Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000290.4
Sequence Length
837 nt
GC Content
0.6225
GUCCCCGUCCAGAGUCCUCUGUGGUCCCUGCUGCCACCAUGGCCACUCACCGCCUCGUGAUGGUCCGGCACGGCGAGAGCACAUGGAACCAGGAGAACCGUUUCUGUGGCUGGUUCGAUGCAGAGCUGAGUGAAAAGGGGACCGAGGAGGCCAAGCGGGGAGCCAAGGCCAUCAAGGAUGCCAAGAUGGAGUUUGACAUCUGCUACACGUCAGUGCUGAAGCGGGCCAUCCGCACCCUCUGGGCCAUCCUGGACGGCACGGACCAGAUGUGGCUGCCUGUGGUGCGCACUUGGCGCCUCAAUGAGCGGCAUUACGGGGGCCUCACAGGCCUCAACAAGGCAGAAACGGCCGCCAAGCACGGGGAGGAGCAGGUGAAGAUCUGGAGGCGCUCCUUCGACAUCCCGCCGCCCCCGAUGGACGAGAAGCACCCCUACUACAACUCCAUUAGCAAGGAGCGUCGGUACGCAGGCCUGAAGCCCGGGGAACUCCCCACCUGCGAGAGCCUCAAGGACACCAUUGCCCGGGCCCUGCCCUUCUGGAACGAGGAGAUUGUUCCCCAGAUCAAGGCCGGCAAGCGAGUGCUCAUUGCAGCCCACGGGAACAGCCUGCGGGGCAUUGUCAAGCACCUGGAAGGGAUGUCAGACCAGGCGAUCAUGGAGCUGAACCUGCCCACGGGGAUCCCCAUUGUGUAUGAGCUGAACAAGGAGCUGAAGCCCACCAAGCCCAUGCAGUUCCUGGGUGAUGAGGAAACGGUGCGGAAGGCCAUGGAGGCUGUGGCUGCCCAGGGCAAGGCCAAGUGAGGGGUGGGCUUGGGCAAUAAAGGCACCUCCCCCAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-336.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -349.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 209.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((....))))((((((.(((((...(((((((..(((.(((..(((.((...)))))..))).))).)).)))))..(((((((..(((....(((((.(((((((...(((.((((((((.....((.(((..((.((((..((.....))...)))).))..)).).)).(((((........)))))....))).))))).)))...))))))).))))).....)))..).)))))).))))).))))))(((((.(((...((.(((((.......))))).))...))).))))))))))))).((((.(((((...(..(((((..((((((.(((.(((((((((((.((((((..((.(((.((..((((...((((((((((....((.......(((((...((.(((.((((((..((((........)))).)).)))).((((((.((...(((((((..........(((((((((((((..........(((((..((((.((..((...(((((((.....)))))))..))..)).)))))))))..))).)))).))))))))).))))..))))))))))))).)))))........))..)))))))).))...)))).))..))).))..)))))))).......)))))....((((((.(((......((.((....))))....))).)))))).(((((.(....).)))))...))))((....)).))).))))))..)))))..)....)))))..))))((((.((((((.........)))).)).)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.((((....))))((((((.((((((({..((((((.{,{.,,(,,{((,{{((,{{|||||||||}}}.)}.{{{,(((((((,{{..{{,..,,|,|||}||||||,}}}{{{.{{{{{{{{....{({,{((..{(.((((..({,,...}),..)))).))..)).).)).(((((........))))),,,.)}).))})),))}..,)))))))})))},.....,})}})}),,))).))))).))))))(((((.(((...((.(((((.......))))).))...))).))))))))))))){((((.(((((...(..(((((..((((((.(({.(((((((((((.((((((..((.((({{{..((((...((((((((((.{{{{{{{{{{{{{,{{{,..{,.,,,,|,||....((((........))))}))}))},{((((({,((...(((((((.....,,...(((((((((((((..{{...}}.(((((..((((.((..{{,,.(((((((.....)))))))..)),.)).)))))))))..))).)))).))))))}}}.))))..))))))))))))}.,|||,..}}....))..)))))))).))...)))).)).}))).))..)))))))).......)))))....{(((((.(((......((.((....))))....))).)))))},(((((.{....}.))))}.},))))|{..,})).))).))))))..)))))..,,...)))))..))))|(((.((((((.........)))).)).)))).....
Back