Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000526.5

Sequence Length

1636 nt

GC Content

0.6082

ACCCGAGCACCUUCUCUUCACUCAGCCAACUGCUCGCUCGCUCACCUCCCUCCUCUGCACCAUGACCACCUGCAGCCGCCAGUUCACCUCCUCCAGCUCCAUGAAGGGCUCCUGCGGCAUCGGGGGCGGCAUCGGGGGCGGCUCCAGCCGCAUCUCCUCCGUCCUGGCCGGAGGGUCCUGCCGCGCCCCCAGCACCUACGGGGGCGGCCUGUCUGUCUCAUCCUCCCGCUUCUCCUCUGGGGGAGCCUGCGGGCUGGGGGGCGGCUAUGGCGGUGGCUUCAGCAGCAGCAGCAGCAGCUUUGGUAGUGGCUUUGGGGGAGGAUAUGGUGGUGGCCUUGGUGCUGGCUUGGGUGGUGGCUUUGGUGGUGGCUUUGCUGGUGGUGAUGGGCUUCUGGUGGGCAGUGAGAAGGUGACCAUGCAGAACCUCAAUGACCGCCUGGCCUCCUACCUGGACAAGGUGCGUGCUCUGGAGGAGGCCAACGCCGACCUGGAAGUGAAGAUCCGUGACUGGUACCAGAGGCAGCGGCCUGCUGAGAUCAAAGACUACAGUCCCUACUUCAAGACCAUUGAGGACCUGAGGAACAAGAUUCUCACAGCCACAGUGGACAAUGCCAAUGUCCUUCUGCAGAUUGACAAUGCCCGUCUGGCCGCGGAUGACUUCCGCACCAAGUAUGAGACAGAGUUGAACCUGCGCAUGAGUGUGGAAGCCGACAUCAAUGGCCUGCGCAGGGUGCUGGACGAACUGACCCUGGCCAGAGCUGACCUGGAGAUGCAGAUUGAGAGCCUGAAGGAGGAGCUGGCCUACCUGAAGAAGAACCACGAGGAGGAGAUGAAUGCCCUGAGAGGCCAGGUGGGUGGAGAUGUCAAUGUGGAGAUGGACGCUGCACCUGGCGUGGACCUGAGCCGCAUUCUGAACGAGAUGCGUGACCAGUAUGAGAAGAUGGCAGAGAAGAACCGCAAGGAUGCCGAGGAAUGGUUCUUCACCAAGACAGAGGAGCUGAACCGCGAGGUGGCCACCAACAGCGAGCUGGUGCAGAGCGGCAAGAGCGAGAUCUCGGAGCUCCGGCGCACCAUGCAGAACCUGGAGAUUGAGCUGCAGUCCCAGCUCAGCAUGAAAGCAUCCCUGGAGAACAGCCUGGAGGAGACCAAAGGUCGCUACUGCAUGCAGCUGGCCCAGAUCCAGGAGAUGAUUGGCAGCGUGGAGGAGCAGCUGGCCCAGCUCCGCUGCGAGAUGGAGCAGCAGAACCAGGAGUACAAGAUCCUGCUGGACGUGAAGACGCGGCUGGAGCAGGAGAUCGCCACCUACCGCCGCCUGCUGGAGGGCGAGGACGCCCACCUCUCCUCCUCCCAGUUCUCCUCUGGAUCGCAGUCAUCCAGAGAUGUGACCUCCUCCAGCCGCCAAAUCCGCACCAAGGUCAUGGAUGUGCACGAUGGCAAGGUGGUGUCCACCCACGAGCAGGUCCUUCGCACCAAGAACUGAGGCUGCCCAGCCCCGCUCAGGCCUAGGAGGCCCCCCGUGUGGACACAGAUCCCACUGGAAGAUCCCCUCUCCUGCCCAAGCACUUCACAGCUGGACCCUGCUUCACCCUCACCCCCUCCUGGCAAUCAAUACAGCUUCAUUAUCUGAGUUGCAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-653.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -682.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 438.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..........(((((((((.((((((...(((((..(((.(((((..(((.((...((.((((.((((((.((((((((((.((((((.((((((((.(((...(((((.(((.((((....(((((((....(((((((((....)))))..)))).))))))).)))).)))))))).....((((((.........))))))((((...(((((..((((((((((((((((...))))))))((((..((((.(((((.(((.....))).)))))..)))).))))(((.((((........))))))).))))))))..))))).)))).))).)))))...))).)))))....).)))))))..))).)))))).))))))....)).)))..))))).(((((..(((...........)))..)))))((((((((.((.(((((.......)).)))))))))))))...((((..(((((........)))).)..))))....)))..)))))...))))))......(((....))).((.(((((...((((((.((...((((((......))))))...)).)))))).....((((...(((((((.(((.((..((((...((((((((((..((((.(((((((((....