Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000588.4

Sequence Length

924 nt

GC Content

0.4762

AGAGCCCCACGAAGGACCAGAACAAGACAGAGUGCCUCCUGCCGAUCCAAACAUGAGCCGCCUGCCCGUCCUGCUCCUGCUCCAACUCCUGGUCCGCCCCGGACUCCAAGCUCCCAUGACCCAGACAACGCCCUUGAAGACAAGCUGGGUUAACUGCUCUAACAUGAUCGAUGAAAUUAUAACACACUUAAAGCAGCCACCUUUGCCUUUGCUGGACUUCAACAACCUCAAUGGGGAAGACCAAGACAUUCUGAUGGAAAAUAACCUUCGAAGGCCAAACCUGGAGGCAUUCAACAGGGCUGUCAAGAGUUUACAGAACGCAUCAGCAAUUGAGAGCAUUCUUAAAAAUCUCCUGCCAUGUCUGCCCCUGGCCACGGCCGCACCCACGCGACAUCCAAUCCAUAUCAAGGACGGUGACUGGAAUGAAUUCCGGAGGAAACUGACGUUCUAUCUGAAAACCCUUGAGAAUGCGCAGGCUCAACAGACGACUUUGAGCCUCGCGAUCUUUUGAGUCCAACGUCCAGCUCGUUCUCUGGGCCUUCUCACCACAGAGCCUCGGGACAUCAAAAACAGCAGAACUUCUGAAACCUCUGGGUCAUCUCUCACACAUUCCAGGACCAGAAGCAUUUCACCUUUUCCUGCGGCAUCAGAUGAAUUGUUAAUUAUCUAAUUUCUGAAAUGUGCAGCUCCCAUUUGGCCUUGUGCGGUUGUGUUCUCAUUUUUAUCCCAUUGAGACUAUUUAUUUAUGUAUGUAUGUAUUUAUUUAUUUAUUGCCUGGAGUGUGAACUGUAUUUAUUUUAGCAGAGGAGCCAUGUCCUGCUGCUUCUGCAAAAAACUCAGAGUGGGGUGGGGAGCAUGUUCAUUUGUACCUCGAGUUUUAAACUGGUUCCUAGGGAUGUGUGAGAAUAAACUAGACUCUGAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-254.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -270.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 219.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.......((((.(((.((..(.(((.(((.(((.((..........)).))).)))))))..)).))).))))............((((((...))))))....))))..((((((((((....((((..((.(((.(((((((......((((......((((.......................((((((.....(((((((..(((.((((..((.......))..)))).)))........(((.((.......)).))).(((.....))))))))))........))))))((((.((((.(((((((..((((...((((((....)))))).....(((((((.((...(((...))))).)))(((......))).((((...(((.......))).)))).((((((....))))))))))..)))))))....)))).)))).)))).....(((.((((((((.((....)))))))))))))))))....))))......))))))).))).)).))))...(((......)))..((((((..((..........))..))))))....)))))))))).(((((((((((((((((((((..(((.(((((...((((...((((..((((((((...((..(((.((.......(((((.((((((.(((........)).).))))))..(((((............))))).))))).......)).)))..))...))))))))..)))).)))).))))).)))..........((((((((((........))).)))))))..(((((((.....((((((.(((.........))).)))))))))))))...)))).)))).)))))))))))))...................

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((({.....,.((((.(((.((..(.(((.(((.(((.((..........)).))).))))))}..)).))).)))),},.........((((((...)))))}...,},....((((((((((....((((,,((,{,{.{{((((({,..{{(((,,{{..{{....|||....,,,.......,}}.}||||,,.....{((((({{.{((.((((..((.......))..)))).))},|....|||{{.||.......}}.}))}}||}.,,,}}})),}}}},,},..,})))|}|((((.((((.(((({{(,.((((...{(((((....)))))).....((({(((.{(...({{...))))).)))(((......))).((((...(((.......))).)))).((((({....}))))))))}..))))})),,..}))).)))).))))|{{.{(((.((((((((.((....)))))))))))))).))||{{||||{{...{}}}}}}}.}}}.|}|||}}...{{,.,,..,)))..,{{|||,.||,,,.....{{||..,)))),....)))))))))).(((((((((((((((((((((..(((.(((((...((((...((((..((((((((.,.,,..,,{,,,......}|,,,,,((((({,{({,...,...})}).))))}}|.(((((............))))).||,.{,,..,.,|}.}}}.,}}...))))))))..)))).)))).))))).)))..........((((((((((........))).)))))))..(((((((.,.,.((((((,({(.....,,,,))).)))))))))))))...))))}}))).)))))))))))))........,.}})}.....