Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000312.4
Sequence Length
1769 nt
GC Content
0.5964
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAUCUCCACGACCCGCCCCUACAGGUGCCAGUGCCUCCAGAAUGUGGCAGCUCACAAGCCUCCUGCUGUUCGUGGCCACCUGGGGAAUUUCCGGCACACCAGCUCCUCUUGACUCAGUGUUCUCCAGCAGCGAGCGUGCCCACCAGGUGCUGCGGAUCCGCAAACGUGCCAACUCCUUCCUGGAGGAGCUCCGUCACAGCAGCCUGGAGCGGGAGUGCAUAGAGGAGAUCUGUGACUUCGAGGAGGCCAAGGAAAUUUUCCAAAAUGUGGAUGACACACUGGCCUUCUGGUCCAAGCACGUCGACGGUGACCAGUGCUUGGUCUUGCCCUUGGAGCACCCGUGCGCCAGCCUGUGCUGCGGGCACGGCACGUGCAUCGACGGCAUCGGCAGCUUCAGCUGCGACUGCCGCAGCGGCUGGGAGGGCCGCUUCUGCCAGCGCGAGGUGAGCUUCCUCAAUUGCUCGCUGGACAACGGCGGCUGCACGCAUUACUGCCUAGAGGAGGUGGGCUGGCGGCGCUGUAGCUGUGCGCCUGGCUACAAGCUGGGGGACGACCUCCUGCAGUGUCACCCCGCAGUGAAGUUCCCUUGUGGGAGGCCCUGGAAGCGGAUGGAGAAGAAGCGCAGUCACCUGAAACGAGACACAGAAGACCAAGAAGACCAAGUAGAUCCGCGGCUCAUUGAUGGGAAGAUGACCAGGCGGGGAGACAGCCCCUGGCAGGUGGUCCUGCUGGACUCAAAGAAGAAGCUGGCCUGCGGGGCAGUGCUCAUCCACCCCUCCUGGGUGCUGACAGCGGCCCACUGCAUGGAUGAGUCCAAGAAGCUCCUUGUCAGGCUUGGAGAGUAUGACCUGCGGCGCUGGGAGAAGUGGGAGCUGGACCUGGACAUCAAGGAGGUCUUCGUCCACCCCAACUACAGCAAGAGCACCACCGACAAUGACAUCGCACUGCUGCACCUGGCCCAGCCCGCCACCCUCUCGCAGACCAUAGUGCCCAUCUGCCUCCCGGACAGCGGCCUUGCAGAGCGCGAGCUCAAUCAGGCCGGCCAGGAGACCCUCGUGACGGGCUGGGGCUACCACAGCAGCCGAGAGAAGGAGGCCAAGAGAAACCGCACCUUCGUCCUCAACUUCAUCAAGAUUCCCGUGGUCCCGCACAAUGAGUGCAGCGAGGUCAUGAGCAACAUGGUGUCUGAGAACAUGCUGUGUGCGGGCAUCCUCGGGGACCGGCAGGAUGCCUGCGAGGGCGACAGUGGGGGGCCCAUGGUCGCCUCCUUCCACGGCACCUGGUUCCUGGUGGGCCUGGUGAGCUGGGGUGAGGGCUGUGGGCUCCUUCACAACUACGGCGUUUACACCAAAGUCAGCCGCUACCUCGACUGGAUCCAUGGGCACAUCAGAGACAAGGAAGCCCCCCAGAAGAGCUGGGCACCUUAGCGACCCUCCCUGCAGGGCUGGGCUUUUGCAUGGCAAUGGAUGGGACAUUAAAGGGACAUGUAACAAGCACACCGGCCUGCUGUUCUGUCCUUCCAUCCCUCUUUUGGGCUCUUCUGGAGGGAAGUAACAUUUACUGAGCACCUGUUGUAUGUCACAUGCCUUAUGAAUAGAAUCUUAACUCCUAGAGCAACUCUGUGGGGUGGGGAGGAGCAGAUCCAAGUUUUGCGGGGUCUAAAGCUGUGUGUGUUGAGGGGGAUACUCUGUUUAUGAAAAAGAAUAAAAAACACAACCACGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-735.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -766.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 573.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((..(((((((..(((((((((((((((.(((......((...............((((......))))....((((..........))))))......))))))))))).)))))))..)))))))......(((((((((((((......(((((...........((((.(((((.((((.((((.((((((((....(((....)))...((((.....))))..((((((...........)))))).(((((.((((((.....))))))))))).(((((((((.((((...))))....((((.....)))).)))))))))((.(((((((((((......)))..)))))))).))((((.((((.((((((((((.(((((....)))).).))))))...)))).)))).))))...(((((....))))).....)))))))).))))..)))))))))))))((((((..(((..((((((((....((.(((((.....))))))).....(((....)))...))))))))..)))....))))))..((((.(.((((((((.....(((((((..((((((((((((((....(((((((.(......).))))))).(((((((..((((((((.......(((((.(((..(((..........)))..)))............((...(((((((.(((((........)))))))..)))))