Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000358.3
Sequence Length
2712 nt
GC Content
0.5306
CUCACUUCCCUGGAGCCGCCCGCUUGCCCGUCGGUCGCUAGCUCGCUCGGUGCGCGUCGUCCCGCUCCAUGGCGCUCUUCGUGCGGCUGCUGGCUCUCGCCCUGGCUCUGGCCCUGGGCCCCGCCGCGACCCUGGCGGGUCCCGCCAAGUCGCCCUACCAGCUGGUGCUGCAGCACAGCAGGCUCCGGGGCCGCCAGCACGGCCCCAACGUGUGUGCUGUGCAGAAGGUUAUUGGCACUAAUAGGAAGUACUUCACCAACUGCAAGCAGUGGUACCAAAGGAAAAUCUGUGGCAAAUCAACAGUCAUCAGCUACGAGUGCUGUCCUGGAUAUGAAAAGGUCCCUGGGGAGAAGGGCUGUCCAGCAGCCCUACCACUCUCAAACCUUUACGAGACCCUGGGAGUCGUUGGAUCCACCACCACUCAGCUGUACACGGACCGCACGGAGAAGCUGAGGCCUGAGAUGGAGGGGCCCGGCAGCUUCACCAUCUUCGCCCCUAGCAACGAGGCCUGGGCCUCCUUGCCAGCUGAAGUGCUGGACUCCCUGGUCAGCAAUGUCAACAUUGAGCUGCUCAAUGCCCUCCGCUACCAUAUGGUGGGCAGGCGAGUCCUGACUGAUGAGCUGAAACACGGCAUGACCCUCACCUCUAUGUACCAGAAUUCCAACAUCCAGAUCCACCACUAUCCUAAUGGGAUUGUAACUGUGAACUGUGCCCGGCUGCUGAAAGCCGACCACCAUGCAACCAACGGGGUGGUGCACCUCAUCGAUAAGGUCAUCUCCACCAUCACCAACAACAUCCAGCAGAUCAUUGAGAUCGAGGACACCUUUGAGACCCUUCGGGCUGCUGUGGCUGCAUCAGGGCUCAACACGAUGCUUGAAGGUAACGGCCAGUACACGCUUUUGGCCCCGACCAAUGAGGCCUUCGAGAAGAUCCCUAGUGAGACUUUGAACCGUAUCCUGGGCGACCCAGAAGCCCUGAGAGACCUGCUGAACAACCACAUCUUGAAGUCAGCUAUGUGUGCUGAAGCCAUCGUUGCGGGGCUGUCUGUAGAGACCCUGGAGGGCACGACACUGGAGGUGGGCUGCAGCGGGGACAUGCUCACUAUCAACGGGAAGGCGAUCAUCUCCAAUAAAGACAUCCUAGCCACCAACGGGGUGAUCCACUACAUUGAUGAGCUACUCAUCCCAGACUCAGCCAAGACACUAUUUGAAUUGGCUGCAGAGUCUGAUGUGUCCACAGCCAUUGACCUUUUCAGACAAGCCGGCCUCGGCAAUCAUCUCUCUGGAAGUGAGCGGUUGACCCUCCUGGCUCCCCUGAAUUCUGUAUUCAAAGAUGGAACCCCUCCAAUUGAUGCCCAUACAAGGAAUUUGCUUCGGAACCACAUAAUUAAAGACCAGCUGGCCUCUAAGUAUCUGUACCAUGGACAGACCCUGGAAACUCUGGGCGGCAAAAAACUGAGAGUUUUUGUUUAUCGUAAUAGCCUCUGCAUUGAGAACAGCUGCAUCGCGGCCCACGACAAGAGGGGGAGGUACGGGACCCUGUUCACGAUGGACCGGGUGCUGACCCCCCCAAUGGGGACUGUCAUGGAUGUCCUGAAGGGAGACAAUCGCUUUAGCAUGCUGGUAGCUGCCAUCCAGUCUGCAGGACUGACGGAGACCCUCAACCGGGAAGGAGUCUACACAGUCUUUGCUCCCACAAAUGAAGCCUUCCGAGCCCUGCCACCAAGAGAACGGAGCAGACUCUUGGGAGAUGCCAAGGAACUUGCCAACAUCCUGAAAUACCACAUUGGUGAUGAAAUCCUGGUUAGCGGAGGCAUCGGGGCCCUGGUGCGGCUAAAGUCUCUCCAAGGUGACAAGCUGGAAGUCAGCUUGAAAAACAAUGUGGUGAGUGUCAACAAGGAGCCUGUUGCCGAGCCUGACAUCAUGGCCACAAAUGGCGUGGUCCAUGUCAUCACCAAUGUUCUGCAGCCUCCAGCCAACAGACCUCAGGAAAGAGGGGAUGAACUUGCAGACUCUGCGCUUGAGAUCUUCAAACAAGCAUCAGCGUUUUCCAGGGCUUCCCAGAGGUCUGUGCGACUAGCCCCUGUCUAUCAAAAGUUAUUAGAGAGGAUGAAGCAUUAGCUUGAAGCACUACAGGAGGAAUGCACCACGGCAGCUCUCCGCCAAUUUCUCUCAGAUUUCCACAGAGACUGUUUGAAUGUUUUCAAAACCAAGUAUCACACUUUAAUGUACAUGGGCCGCACCAUAAUGAGAUGUGAGCCUUGUGCAUGUGGGGGAGGAGGGAGAGAGAUGUACUUUUUAAAUCAUGUUCCCCCUAAACAUGGCUGUUAACCCACUGCAUGCAGAAACUUGGAUGUCACUGCCUGACAUUCACUUCCAGAGAGGACCUAUCCCAAAUGUGGAAUUGACUGCCUAUGCCAAGUCCCUGGAAAAGGAGCUUCAGUAUUGUGGGGCUCAUAAAACAUGAAUCAAGCAAUCCAGCCUCAUGGGAAGUCCUGGCACAGUUUUUGUAAAGCCCUUGCACAGCUGGAGAAAUGGCAUCAUUAUAAGCUAUGAGUUGAAAUGUUCUGUCAAAUGUGUCUCACAUCUACACGUGGCUUGGAGGCUUUUAUGGGGCCCUGUCCAGGUAGAAAAGAAAUGGUAUGUAGAGCUUAGAUUUCCCUAUUGUGACAGAGCCAUGGUGUGUUUGUAAUAAUAAAACCAAAGAAACAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-949.