Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000366.6
Sequence Length
1265 nt
GC Content
0.5067
GCUCGCACUCCCGCUCCUCCGCCCGACCGCGCGCUCGCCCCGCCGCUCCUGCUGCAGCCCCAGGGCCCCUCGCCGCCGCCACCAUGGACGCCAUCAAGAAGAAGAUGCAGAUGCUGAAGCUCGACAAGGAGAACGCCUUGGAUCGAGCUGAGCAGGCGGAGGCCGACAAGAAGGCGGCGGAAGACAGGAGCAAGCAGCUGGAAGAUGAGCUGGUGUCACUGCAAAAGAAACUCAAGGGCACCGAAGAUGAACUGGACAAAUACUCUGAGGCUCUCAAAGAUGCCCAGGAGAAGCUGGAGCUGGCAGAGAAAAAGGCCACCGAUGCUGAAGCCGACGUAGCUUCUCUGAACAGACGCAUCCAGCUGGUUGAGGAAGAGUUGGAUCGUGCCCAGGAGCGUCUGGCAACAGCUUUGCAGAAGCUGGAGGAAGCUGAGAAGGCAGCAGAUGAGAGUGAGAGAGGCAUGAAAGUCAUUGAGAGUCGAGCCCAAAAAGAUGAAGAAAAAAUGGAAAUUCAGGAGAUCCAACUGAAAGAGGCCAAGCACAUUGCUGAAGAUGCCGACCGCAAAUAUGAAGAGGUGGCCCGUAAGCUGGUCAUCAUUGAGAGCGACCUGGAACGUGCAGAGGAGCGGGCUGAGCUCUCAGAAGGCCAAGUCCGACAGCUGGAAGAACAAUUAAGAAUAAUGGAUCAGACCUUGAAAGCAUUAAUGGCUGCAGAGGAUAAGUACUCGCAGAAGGAAGACAGAUAUGAGGAAGAGAUCAAGGUCCUUUCCGACAAGCUGAAGGAGGCUGAGACUCGGGCUGAGUUUGCGGAGAGGUCAGUAACUAAAUUGGAGAAAAGCAUUGAUGACUUAGAAGACGAGCUGUACGCUCAGAAACUGAAGUACAAAGCCAUCAGCGAGGAGCUGGACCACGCUCUCAACGAUAUGACUUCCAUGUAAACGUUCAUCCACUCUGCCUGCUUACACCCUGCCCUCAUGCUAAUAUAAGUUUCUUUGCUUCACUUCUCCCAAGACUCCCUCGUCGAGCUGGAUGUCCCACCUCUCUGAGCUCUGCAUUUGUCUAUUCUCCAGCUGACCCUGGUUCUCUCUCUUAGCAUCCUGCCUUAGAGCCAGGCACACACUGUGCUUUCUAUUGUACAGAAGCUCUUCGUUUCAGUGUCAAAUAAACACUGUGUAAGCUAUUUCUGUUUGCUAUUCUUUUUACUUCUUAUUUAUUGACAUUUUAGUUUCAACAUUGAAUAAAACUACAAAGCUGCUUCACACAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-392.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -417.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((.(((((.(((((((.....(((((...((((.(..(((.(....).)))..).))))....)).)))(((((...))).)).((((........))))....((((..((((((((((((......)))))..))))))).)))))))))))(((........)))))))).))....))))((((((((....((.(((((((((((.((..............)))))))).........((((.......(((((((((.......((((((((((...((((((((...((((((.....(((.......)))(((((.......)))))(((....))).((((((((((.(.(((((.((..((((....((((.(((....))))))).(((((((...)))))))((((((((.(((((((((((((...((((((.((((((((((.(((((((((((((.((...(((.................)))...(((((.........)))))...(((((.((...(((((((.(..(((.(((.............)))))).(((...((((((((((.((...((..((((.......))).)..))..(((((.(((((...((((..(((((((....((......))............(..((((.((((...(((........((((.(((........)))))))..(((((...(((.(((........)))..))).))))).....)))....))))))))..))))))))..))))...))))).)))))..................)).))))))).)))...))).(((((((..((((...)))).))))..)))).)))))))...))))).)).)))))))).....))))))).))))).....))).))))))))..))))........)))).....(((......)))))))).))))).)))...))))..)).))))).).)))))))))).....(((...)))))))))...........))))))))...)))))............)))))..))))))))))))).......((((((........)))))).))))).))....((((((.......)))))).((((((.......))))))...............(((((((((((.((....)).))))...)))))))........))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{...{{.{{((({(((((((,,.{{{{{,{.,,((((,({,(((,,..,.|,,||..,.})))....,)}}||,{(({...})).,}}((((........))))}...{(({..((((((((((((......)))))..))))))).)))})))))})||{,,......)))))))).,)...}))))((((((((((((((.(((((((((((.((..............))))))))...,..{..{(((,,,,,..((((({(((.......{{{|||{{{{,|.{(({(((({,,{(((((,....(({.......||,(((((.......))))),{,....}},.((((((((((.(.(((((.{(,,((((....(({({(({....})))))).(((((((...)))))))((((((((.(((((((((((((.,,{(((((,({(,,(((((.(((((((((((((,{{...(({.................}))...(((((.........)))))...((((,{((.,.(((((((.,..(((.{((.,.........,.)))))).(((...((((((((((.((...(({{(((......{{{{{{...,|((.(((({,((((,...{(((...(((..((((({......,.,,,.....,,,|({{...((((((((...{.....,..((((.(((........)))))))..,.....{.....}}.........))))))))..,)))....}))))..))))))))))}))))).))).,)))))},.,))})),))..{,.....,........)).)))))))},))...))).(((((((..((((...)))).))))}.,)),.)))))))...))))).)).}))))))),....})))))).)))))...,.))),))))))))},))))}........||,.....||,......}}}})))).))))).))),..))))..)),))))).).))))))))))......}},,})}))))))),}}})}},,,,))))}})}...|||||,,.,........}}}}}.,))))})))))))),,.},..((((((........)))))).))))).)).}}}|(((((,,..,,,|}}}}}.((((((.......))))))................,,||||}||}}}},.{{{{{{{{....)))},,,,}}},...))))))))........
Back