Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000371.4
Sequence Length
616 nt
GC Content
0.5146
ACAGAAGUCCACUCAUUCUUGGCAGGAUGGCUUCUCAUCGUCUGCUCCUCCUCUGCCUUGCUGGACUGGUAUUUGUGUCUGAGGCUGGCCCUACGGGCACCGGUGAAUCCAAGUGUCCUCUGAUGGUCAAAGUUCUAGAUGCUGUCCGAGGCAGUCCUGCCAUCAAUGUGGCCGUGCAUGUGUUCAGAAAGGCUGCUGAUGACACCUGGGAGCCAUUUGCCUCUGGGAAAACCAGUGAGUCUGGAGAGCUGCAUGGGCUCACAACUGAGGAGGAAUUUGUAGAAGGGAUAUACAAAGUGGAAAUAGACACCAAAUCUUACUGGAAGGCACUUGGCAUCUCCCCAUUCCAUGAGCAUGCAGAGGUGGUAUUCACAGCCAACGACUCCGGCCCCCGCCGCUACACCAUUGCCGCCCUGCUGAGCCCCUACUCCUAUUCCACCACGGCUGUCGUCACCAAUCCCAAGGAAUGAGGGACUUCUCCUCCAGUGGACCUGAAGGACGAGGGAUGGGAUUUCAUGUAACCAAGAGUAUUCCAUUUUUACUAAAGCAGUGUUUUCACCUCAUAUGCUAUGUUAGAAGUCCAGGCAGAGACAAUAAAACAUUCCUGUGAAAGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-191.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -201.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((.(((((((((((((((.((((......((((..(((((.(((((((..(((((((.(((.....((((((((((.....))).))))))).((.((..(((((((((.(((((((((.....(((((..((.(((((...((((((((.((.(((.((((((((((((..(.((((((..((((.(((........))).))))......(.((((.....)))).)..)))))).)..))))).))).))))..)))))))))..)))).....)))))..))...)))))......))))..)).....))).)))))))))..)).))))).)))...)))).))))))).)).......)))..))))...((((....))))..........)))).)))))).((((...................))))................)))))))))))))))))(((.(((.....))).)))...((((((((((((((.((....)).))).))))))))))).((...((((((((((...(((...((((..(........)..))))))).....))))))...))))...))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(((((((.(((((((((((((((.((((......((((..(((((.(((((((..(((((((.(((.....((((((((((.....))).))))))).((.((..(((((((((.(((({((((.....(((((..{{.(((((...((({((((.((.(((.((((((((((((..(.((((((..((((.(((........})).)))).....,(.((((.....)))).).,)))))).)..)))))})}).))))..)))))))))..|))).....))))}..}},..))))).....,))}}..}}.....))).)))))))))..)).))))).)))}..}))).))))))).)).......)))..))))...((((....))))..........)))).)))))){((,,....}}}............||}|,..,.,..........))))))))))))))))|(((.(((.....))).})),..((((((((((((((.((....)).))).))))))))))}.{,..,{{(((({{{,....{{...||||.,{,,....|,|,.}}}}},)}....,,}}))},,})}}...,}}..
Back