Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000618.5
Sequence Length
7277 nt
GC Content
0.3662
CUUCUGUUUGCUAAAUCUCACUGUCACUGCUAAAUUCAGAGCAGAUAGAGCCUGCGCAAUGGAAUAAAGUCCUCAAAAUUGAAAUGUGACAUUGCUCUCAACAUCUCCCAUCUCUCUGGAUUUCUUUUUGCUUCAUUAUUCCUGCUAACCAAUUCAUUUUCAGACUUUGUACUUCAGAAGCAAUGGGAAAAAUCAGCAGUCUUCCAACCCAAUUAUUUAAGUGCUGCUUUUGUGAUUUCUUGAAGGUGAAGAUGCACACCAUGUCCUCCUCGCAUCUCUUCUACCUGGCGCUGUGCCUGCUCACCUUCACCAGCUCUGCCACGGCUGGACCGGAGACGCUCUGCGGGGCUGAGCUGGUGGAUGCUCUUCAGUUCGUGUGUGGAGACAGGGGCUUUUAUUUCAACAAGCCCACAGGGUAUGGCUCCAGCAGUCGGAGGGCGCCUCAGACAGGCAUCGUGGAUGAGUGCUGCUUCCGGAGCUGUGAUCUAAGGAGGCUGGAGAUGUAUUGCGCACCCCUCAAGCCUGCCAAGUCAGCUCGCUCUGUCCGUGCCCAGCGCCACACCGACAUGCCCAAGACCCAGAAGGAAGUACAUUUGAAGAACGCAAGUAGAGGGAGUGCAGGAAACAAGAACUACAGGAUGUAGGAAGACCCUCCUGAGGAGUGAAGAGUGACAUGCCACCGCAGGAUCCUUUGCUCUGCACGAGUUACCUGUUAAACUUUGGAACACCUACCAAAAAAUAAGUUUGAUAACAUUUAAAAGAUGGGCGUUUCCCCCAAUGAAAUACACAAGUAAACAUUCCAACAUUGUCUUUAGGAGUGAUUUGCACCUUGCAAAAAUGGUCCUGGAGUUGGUAGAUUGCUGUUGAUCUUUUAUCAAUAAUGUUCUAUAGAAAAGAAAAAAAAAAUAUAUAUAUAUAUAUAUCUUAGUCCCUGCCUCUCAAGAGCCACAAAUGCAUGGGUGUUGUAUAGAUCCAGUUGCACUAAAUUCCUCUCUGAAUCUUGGCUGCUGGAGCCAUUCAUUCAGCAACCUUGUCUAAGUGGUUUAUGAAUUGUUUCCUUAUUUGCACUUCUUUCUACACAACUCGGGCUGUUUGUUUUACAGUGUCUGAUAAUCUUGUUAGUCUAUACCCACCACCUCCCUUCAUAACCUUUAUAUUUGCCGAAUUUGGCCUCCUCAAAAGCAGCAGCAAGUCGUCAAGAAGCACACCAAUUCUAACCCACAAGAUUCCAUCUGUGGCAUUUGUACCAAAUAUAAGUUGGAUGCAUUUUAUUUUAGACACAAAGCUUUAUUUUUCCACAUCAUGCUUACAAAAAAGAAUAAUGCAAAUAGUUGCAACUUUGAGGCCAAUCAUUUUUAGGCAUAUGUUUUAAACAUAGAAAGUUUCUUCAACUCAAAAGAGUUCCUUCAAAUGAUGAGUUAAUGUGCAACCUAAUUAGUAACUUUCCUCUUUUUAUUUUUUCCAUAUAGAGCACUAUGUAAAUUUAGCAUAUCAAUUAUACAGGAUAUAUCAAACAGUAUGUAAAACUCUGUUUUUUAGUAUAAUGGUGCUAUUUUGUAGUUUGUUAUAUGAAAGAGUCUGGCCAAAACGGUAAUACGUGAAAGCAAAACAAUAGGGGAAGCCUGGAGCCAAAGAUGACACAAGGGGAAGGGUACUGAAAACACCAUCCAUUUGGGAAAGAAGGCAAAGUCCCCCCAGUUAUGCCUUCCAAGAGGAACUUCAGACACAAAAGUCCACUGAUGCAAAUUGGACUGGCGAGUCCAGAGAGGAAACUGUGGAAUGGAAAAAGCAGAAGGCUAGGAAUUUUAGCAGUCCUGGUUUCUUUUUCUCAUGGAAGAAAUGAACAUCUGCCAGCUGUGUCAUGGACUCACCACUGUGUGACCUUGGGCAAGUCACUUCACCUCUCUGUGCCUCAGUUUCCUCAUCUGCAAAAUGGGGGCAAUAUGUCAUCUACCUACCUCAAAGGGGUGGUAUAAGGUUUAAAAAGAUAAAGAUUCAGAUUUUUUUUACCCUGGGUUGCUGUAAGGGUGCAACAUCAGGGCGCUUGAGUUGCUGAGAUGCAAGGAAUUCUAUAAAUAACCCAUUCAUAGCAUAGCUAGAGAUUGGUGAAUUGAAUGCUCCUGACAUCUCAGUUCUUGUCAGUGAAGCUAUCCAAAUAACUGGCCAACUAGUUGUUAAAAGCUAACAGCUCAAUCUCUUAAAACACUUUUCAAAAUAUGUGGGAAGCAUUUGAUUUUCAAUUUGAUUUUGAAUUCUGCAUUUGGUUUUAUGAAUACAAAGAUAAGUGAAAAGAGAGAAAGGAAAAGAAAAAGGAGAAAAACAAAGAGAUUUCUACCAGUGAAAGGGGAAUUAAUUACUCUUUGUUAGCACUCACUGACUCUUCUAUGCAGUUACUACAUAUCUAGUAAAACCUCGUUUAAUACUAUAAAUAAUAUUCUAUUCAUUUUGAAAAACACAAUGAUUCCUUCUUUUCUAGGCAAUAUAAGGAAAGUGAUCCAAAAUUUGAAAUAUUAAAAUAAUAUCUAAUAAAAAGUCACAAAGUUAUCUUCUUUAACAAACUUUACUCUUAUUCUUAGCUGUAUAUACAUUUUUUUAAAAGUUUGUUAAAAUAUGCUUGACUAGAGUUUCCAGUUGAAAGGCAAAAACUUCCAUCACAACAAGAAAUUUCCCAUGCCUGCUCAGAAGGGUAGCCCCUAGCUCUCUGUGAAUGUGUUUUAUCCAUUCAACUGAAAAUUGGUAUCAAGAAAGUCCACUGGUUAGUGUACUAGUCCAUCAUAGCCUAGAAAAUGAUCCCUAUCUGCAGAUCAAGAUUUUCUCAUUAGAACAAUGAAUUAUCCAGCAUUCAGAUCUUUCUAGUCACCUUAGAACUUUUUGGUUAAAAGUACCCAGGCUUGAUUAUUUCAUGCAAAUUCUAUAUUUUACAUUCUUGGAAAGUCUAUAUGAAAAACAAAAAUAACAUCUUCAGUUUUUCUCCCACUGGGUCACCUCAAGGAUCAGAGGCCAGGAAAAAAAAAAAAAAGACUCCCUGGAUCUCUGAAUAUAUGCAAAAAGAAGGCCCCAUUUAGUGGAGCCAGCAAUCCUGUUCAGUCAACAAGUAUUUUAACUCUCAGUCCAACAUUAUUUGAAUUGAGCACCUCAAGCAUGCUUAGCAAUGUUCUAAUCACUAUGGACAGAUGUAAAAGAAACUAUACAUCAUUUUUGCCCUCUGCCUGUUUUCCAGACAUACAGGUUCUGUGGAAUAAGAUACUGGACUCCUCUUCCCAAGAUGGCACUUCUUUUUAUUUCUUGUCCCCAGUGUGUACCUUUUAAAAUUAUUCCCUCUCAACAAAACUUUAUAGGCAGUCUUCUGCAGACUUAACGUGUUUUCUGUCAUAGUUAGAUGUGAUAAUUCUAAGAGUGUCUAUGACUUAUUUCCUUCACUUAAUUCUAUCCACAGUCAAAAAUCCCCCAAGGAGGAAAGCUGAAAGAUGCACUGCCAUAUUAUCUUUCUUAACUUUUUCCAACACAUAAUCCUCUCCAACUGGAUUAUAAAUAAAUUGAAAAUAACUCAUUAUACCAAUUCACUAUUUUAUUUUUUAAUGAAUUAAAACUAGAAAACAAAUUGAUGCAAACCCUGGAAGUCAGUUGAUUACUAUAUACUACAGCAGAAUGACUCAGAUUUCAUAGAAAGGAGCAACCAAAAUGUCACAACCCAAAACUUUACAAGCUUUGCUUCAGAAUUAGAUUGCUUUAUAAUUCUUGAAUGAGGCAAUUUCAAGAUAUUUGUAAAAGAACAGUAAACAUUGGUAAGAAUGAGCUUUCAACUCAUAGGCUUAUUUCCAAUUUAAUUGACCAUACUGGAUACUUAGGUCAAAUUUCUGUUCUCUCUUCCCCAAAUAAUAUUAAAGUAUUAUUUGAACUUUUUAAGAUGAGGCAGUUCCCCUGAAAAAGUUAAUGCAGCUCUCCAUCAGAAUCCACUCUUCUAGGGAUAUGAAAAUCUCUUAACACCCACCCUACAUACACAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAUUCACCCUAAGGAUCCAAUGGAAUACUGAAAAGAAAUCACUUCCUUGAAAAUUUUAUUAAAAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCUGUCCACCCUUGAGAAUCCUUCCUCUCCUUGGAACGUCAAUGUUUGUGUAGAUGAAACCAUCUCAUGCUCUGUGGCUCCAGGGUUUCUGUUACUAUUUUAUGCACUUGGGAGAAGGCUUAGAAUAAAAGAUGUAGCACAUUUUGCUUUCCCAUUUAUUGUUUGGCCAGCUAUGCCAAUGUGGUGCUAUUGUUUCUUUAAGAAAGUACUUGACUAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAGCAUAGACAUAUUUUUUUAAAGUAUAAAAACAACAAUUCUAUAGAUAGAUGGCUUAAUAAAAUAGCAUUAGGUCUAUCUAGCCACCACCACCUUUCAACUUUUUAUCACUCACAAGUAGUGUACUGUUCACCAAAUUGUGAAUUUGGGGGUGCAGGGGCAGGAGUUGGAAAUUUUUUAAAGUUAGAAGGCUCCAUUGUUUUGUUGGCUCUCAAACUUAGCAAAAUUAGCAAUAUAUUAUCCAAUCUUCUGAACUUGAUCAAGAGCAUGGAGAAUAAACGCGGGAAAAAAGAUCUUAUAGGCAAAUAGAAGAAUUUAAAAGAUAAGUAAGUUCCUUAUUGAUUUUUGUGCACUCUGCUCUAAAACAGAUAUUCAGCAAGUGGAGAAAAUAAGAACAAAGAGAAAAAAUACAUAGAUUUACCUGCAAAAAAUAGCUUCUGCCAAAUCCCCCUUGGGUAUUCUUUGGCAUUUACUGGUUUAUAGAAGACAUUCUCCCUUCACCCAGACAUCUCAAAGAGCAGUAGCUCUCAUGAAAAGCAAUCACUGAUCUCAUUUGGGAAAUGUUGGAAAGUAUUUCCUUAUGAGAUGGGGGUUAUCUACUGAUAAAGAAAGAAUUUAUGAGAAAUUGUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1749.44 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1894.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 1620.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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