGGUCCCUGGGCUCUGUCCAGGCGCCCAGCUACGGCGCCCGGCCGGUCAGCAGCGCGGCCAGCGUCUAUGCAGGCGCUGGGGGCUCUGGUUCCCGGAUCUCCGUGUCCCGCUCCACCAGCUUCAGGGGCGGCAUGGGGUCCGGGGGCCUGGCCACCGGGAUAGCCGGGGGUCUGGCAGGAAUGGGAGGCAUCCAGAACGAGAAGGAGACCAUGCAAAGCCUGAACGACCGCCUGGCCUCUUACCUGGACAGAGUGAGGAGCCUGGAGACCGAGAACCGGAGGCUGGAGAGCAAAAUCCGGGAGCACUUGGAGAAGAAGGGACCCCAGGUCAGAGACUGGAGCCAUUACUUCAAGAUCAUCGAGGACCUGAGGGCUCAGAUCUUCGCAAAUACUGUGGACAAUGCCCGCAUCGUUCUGCAGAUUGACAAUGCCCGUCUUGCUGCUGAUGACUUUAGAGUCAAGUAUGAGACAGAGCUGGCCAUGCGCCAGUCUGUGGAGAACGACAUCCAUGGGCUCCGCAAGGUCAUUGAUGACACCAAUAUCACACGACUGCAGCUGGAGACAGAGAUCGAGGCUCUCAAGGAGGAGCUGCUCUUCAUGAAGAAGAACCACGAAGAGGAAGUAAAAGGCCUACAAGCCCAGAUUGCCAGCUCUGGGUUGACCGUGGAGGUAGAUGCCCCCAAAUCUCAGGACCUCGCCAAGAUCAUGGCAGACAUCCGGGCCCAAUAUGACGAGCUGGCUCGGAAGAACCGAGAGGAGCUAGACAAGUACUGGUCUCAGCAGAUUGAGGAGAGCACCACAGUGGUCACCACACAGUCUGCUGAGGUUGGAGCUGCUGAGACGACGCUCACAGAGCUGAGACGUACAGUCCAGUCCUUGGAGAUCGACCUGGACUCCAUGAGAAAUCUGAAGGCCAGCUUGGAGAACAGCCUGAGGGAGGUGGAGGCCCGCUACGCCCUACAGAUGGAGCAGCUCAACGGGAUCCUGCUGCACCUUGAGUCAGAGCUGGCACAGACCCGGGCAGAGGGACAGCGCCAGGCCCAGGAGUAUGAGGCCCUGCUGAACAUCAAGGUCAAGCUGGAGGCUGAGAUCGCCACCUACCGCCGCCUGCUGGAAGAUGGCGAGGACUUUAAUCUUGGUGAUGCCUUGGACAGCAGCAACUCCAUGCAAACCAUCCAAAAGACCACCACCCGCCGGAUAGUGGAUGGCAAAGUGGUGUCUGAGACCAAUGACACCAAAGUUCUGAGGCAUUAAGCCAGCAGAAGCAGGGUACCCUUUGGGGAGCAGGAGGCCAAUAAAAAGUUCAGAGUUCAUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-561.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -582.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 333.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((..((.(.((((((....(((((((((.((((((.........((((...))))((((((((((((((((.......))))(((((..(((((((((.((..(((((((((....)))))))))..)).)))(((((((((((.(((((..(((((((..........))))))))))))))))))))))))))))).)))))...((((((((((...((((..((.(.((..(((..........)))..)).).))...))))...)))).))))))......))))))))))))))))))..)))))..)))).....)))))).)...))....)))))).).....)))).)))))))))..((((((.((((((((((......)))).)).)).))...)))))))))))))))..))).........)))))))...(((((.(((...((((((.(((.....(((.((((((.((((..(((((....))))))))))))))).).))(((((.((((..((((((((((........)))))))))).)))).))))).(((((.......)))))..)))))))))(((....))).))))).)))((((...)))).(((.((((((.((.........)).))))))..)))............((((((((........))))))))))).)))).)))...((((((((((.(((.(((..((((((......)))).))..)))))).(((.(((....((((..(((((.....)))))...))))......))).))).((((((((((((.((.((.(((....))).)).))...))))))))))))((((.(((((((....(((..(((..((.((((.(((.....))))))).))..))).)))..(((..(((((.(......(((.....)))).)))))..))).(((((((.(((((....)))))...)))).)))....)))))))))))((((((((((((.(((((((.....(((.(((.((.((((((((....((......))..)))).)).)).))..)))..))).....))))))))).(((((((((....((((((((((..(((((.((......)).))))))))..........))))))))))))...)))).(((......)))...(((((((.....((..........))....))))))).....(((((((..........)))))))...(((((.(((.....)))..)))))))))))).)))))))))).))).....(((((................))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((((.((((((((({(((.(((((((((((((((((((((((((((((..((.{.((((((....(((((((((.((((((,........((((,..|}}}((((((((((((((((.......))))(((((,,(((({{{{|.{|,.(((((((((....))))))))).,||,}}|((((((((({(,(((((..(((((((..........))))))))))))))))))))))))})))).)))))...((((((((((...((((..{(.(.((..(((..........)))..)).).)}...))))...)))).))))))......))))))))))))})))))..)))))..))))....,)))))).).,.))....)))))).}.....))))}}))))))))..((((((.((((((((((......))))},).)).))...)))))))))))))))..))}.||......|||||}}...{,|||}|{,,,{((((((.{{(.....{({.((((((.((((..(((((....)))))))))}))))).|,||(((((.((((..((((((((((........)))))))))).)))).)|||}.{({({.......,}))}..,))))}}}}(({.,..}}}.|,}}|.||{(({{...,.}}}|||.((((((.((.........)).))))))...||....{{|.,...{|||{{{{..,,,,,,))))))))))).)))).)))...((((((((({,{{{.({,.,({((((......)))).},..|||{{{{(,..,......|,,,})|||||}....}}}}),,,.{||{{.....,.})))}((((((((((((.((.((.(((....))).)).))...))))))))))))((({{(((((((,.{.{,{..(((.,{{.((((.({(.....))))))),}}|||||.||}..{{{},|||||.|,,....|||..,,,}}}}})}}}}..}}}.(((((((.(((((....)))))...)))).)))....)))))))))))(((((((((((,.((((((({{{{{{({.(((.((.((((((((...{({......))..)))).)).)).))..)))..,))},.}.))))))),..(((({.{(({{{{{((((((.((.((((,....},.)).)).)))))),,.......}}}}|||((((((((((({.{{,{{{......)))...(((((((.....((..........))....))))))).....(((((((..........)))))))..}})))))))))))..,))))),}.)))))))).)))))))))).))}.....(((({.............,,.})))).