Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000804.4
Sequence Length
849 nt
GC Content
0.5830
AGAGCCUGGACCUACAGCGCUGUUGGUGGAGGUCCUGCCUCCAGGAAUAGAUGGACAUGGCCUGGCAGAUGAUGCAGCUGCUGCUUCUGGCUUUGGUGACUGCUGCGGGGAGUGCCCAGCCCAGGAGUGCGCGGGCCAGGACGGACCUGCUCAAUGUCUGCAUGAACGCCAAGCACCACAAGACACAGCCCAGCCCCGAGGACGAGCUGUAUGGCCAGUGCAGUCCCUGGAAGAAGAAUGCCUGCUGCACGGCCAGCACCAGCCAGGAGCUGCACAAGGACACCUCCCGCCUGUACAACUUUAACUGGGAUCACUGUGGUAAGAUGGAACCCACCUGCAAGCGCCACUUUAUCCAGGACAGCUGUCUCUAUGAGUGCUCACCCAACCUGGGGCCCUGGAUCCGGCAGGUCAACCAGAGCUGGCGCAAAGAGCGCAUUCUGAACGUGCCCCUGUGCAAAGAGGACUGUGAGCGCUGGUGGGAGGACUGUCGCACCUCCUACACCUGCAAAAGCAACUGGCACAAAGGCUGGAAUUGGACCUCAGGGAUUAAUGAGUGUCCGGCCGGGGCCCUCUGCAGCACCUUUGAGUCCUACUUCCCCACUCCAGCCGCCCUUUGUGAAGGCCUCUGGAGCCACUCCUUCAAGGUCAGCAACUAUAGUCGAGGGAGCGGCCGCUGCAUCCAGAUGUGGUUUGACUCAGCCCAGGGCAACCCCAAUGAGGAGGUGGCCAAGUUCUAUGCUGCGGCCAUGAAUGCUGGGGCCCCGUCUCGUGGGAUUAUUGAUUCCUGAUCCAAGAAGGGUCCUCUGGGGUUCUUCCAACAACCUAUUCUAAUAGACAAAUCCACAUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-322.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -335.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 263.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.((.((.....(((((((..(((((((...)))))))..))))).)).....)))).)))....((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((.(.((((...((((((.(((((.(((((((.((..(.(((.........))).)..))))..............(((((.(..((....))..).))))).))))).))))).).)))))........(((.....)))(((((....(((((((((((.(((.....(((((((((((((..............((((.(((((......)).)))..))))......((((((((...(((((((..(((..((.....))..)))..((((...))))..)))))))..((((.((....(((((...((((.....)))).))))).)).))))(((.(....).)))...))).))))))))))))))..))))))).))))).((..(((....)))..)).......))))))....((((((((........)))).)))))))))))))))))))))))......((((...)))).....((((((..(((.........)))..))))))............))))).)))....))))..))))))))).))))))))((.((((((((((.....(((...)))(((((((((((((.((.((((..((((...((....))...)))).....)))))).))))))((((((...)))))).(((((.....)))))...)))))))...........((((....)))).)))).)))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,(((,({.{{..,,,{|||(((,.(((((((...)))))))..}}}}}.||,...,||||.}||,,,,((((((((.(((({(((((((({{{(({((({((({((((.{.{|||.||{|||{|||{|{{||||||||,|}}.|}})},,...||||}}..|...}})}.},.,,....,..{,,{{.,,{((,,,,||,{,.}}|||.{|||{.(((((({.,,,{{..........|}.}}}})}})))}},}.(((((((((((.(((.....(((((((((((((..............((((.((,((......)}.}})}.))))......((((((((...(((((((..(((..((.....))..)))..((({...}))),.)))))))..((((.((....(((((...((((.....)))).))))).)).))))(((.(....).)))...))).))))))))))))))..))))))).))))).,,..(((....)))..|},......))))))...{((({{(((,,,,,,,,|||}.}|||}||{{|||||||}}|||||,,,,,,((({,..,,,,.....{(((((..(((,{{...,,.)))..)))))).,.||||||,.,})}}}.,,},,..}}})},))))))))).}|}|}}}}{{.{{{{||{{{|.,,,,|{{.,|||},(((((,,{{{||.||,((((.{(({{..,||,..,)),,.},,}}},,,)))))),}}}})){|||||,,,}}}))))|||||,....}})))}}}})))))}...,,......{{{{....}})).}}}}.}}}}}).)}
Back