Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000424.4
Sequence Length
2238 nt
GC Content
0.5688
AACAGAGCCACCUUCUGCGUCCUGCUGAGCUCUGUUCUCUCCAGCACCUCCCAACCCACUAGUGCCUGGUUCUCUUGCUCCACCAGGAACAAGCCACCAUGUCUCGCCAGUCAAGUGUGUCCUUCCGGAGCGGGGGCAGUCGUAGCUUCAGCACCGCCUCUGCCAUCACCCCGUCUGUCUCCCGCACCAGCUUCACCUCCGUGUCCCGGUCCGGGGGUGGCGGUGGUGGUGGCUUCGGCAGGGUCAGCCUUGCGGGUGCUUGUGGAGUGGGUGGCUAUGGCAGCCGGAGCCUCUACAACCUGGGGGGCUCCAAGAGGAUAUCCAUCAGCACUAGUGGUGGCAGCUUCAGGAACCGGUUUGGUGCUGGUGCUGGAGGCGGCUAUGGCUUUGGAGGUGGUGCCGGUAGUGGAUUUGGUUUCGGCGGUGGAGCUGGUGGUGGCUUUGGGCUCGGUGGCGGAGCUGGCUUUGGAGGUGGCUUCGGUGGCCCUGGCUUUCCUGUCUGCCCUCCUGGAGGUAUCCAAGAGGUCACUGUCAACCAGAGUCUCCUGACUCCCCUCAACCUGCAAAUCGACCCCAGCAUCCAGAGGGUGAGGACCGAGGAGCGCGAGCAGAUCAAGACCCUCAACAAUAAGUUUGCCUCCUUCAUCGACAAGGUGCGGUUCCUGGAGCAGCAGAACAAGGUUCUGGACACCAAGUGGACCCUGCUGCAGGAGCAGGGCACCAAGACUGUGAGGCAGAACCUGGAGCCGUUGUUCGAGCAGUACAUCAACAACCUCAGGAGGCAGCUGGACAGCAUCGUGGGGGAACGGGGCCGCCUGGACUCAGAGCUGAGAAACAUGCAGGACCUGGUGGAAGACUUCAAGAACAAGUAUGAGGAUGAAAUCAACAAGCGUACCACUGCUGAGAAUGAGUUUGUGAUGCUGAAGAAGGAUGUAGAUGCUGCCUACAUGAACAAGGUGGAGCUGGAGGCCAAGGUUGAUGCACUGAUGGAUGAGAUUAACUUCAUGAAGAUGUUCUUUGAUGCGGAGCUGUCCCAGAUGCAGACGCAUGUCUCUGACACCUCAGUGGUCCUCUCCAUGGACAACAACCGCAACCUGGACCUGGAUAGCAUCAUCGCUGAGGUCAAGGCCCAGUAUGAGGAGAUUGCCAACCGCAGCCGGACAGAAGCCGAGUCCUGGUAUCAGACCAAGUAUGAGGAGCUGCAGCAGACAGCUGGCCGGCAUGGCGAUGACCUCCGCAACACCAAGCAUGAGAUCUCUGAGAUGAACCGGAUGAUCCAGAGGCUGAGAGCCGAGAUUGACAAUGUCAAGAAACAGUGCGCCAAUCUGCAGAACGCCAUUGCGGAUGCCGAGCAGCGUGGGGAGCUGGCCCUCAAGGAUGCCAGGAACAAGCUGGCCGAGCUGGAGGAGGCCCUGCAGAAGGCCAAGCAGGACAUGGCCCGGCUGCUGCGUGAGUACCAGGAGCUCAUGAACACCAAGCUGGCCCUGGACGUGGAGAUCGCCACUUACCGCAAGCUGCUGGAGGGCGAGGAAUGCAGACUCAGUGGAGAAGGAGUUGGACCAGUCAACAUCUCUGUUGUCACAAGCAGUGUUUCCUCUGGAUAUGGCAGUGGCAGUGGCUAUGGCGGUGGCCUCGGUGGAGGUCUUGGCGGCGGCCUCGGUGGAGGUCUUGCCGGAGGUAGCAGUGGAAGCUACUACUCCAGCAGCAGUGGGGGUGUCGGCCUAGGUGGUGGGCUCAGUGUGGGGGGCUCUGGCUUCAGUGCAAGCAGUGGCCGAGGGCUGGGGGUGGGCUUUGGCAGUGGCGGGGGUAGCAGCUCCAGCGUCAAAUUUGUCUCCACCACCUCCUCCUCCCGGAAGAGCUUCAAGAGCUAAGAACCUGCUGCAAGUCACUGCCUUCCAAGUGCAGCAACCCAGCCCAUGGAGAUUGCCUCUUCUAGGCAGUUGCUCAAGCCAUGUUUUAUCCUUUUCUGGAGAGUAGUCUAGACCAAGCCAAUUGCAGAACCACAUUCUUUGGUUCCCAGGAGAGCCCCAUUCCCAGCCCCUGGUCUCCCGUGCCGCAGUUCUAUAUUCUGCUUCAAAUCAGCCUUCAGGUUUCCCACAGCAUGGCCCCUGCUGACACGAGAACCCAAAGUUUUCCCAAAUCUAAAUCAUCAAAACAGAAUCCCCACCCCAAUCCCAAAUUUUGUUUUGGUUCUAACUACCUCCAGAAUGUGUUCAAUAAAAUGCUUUUAUAAUAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-874.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -911.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 622.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.....((.((.....)).))))))))))..((((((((((..(((..((((((((((.(((((((((((((((.(((((....(((((((...(((((((.(.((((..((.(((((((((((((((((.((.((.......)))).)))))))(((((((((((((...((((((.(((.....(((....)))....))).)))))).))))).)))))))))))))).)))).))..))))).)))).....)))...)))))))..(((.......))).......))))))))))...)))))))...)))...))))))))))))).(((.(((((......))))).)))))))))))))((.......))((((((((((((...(((.(.((((((.((((.((.((((((..(((.((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((....((((.((..(.((((((((((((((((.(((.((((...(((..(((((...((.(((((.....((((((((....(((............)))....))))).)))((..((((((.((((((......................))))))))))))..)).....(((((.(((((((.(((((((((((...))))))..(((...)))....))))).)))))))...))))).))))).)).))))).))))))))))((((((.((........)))))))).))))))))..)).)))))).)..)).))))..)))))))))))....))))))))......(((((.((((((((.((..(((((((..........)))))............(((((..(((.(((.......)))..))))))))((((.((((((((((.(((((...............((.((.((((((((.