Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000270.4

Sequence Length

1477 nt

GC Content

0.5010

AACUGUGCGAACCAGACCCGGCAGCCUUGCUCAGUUCAGCAUAGCGGAGCGGAUCCGAUCGGAUCGGAGCGGAUCGGAGCACACCGGAGCAGGCUCAUCGAGAAGGCGUCUGCGAGACCAUGGAGAACGGAUACACCUAUGAAGAUUAUAAGAACACUGCAGAAUGGCUUCUGUCUCACACUAAGCACCGACCUCAAGUUGCAAUAAUCUGUGGUUCUGGAUUAGGAGGUCUGACUGAUAAAUUAACUCAGGCCCAGAUCUUUGACUACGGUGAAAUCCCCAACUUUCCCCGAAGUACAGUGCCAGGUCAUGCUGGCCGACUGGUGUUUGGGUUCCUGAAUGGCAGGGCCUGUGUGAUGAUGCAGGGCAGGUUCCACAUGUAUGAAGGGUACCCACUCUGGAAGGUGACAUUCCCAGUGAGGGUUUUCCACCUUCUGGGUGUGGACACCCUGGUAGUCACCAAUGCAGCAGGAGGGCUGAACCCCAAGUUUGAGGUUGGAGAUAUCAUGCUGAUCCGUGACCAUAUCAACCUACCUGGUUUCAGUGGUCAGAACCCUCUCAGAGGGCCCAAUGAUGAAAGGUUUGGAGAUCGUUUCCCUGCCAUGUCUGAUGCCUACGACCGGACUAUGAGGCAGAGGGCUCUCAGUACCUGGAAACAAAUGGGGGAGCAACGUGAGCUACAGGAAGGCACCUAUGUGAUGGUGGCAGGCCCCAGCUUUGAGACUGUGGCAGAAUGUCGUGUGCUGCAGAAGCUGGGAGCAGACGCUGUUGGCAUGAGUACAGUACCAGAAGUUAUCGUUGCACGGCACUGUGGACUUCGAGUCUUUGGCUUCUCACUCAUCACUAACAAGGUCAUCAUGGAUUAUGAAAGCCUGGAGAAGGCCAACCAUGAAGAAGUCUUAGCAGCUGGCAAACAAGCUGCACAGAAAUUGGAACAGUUUGUCUCCAUUCUUAUGGCCAGCAUUCCACUCCCUGACAAAGCCAGUUGACCUGCCUUGGAGUCGUCUGGCAUCUCCCACACAAGACCCAAGUAGCUGCUACCUUCUUUGGCCCCUUGCUGGAGUCAUGUGCCUCUGUCCUUAGGUUGUAGCAGAAAGGAAAAGAUUCCUGUCCUUCACCUUUCCCACUUUCUUCUACCAGACCCUUCUGGUGCCAGAUCCUCUUCUCAAAGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCAUAGUGAGACCUUGGCGCUACAAAAUAAAGCUGUUCUCAUUCCUGUUCUUUCUUACACAAGAGCUGGAGCCCGUGCCCUACCACACAUCUGUGGAGAUGCCCAGGAUUUGACUCGGGCCUUAGAACUUUGCAUAGCAGCUGCUACUAGCUCUUUGAGAUAAUACAUUCCGAGGGGCUCAGUUCUGCCUUAUCUAAAUCACCAGAGACCAAACAAGGACUAAUCCAAUACCUCUUGGAUUUUAUUUAAUGUCAUAAUGUUGUCAGAAUAAAGAGAAAGAUGAAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-491.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -517.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 407.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.(((((.(.(((.(((((((.((((.((((.((...)).)))).((((((.((......)).))))))((......)).))))))))((((((...((((.(((((.(...((.((((...((((.((((.....(((((((.........((((((....))))))..........(((.(........).))).)))))))((((((..(((((..(.(((((((.............)))))))).)))))..))))))))))..)))).........((((((...(((((((((......)))))..))))...))))))))))))..).)))))))))...))))))))).)))).))))))))).))....(((((..(((((((((((((((..(..(((.....)))..)..))))))))))).))))..)))))(((....)))...(((.(((((((((((((((.((....)).))))(((.............))).(((((((...((((.....))))...)))))))...(((((...))))).........(((((((..(((((((.(((((........((((....((((((((((((...((((((.(.(((((.(((((...((...((((.(((((((((......(((((.((..(.((((........)))).)..((((((((((.....((((((((.(......).)))))))))))))))).))..(((.(((((((((((..((..........))..))).))).))))).)))(((((((..((..((((((((((.(............((((..(((((...)))))..)))))))))).)))))..))...)))))))..((((((........)))))).(((....(((((..(((.(((...........))).))).)))))....))).....(((((.((((((.....)).)))).))))).(((........))).))..))))))))).)))))))))...)).)))))))))).).)))))).))))...))))))))))))..))))).))))....)))...)))))))..............))).)))))))).)))....((.(((((((....(((((((((((((.(((((.(((((......(((......)))......))))).))))).)))))....(((((...((((((((((((...(((.((.(((((....)))))))..((((((.......)).))))................)))...))).))))))))))))))...........((.((((........))))..))..)))).))))((.((......)).)).((((((......))))))(((((((..((.((......)).)))))))))))).)))).)).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{((((,{{{{|,|.((({((((((,{((((.((((.((...)).)))).((((((.((......)}.)))))){{......)}.))))))))}{,,{({{{(((,{(((({,(,{.,{,((((.,{((((.((,{,{{{{.,,{{,,..,......((((({....})))))..........,{,{({{({{{{{{{|{{,.,.,,||((((((..(((((..(.(((((((.,,,.....,...)))))))).)))))..))))))||||{.,.||.........((((((...(((((((((......)))))..))))...)))))).|||{|..,.,))))}|||{{{|,,,,))))}))||{|||||||}.}}}....(((((..(((((((((((((((..{..(((.....)))..}..))))))))))).))))..))))){|{..,,)))..}|||}|,((,(({,,,..||}|....,))}))))||,,...||}}}.})))))}|((((((...((((.....))))...)))))),...(((((...)))))..,...,..{{,,(({..(((((,..|||||..}}},,,|||,.{(,{(((((((((((...((((((.(.(((((.(((((...((...((((.((((((((,.....{(((((.((..(.((((........}}}|,|,,((((((((((.....((((((((.(......).)))))))))))))))).}}.,..{,(((((((((((,.((,,,.,,....|}..}}}.,}},}))}}}))){((((((..{{..((((((((((.{..........,.{(((..(((((...}))))..))))})))})))))))..))...))))))}..((((((,.....,.)))))).,{,....((((({,,,,}|}.,|||{.,,,))))}}))).,}}},....}}}.....({(((.{{{{((,...,||.})}}.)))})...,.,,,....,)}})}..))))))))).)))))))))...)).)))))))))).).)))))).))))...)))))))))){{{(((|,|,|||,.,.,))}}}.,))))))......,,,,,,,,||||}}}}))))}))},}|||,|,||}}}}...)}}))),,,(((((.(((((.(((((......(((......)))......))))).))))).))))){{{(((((....|{{{((({{{(({,.{||.{{.(((({....}))))}}..(((({(,......)).)))).,,......,,||,}||||{,.||}.,}|||||||||.{{........}}}})}))))),))),}}}|,{{,{{,...{{....,|{.{{......)).},,((((((......))))))|((((((..((.((......)).)))))))),)))}}))),,,.....