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -994.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 816.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((..((.((((((((.((.((((...((((((((((.(((.(.(((((((........))))))).).))).))))..))))))....((((((((((((......((((((((.(((((..((((((...)))))).))))).....((((....))))..((((((((.((.(.(((((((......)))))))...).)).)))))))).((.((((.(((((((..((((.....(((((((((.(((....))))))).....((((.....(((((....(((.(((((.((((((.(..(.(.(((((.(((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((......(((((((((((.....((((..(((((((..(((.....))).((((((((((..........(((.((((..(((.(((((((((((((.(((((......))))).))))))).((.....))....)))))).))))))).))))))))).))))...))))))).))))..(((((....))))).((((.....(((((.(((........))).)))))((.(((.(((...(((((((.((......((((((....((((((..((((............))))..)).......((.(((((...))))).))....))))..))))))(((((......)))))((((((.((.......)).)))))).)).)))))))...))).).)).))..................)))).((((.....)))))))).....)))))))......))))))))).))).(((((..(......)..))))).....(((...((((((.........))))))...)))....)).))))).......))))))).).))))))....))))))).))))).))..).)))..)))..)).))).)))....))))))))))))))...))))..))))))))))).))...)))))))).....))))).))....))))).))))...)))))))))).))..)))))(((.((.((((((.......((((((((..(((((......(((((((....((((.....))))............((((((...)))))).(((((((((((((..((.....))..))))))...)))))))((((((((..(((......(((((((((...((((((....(((((((..(((.((...)).))).))))).))...))))))...)))))....((((.(((...((((.....)))).)))))))......)))).....)))..)))..))))).......((.((((((..(((..((...((((((.(((((((.......((((((((.((..........)).))))))))))))))).)).))))...)).....)))..))))))..))(((((((.((......(((((.(((.(((.((((.(((((...))))).)))).)))))))))))..))))).))))...)))))))......)))))..)))))))).(((.(((((..........))))).)))(((((((....((((((((......).))).))))...))))))).....(((.....(((((((.((((((((((.......(((((((((((((((((.(((..(((((((((((...........))))........(((((((((((((.......((((((...((((.((((..(((.((..(((......(((.(((..((..(((((((.....)))))))....))....))).))).))).)).)))..)))).))))..).)))))..(((((((((.......)))).))))))))))))))))))........(((((((....(((.((((((....((((..((......))..))))...)))))).)))........(((..(((.....(((((((((((((((((.(((.((.....)).(((.((((...........)))).))).(.((((....)))).).........(((((..(((......)))..))))).......(((((..(.....)..))))).((((((((((((((......((((..((((((((........((((......))))...))).)))))..))))(((((((((((((((.(((((...(((...........)))...)))))))).((((....))))..))).)))))))))......(((((((((.....))))))))).((((((...((((......((...((((......))))...))....))))))))))...((((((((......))))))))..)))))))...)))))))...))))))).)))))))))))))....)))..)))...((....))...)))))))...)))))))........))).)))))....))))))))........)))).......)).).))))))))))))))..)))(((.