(((((..((((((....(((((......)))))....(((((...((.(((((((((((((((((.(((......))).))))..........(((((......(((.......)))......))))).))))))).((((.((((.(((....)))))))))))((..(((((((.(((..(((((......((.(((((((.((((........)))).)))).)).).))......))))))))..)))))))..)))))))).))...)))))..((((((((........)))).))))....((((...))))....(((((...)))))....))))))((...((.(((...(((....)))..))).))...))((((((..(((((((....))..)))))......(((((((...(((.(((....))).)))..)))).)))((((((((((.((((((((((....((((..((((((...(..(.(((.((((((((...((.(((.(.(((.(((((.((((..((((((((((...((((((.(((......((((....((((.((..........)).))))....))))......))))))))).....((.((.(((((....))))).)).))((((((....))))))(((((((.((((((....))))))))))))).((((((.......)))))).)))))))))).))))))))).))))))).))...)))).)))).))).)..)...)))))).))))..)))))))))).(((((((((.((.((((.(((((((((....(((((((.((.(((..........(((.......(((.(((....))).))).....))))))..))..)))))))..)))))))))....)))).)).)..))))))))...((((((((((.....)))))))..)))..))))))))))...((((((((((((....))).......((.....)).((((((.......)))))))))))))))))))))...)))))..)))))))).)).))))))))))))))))).))))...))..)).))))))...))...))))))).)).))).)).))))..))))))))).)))))..)))..))).)).)))).))))))).)))......(((((......))))).....)))))))))))).((((((..((((((...)))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((,,...{(.((....,)},)})))))))|,,((((((((((..(((..((((((((((.(((((((((((((((...{((|.{,,{{((({.{{,((,,,,,|.||,|,,||}|||,{{||||||||(((.(({(({{{,...||||{|||||||(((((((((((((...((((((.(((.{...(((....)))....))).)))))).))))).))))))))),||,|{||||.,,.}))))).))}}.....)))},,)))))))}}}}}.}))(((((((((.......,)))))))))}))))))...))).,,))))))))))})),{((.{((({......})))}.)))))))))))))},,|,....}}{((((((((((({{{((..,.(((((({(,,{.((.(((((,,.(((.((.((((((((((((((((((((.(({(((((((((((((((((((....((((.((,.(,({({((((((((((((.(((.(((,..{(((..(((((...((.(((((.....((((((((....(((............)))....))))).)))((..((((((.((((((..,................,..))))))))))))..)).....(((((.(((((((.(((((({({{{..,||||||..{{(,..,|)|.|,))))).)))))))...))))).))))).)).))))).)))))))}))((((((.((........)))))))),)))))))),,)).)))})),...}),))))..)))))))))))...,|||}}}})},,...{{{((.((((((((.((..({(((((........,.})))}.....,{|,.{{(((,{..,,(,,{{.,,..,,,))}})))}),,(((((.((((((((((.(((((...{,{{.....,{{(({(((((,(((((.,(((,.((((((((.{,(((((......}))))(((({...))))}...,(((((((.{((((.({{{{{,{.|||}||}|{(({{{{|,|{{(((,,{{{{{{((,.|,....,,.||.,|||{,{{{.,,{|||..,,..||||||||}.,||,||||,.||.||....,,|}..,.((((((((......((({.(((((((((((..........(((((.(({,(,{(..,(,((((..((((((.((((((.,,{{.((,.......||.{|.({((((((.,,,....}}}}.}))))),,((({...}))).,{,((({(..,||}},...,}},})},.}}}||}||,,...,.)))))).,})))))..)))),)}.,..))}))))))))..))))))))},....(((((((...(((.(((....))).)))..)))),,)).}}}}.)))})))))))).,(((((((.,...,.||}}}}}....,||.|||}||||}}.,|}|}|}}},,}}||||..((((..((((((((((...((((((.(({..,,..((((,{,.(((({((,.....,}}}),,)))).|}.}))).,,,.,))))))))).....((.((.(((((....))))).)).))((((((....)))))){((((((.((((((....))))))))))))}.((((((.......)))))).)))))))))).)))))))))))})||||.},.,)))))},,)).)))))))))))),),)))))))},))..))))),.(((((((((((((((((,(((((((((....(((((((.{{.{({.,,.....,|.{{,......(((.(((....))).)))......)))))..},..)))))))..)))))))))....,.||{|{(({{{...||{..,(({({,,,,||}},,.,))),)))))),..}},.,},......{{,.((((((......))))))...,|{.....)).((((((.......))))))..,}})))))))))))))))))))}))),))))}})),.))))))))))))))).)))))..))..)).)))))),,.)),..))})))).})}))).)).))))..))))))))).))))}..,,,...,,.||.,,,},)},,,,)})))}}.,..}}}})))}...,)))))....)))))))))))).{(((((..((((({...,)))))}))))}.
Back