Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000508.5
Sequence Length
3654 nt
GC Content
0.4327
AAUCCUUUCUUUCAGCUGGAGUGCUCCUCAGGAGCCAGCCCCACCCUUAGAAAAGAUGUUUUCCAUGAGGAUCGUCUGCCUGGUCCUAAGUGUGGUGGGCACAGCAUGGACUGCAGAUAGUGGUGAAGGUGACUUUCUAGCUGAAGGAGGAGGCGUGCGUGGCCCAAGGGUUGUGGAAAGACAUCAAUCUGCCUGCAAAGAUUCAGACUGGCCCUUCUGCUCUGAUGAAGACUGGAACUACAAAUGCCCUUCUGGCUGCAGGAUGAAAGGGUUGAUUGAUGAAGUCAAUCAAGAUUUUACAAACAGAAUAAAUAAGCUCAAAAAUUCACUAUUUGAAUAUCAGAAGAACAAUAAGGAUUCUCAUUCGUUGACCACUAAUAUAAUGGAAAUUUUGAGAGGCGAUUUUUCCUCAGCCAAUAACCGUGAUAAUACCUACAACCGAGUGUCAGAGGAUCUGAGAAGCAGAAUUGAAGUCCUGAAGCGCAAAGUCAUAGAAAAAGUACAGCAUAUCCAGCUUCUGCAGAAAAAUGUUAGAGCUCAGUUGGUUGAUAUGAAACGACUGGAGGUGGACAUUGAUAUUAAGAUCCGAUCUUGUCGAGGGUCAUGCAGUAGGGCUUUAGCUCGUGAAGUAGAUCUGAAGGACUAUGAAGAUCAGCAGAAGCAACUUGAACAGGUCAUUGCCAAAGACUUACUUCCCUCUAGAGAUAGGCAACACUUACCACUGAUAAAAAUGAAACCAGUUCCAGACUUGGUUCCCGGAAAUUUUAAGAGCCAGCUUCAGAAGGUACCCCCAGAGUGGAAGGCAUUAACAGACAUGCCGCAGAUGAGAAUGGAGUUAGAGAGACCUGGUGGAAAUGAGAUUACUCGAGGAGGCUCCACCUCUUAUGGAACCGGAUCAGAGACGGAAAGCCCCAGGAACCCUAGCAGUGCUGGAAGCUGGAACUCUGGGAGCUCUGGACCUGGAAGUACUGGAAACCGAAACCCUGGGAGCUCUGGGACUGGAGGGACUGCAACCUGGAAACCUGGGAGCUCUGGACCUGGAAGUACUGGAAGCUGGAACUCUGGGAGCUCUGGAACUGGAAGUACUGGAAACCAAAACCCUGGGAGCCCUAGACCUGGUAGUACCGGAACCUGGAAUCCUGGCAGCUCUGAACGCGGAAGUGCUGGGCACUGGACCUCUGAGAGCUCUGUAUCUGGUAGUACUGGACAAUGGCACUCUGAAUCUGGAAGUUUUAGGCCAGAUAGCCCAGGCUCUGGGAACGCGAGGCCUAACAACCCAGACUGGGGCACAUUUGAAGAGGUGUCAGGAAAUGUAAGUCCAGGGACAAGGAGAGAGUACCACACAGAAAAACUGGUCACUUCUAAAGGAGAUAAAGAGCUCAGGACUGGUAAAGAGAAGGUCACCUCUGGUAGCACAACCACCACGCGUCGUUCAUGCUCUAAAACCGUUACUAAGACUGUUAUUGGUCCUGAUGGUCACAAAGAAGUUACCAAAGAAGUGGUGACCUCCGAAGAUGGUUCUGACUGUCCCGAGGCAAUGGAUUUAGGCACAUUGUCUGGCAUAGGUACUCUGGAUGGGUUCCGCCAUAGGCACCCUGAUGAAGCUGCCUUCUUCGACACUGCCUCAACUGGAAAAACAUUCCCAGGUUUCUUCUCACCUAUGUUAGGAGAGUUUGUCAGUGAGACUGAGUCUAGGGGCUCAGAAUCUGGCAUCUUCACAAAUACAAAGGAAUCCAGUUCUCAUCACCCUGGGAUAGCUGAAUUCCCUUCCCGUGGUAAAUCUUCAAGUUACAGCAAACAAUUUACUAGUAGCACGAGUUACAACAGAGGAGACUCCACAUUUGAAAGCAAGAGCUAUAAAAUGGCAGAUGAGGCCGGAAGUGAAGCCGAUCAUGAAGGAACACAUAGCACCAAGAGAGGCCAUGCUAAAUCUCGCCCUGUCAGAGACUGUGAUGAUGUCCUCCAAACACAUCCUUCAGGUACCCAAAGUGGCAUUUUCAAUAUCAAGCUACCGGGAUCCAGUAAGAUUUUUUCUGUUUAUUGCGAUCAAGAGACCAGUUUGGGAGGAUGGCUUUUGAUCCAGCAAAGAAUGGAUGGAUCACUGAAUUUUAACCGGACCUGGCAAGACUACAAGAGAGGUUUCGGCAGCCUGAAUGACGAGGGGGAAGGAGAAUUCUGGCUAGGCAAUGACUACCUCCACUUACUAACCCAAAGGGGCUCUGUUCUUAGGGUUGAAUUAGAGGACUGGGCUGGGAAUGAAGCUUAUGCAGAAUAUCACUUCCGGGUAGGCUCUGAGGCUGAAGGCUAUGCCCUCCAAGUCUCCUCCUAUGAAGGCACUGCGGGUGAUGCUCUGAUUGAGGGUUCCGUAGAGGAAGGGGCAGAGUACACCUCUCACAACAACAUGCAGUUCAGCACCUUUGACAGGGAUGCAGACCAGUGGGAAGAGAACUGUGCAGAAGUCUAUGGGGGAGGCUGGUGGUAUAAUAACUGCCAAGCAGCCAAUCUCAAUGGAAUCUACUACCCUGGGGGCUCCUAUGACCCAAGGAAUAACAGUCCUUAUGAGAUUGAGAAUGGAGUGGUCUGGGUUUCCUUUAGAGGGGCAGAUUAUUCCCUCAGGGCUGUUCGCAUGAAAAUUAGGCCCCUUGUGACCCAAUAGGCUGAAGAAGUGGGAAUGGGAGCACUCUGUCUUCUUUGCUAGAGAAGUGGAGAGAAAAUACAAAAGGUAAAGCAGUUGAGAUUCUCUACAACCUAAAAAAUUCCUAGGUGCUAUUUUCUUAUCCUUUGUACUGUAGCUAAAUGUACCUGAGACAUAUUAGUCUUUGAAAAAUAAAGUUAUGUAAGGUUUUUUUUAUCUUUAAAUAGCUCUGUGGGUUUUAACAUUUUUAUAAAGAUAUACCAAGGGCCAUUCAGUACAUCAGGAAAGUGGCAGACAGAAGCUUCUCUCUGCAACCUUGAAGACUAUUGGUUUGAGAACUUCUCUUCCCAUACCACCCAAAAUCAUAAUGCCAUUGGAAAGCAAAAAGUUGUUUUAUCCAUUUGAUUUGAAUUGUUUUAAGCCAAUAUUUUAAGGUAAAACUCACUGAAUCUAACCAUAGCUGACCUUUGUAGUAGAAUUUACAACUUAUAAUUACAAUGCACAAUUUAUAAUUACAAUAUGUAUUUAUGUCUUUUGCUAUGGAGCAAAUCCAGGAAGGCAAGAGAAACAUUCUUUCCUAAAUAUAAAUGAAAAUCUAUCCUUUAAACUCUUCCACUAGACGUUGUAAUGCACACUUAUUUUUUUCCCAAGGAGUAACCAAUUUCUUUCUAAAACACAUUUAAAAUUUUAAAACUAUUUAUGAAUAUUAAAAAAAGACAUAAUUCACACAUUAAUAAACAAUCUCCCAAGUAUUGAUUUAACUUCAUUUUUCUAAUAAUCAUAAACUAUAUUCUGUGACAUGCUAAUUAUUAUUAAAUGUAAGUCGUUAGUUCGAAAGCCUCUCACUAAGUAUGAUCUAUGCUAUAUUCAAAAUUCAACCCAUUUACUUUGGUCAAUAUUUGAUCUAAGUUGCAUCUUUAAUCCUGGUGGUCUUGCCUUCUGAUUUUUAAUUUGUAUCCUUUUCUAUUAAGAUAUAUUUGUCAUUUUCUCUUGAAUAUGUAUUAAAAUAUCCCAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1028.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1101.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 1097.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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