(((((..(((((....((((((((.......)))...))))).)))))..))))).))))))))).)).))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{({{((,.((.({{{|{{{,(,,(((({{{(((((({(((.(((.(.(((((((........))))))).).))).))))..)))))).,,,(((,,((((,((((...{(({((((({(,,,,..||||||}.}))))))})))||{{.,{(({,,{{{||||,.((((((((.((.(.(((((((......)))))))...).)).)))))))).({.(({(,(((((((..{(((,,,(,(((({(((,{(((....)))))))......||......{((((,...({{.{{{{{.{{{|||.|,,|}|}|{|||,|{{{{{(.,((((({{{{(((({({((({(((({{{|||||||,....,||{{{,||||},....((((..(((((((,.{((.....}||.((((((((((..........(((.((((..(((.(((((((((((((.(((((......))))).))))))).||.....|}....)))))).))))))).))))))))),,))).}}))))))).))))..(((((....))))),}.}|},}}}||{||,{{|,.,,,,..)))})))),})}|||.{{{||}|||||,||{{..,,,{({((((.,..{{{{{{{{{(((,,,{....,,...,,,.,||.,,,,..{{.{((({...))))).)}...,}|}}.,}||{,,(((((......))))).,|||{,{|,.......|{||||||{.{{||,,,,....)))}},}}.}),}}.,,.,,.........|,||,({{{,,,,.)}}}||||.,.,|}))))|}.,,...)))}}}}}},}}|,((((({{(,,{{..,.,|||||||...(((...((((((.........})))))...}}}..,.||{}}|||,.,....}}}}}}|.|.}}}}}}....}))}))),)))}).},},}.}}}.|}}}..}},|}},)}}....}}}}}}}}}))))||,,|}}}..}})))))}))).)),,,))))|))){{{{.,,,))})},||||||||.}}}},,,||||||}}}|,||..|}}}}|{{,(({{,{{,,....{{{((((((((..(((((......(((((((,,{{(,((,..{{|||}..{{..,.,,..((((((...)))))).(((((((((((((..((.....))..))))))}..)))))))((((((((..(({......{{{,{((((...((((((....(((((((..({(.{|...}).))).))))).))...))))))...))))|.,,,(((({(({.,.((((.....)))).))}}}},..}}}}}})),,...)))..)))..))))}.......{,.({((({..{{{..|{{,.{{{{{{.{{{((({,,,,,,,{(((((((.((..........)).)))))))))}}}}}}.}},,}}}...,}}}...)))..)))))),.,.|||||{{.|,......(((((.(((.(((.((((.(((({...})))).)))).)))))))))))..})))).)))}...))))))).,....)))))..)))))))).||{.|||{{,,,,,,,,.,))))).}||(((((((....((((((((......),})).)))).,.))))))}.||.{{{,.....{(((((||(((((((|||...,,,,||{.,({{{{{{{{|||,|{{|.(((((({{(((...{,......)))},.......(((((((((((({.......((((({...((((.{{{(||(({.{{,.(((....,,({(,{((..{(..(((((((,...,)))))))....})....})).)))}))).}).})).,)))).))))..}}}))))..(((((((((.......)))).)))))))))))))))))).,.,,,,.(((((((....{{{,(((,{{...}|||{..{(......}|,.|}}},,,||||}}.}}}.....,,,||,.,|||||...(((((((((((((((((.(((,((.....}}.(((.((((...........)))).))).,.{{{{....||||{|.,{......(((((..(((......)))..))))).......{((((..{....,,..})))}.{{((((((,,,,||},,,.,{((({.{{,,{,||...{||{{{,(({{{{{{|||,..,},).)))),}}))))|((((((((((((((.(((((.{.(((........,..})).}.)))))))).{{((....}))}..))).))))))))},,....{((((((((.....))))))))}.(((((,,..(({....}}},...,.)))},.,|||,||,..,}|,,,})}}}))),,.,,((((((((......))))))))..,,,,}}),..))))))}...))))))).))))))))))))).,|,|||..|||{{.,,..}}))}..)))))))...})))}}}.,.....,))).)))))....)))))))),..((((({..,,,,,..,}}})}))))))))))))))..}})|||,|||||,,|||||....|,,,||||,}||,,,),.,,,.,,,..))),}},))}}).)}))))}))|}}|},,..........,,,..,,,.....
Back