...)).(((((..(((((((((((....)))))..............))))))))))).))))))))))((((.....)))))))..))).))))))))))).))).).)))......((((((((((.((((..(((((..((....((((.((((((...((((((.(.(((((..((((.((...)).))))..))))))))).))).(((....((((....(((........)))...))))....))).))))))))))))..)))))..)).))...((((((((...((...(((..((((((.((((.....))))(((((.(((((((.((((((((.((..........((((((....)).)))).((((.(.(((((((((.........((.(((..((((((((...........(.((((((.((.(((((((.......((((((..((..(.((((......)).)).)..)).)))))))))))))...)).)))))).).(((((...)))))))))))))..))).))((((...)))))))))))))).))))....)))))))))).))))))))))))(((.(((((.(((((((............))))))).))))).)))......))))))..).))...))....))))))))......))))))).))))))))))...)))))))).)..))))...((((((((((((.(((((((((((((((......((((...)))).......))))))).))))...)))))))))((((((.((((((((.(((......)))......)))))))))).)))).....((((...((((((((((...)))))......)))))...))))((((((((((...))))).)))))))))))).(((((.......))))).)))))...))))).))))))))((((.....)))).(((((........)))))...........))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((..(((((((,{((({(((((({((({.{((,,,,,,({.,,.,{,,,.,..,,((((,,..,,|||||,,|{(((,{,{,...|{|||,||......}}}}}}})))}|||}}|)},,)|}||||....,|(((((({((((((,{(((,(({{{{,,{{{{{{{{(({{.(((((.((((.((((.((((((((....(({....})}...(((({,...})))}}|,,{{{|,...{,,|.}})}})|.(((((.((((((.....))))))))))).(((((((((.(({,...,|||,...,{||,,...}}),,)))))))))((.(((((((((((,....,)))..)))))))).))((((.((((.((((((((((.(((((....)))).).))))))...)))).)))).)))}.,.{((((....))))))}...)))))))).))))..))))))))}||((((((({{,{,(({(,..,|}},..,|},|}}||}....,||||||{{{,,{{,.,.{||{,.{||||.|{|||||{{{,{|{{,((((({,{{{{|{{{|||{...,|}||||||||{{{{{((({{{((({{.{{{{(({{{||..,{{|{,.,,))),(((({{(..{((({{({,......{{({{.(((..(((..........)))..)))............((...{{({({(,(({{{...,,...}})})))..))))),.,)).(((((..(((((((((((....)))))..............))))))))))).)))))}|)))|,{{{....)))|)))..))),)))))))))).,))}}}}|||||.,.,((((((({((,((((,{{(({(..{{..,,{|||.{||||{,..,{{{||,|,|{{{{..{|||.|{..,)),)))}..))))}))))}.}}.{{(|..,,||,....,{,........,))},}})))},,.})}.)))))))))))}.,))))},))).}}...((((((({.,,{{...{((..((((((,{{((.....))}|((((,{(((((((.((((((({,((..,,....}}((((((....)).)))).((((.(.(((((((((.........((.(((..((((((((...........|.((((((.((,((((((({....,,({{{((,{{{({(,,{,,.,,,,})}})}.,...),)})}})))))))).,.)).)))))).,.(((((...)))))))))))))..))).))((((...)))))))))))))).))))....)))))))))).))))))))))))|{(,(((((.(((((((............))))))).))))).)).......))))))..|.}}...))...,))))))))......)}))))),,)){{(((((,,,,,||}||{.,,.,.|||.,||,{{{{{{{|||{{|{|{{|||||{{|}|...{(((({,.,,,,...,{{{||,|,||{||||{..,,,,,,)))|}}|||||||||||||||{.|...,,,|||||,}}||||},{{{....,,{||}||{|||,,|||.{{,,,.,,}}))),}}},}}}}.,...}}}..||||,||||,..}}}}).))))))))}}))}}}|||,,|.,}},,,}}})))}}...,)))).)}))))}},{{{|....)))),{(({{........}}}},..,,.......))}.
Back