((((.(.(((........)))).)))).)))))))))....))))..)))))....((((((.(.(......).))))))).((((.......)))))))))...))))..)).))).)))))))..)))).....))))).))......))))))))).(((.((((..(.((((...(((((((((((..(((..(((((((..((((.((((.(.(((.(((((((((..((((((.((.....))))))).)..)))...(((((..(((....(((((((((((....)))........)))))))).........((((((..(((((((..(.((........)).)..)).)))((((.(((((...((.(.((((((...((((((((....(((((.((..((((.(((((.....))))))))).)).)))))....(((((((((((..(((((((.((..((((...))))....)).)).)..))))..)....)))))).))))...(.((((.((......)))))).)(((((((.(((((........))))).))...((((........))))))))).((((....))))))))))))..)))))).)...))...))))))))).((.(((((....))))).))))..))))))))).)))))((((((((.......)))))))).....(((.(((...((((.......(((((((......))).)))).....)))).))).)))))))))))).).))))))))(((.......)))..(.((((....)))).)(((..(((...((((((..((.(((.(((......)))))).))..)....)))))...)))..))).)))))))....)))....))))))))..))).))))).)))).)))...((((((........)))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((.,.(((((((((.(((.((,..{{(((((((,((,((((.(((..{{{.((((((.{.(({,,.,,.{((((((..,..((((((((((,.(((({.(((((.(((.((((..{,(((((((....(((((((((....))))).,)))}.)))))))})))).))))))))(((((.((((((((.((...{((((,((.....,,}}}.,..}},}}|((((((((...)))))))),,}.)))))))))))))))}}}}}.|((.((({(((.(((.((....)).))))))).))).))}}))))))))),..)))))))})}}.)))))).}}...))).)))))}.((((((((.(((((((.((((((.(((((.(((((((((.((.(.....).)).)))).))))).))),}).))))))(((((((((.((.((((,.......)},)},)))))))))))..,{{..,{{|,..(((((((.((((..((((((((((..((((((({,((.(((((((.....((.((({{(.....((({.....})))))},,))}),.....}}}))))))))))....{((......))}..((((.(((.((.(((((((.{((((((((((((,(((,...(((((((((,...{{((.(.(((.,,....})))).)))).)))))))))}},.},||...{{{{{{,,((((((.{.{......).})))))},||||.}||..,(({......}}}..,.,,..|{{..||||))..)),}|||.{{{...,......,...}))|||.........,})}....)))))))))))),....))))))).)).))).)))))))))..)))).((((..((..{((({,((((.,,,..},|}}}.,..,,)}.}.}}}}..))))..,,..,..)))).....)))).))..)))).))))))).....))).}}.)},....,))))))).)))))))}.))))))),))))),))).)).,)))).))).,)))))..((((((.((..(((((.((..((((.(((((.....))))))))).)).)))))...))...|)|))))....(((.(((((.((((...))))((....,}..}}.(((|,{{..,{({...,.,,}}|}|)})})){,((.(((((((..((.((((((,.(((((........))))).}..{(((,({.......,,)),}))}..((((((..(((((.((((.(((.(((((((.((((..((({{,,((,((((((.((((,......}}}}}}}))}...{((((({.((((((((.......))))))))..({(((((.,,,..{{.{,,....,,||,,,.,}}}},)}}||,|||.,|.|}),.,|||||,,,))}))},}}})})}))}}.........}))}}}|.((((....))))..}}.,.))).)))).)))..{(.(((.(((......)))))).))..)))).))))))).)))...)).))))))}))))).)))))))}}.,)}.,....))))).)))........(((({{{,.....})))))).....