Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000904.6

Sequence Length

1073 nt

GC Content

0.5508

GCAGGUUCCGGGCUGCUUAGGUUGGCACCGGUCCGUGGUCCCCGGGGGCGCAGUCGCAGCGCUCCCGCCCUCCAGGCGUCAGCGAGUGCGCGGUCCAGUGCGGCCGGAACCUGGCGCAACUCCUAGAGCGGUCCUUGGGGAGACGCGGGUCCCAGUCCUGCGGCUCCUACUGGGGAGUGCGCUGGUCGGAAGAUUGCUGGACUCGCUGAAGAGAGACUACGCAGGAAAGCCCCAGCCACCCAUCAAAUCAGAGAGAAGGAAUCCACCUUCUUACGCUAUGGCAGGUAAGAAAGUACUCAUUGUCUAUGCACACCAGGAACCCAAGUCUUUCAACGGAUCCUUGAAGAAUGUGGCUGUAGAUGAACUGAGCAGGCAGGGCUGCACCGUCACAGUGUCUGAUUUGUAUGCCAUGAACCUUGAGCCGAGGGCCACAGACAAAGAUAUCACUGGUACUCUUUCUAAUCCUGAGGUUUUCAAUUAUGGAGUGGAAACCCACGAAGCCUACAAGCAAAGGUCUCUGGCUAGCGACAUCACUGAUGAGCAGAAAAAGGUUCGGGAGGCUGACCUAGUGAUAUUUCAGUUCCCGCUGUACUGGUUCAGCGUGCCAGCCAUCCUGAAGGGCUGGAUGGAUAGGGUGCUGUGCCAGGGCUUUGCCUUUGACAUCCCAGGAUUCUACGAUUCCGGUUUGCUCCAGGGUAAACUAGCGCUCCUUUCCGUAACCACGGGAGGCACGGCCGAGAUGUACACGAAGACAGGAGUCAAUGGAGAUUCUCGAUACUUCCUGUGGCCACUCCAGCAUGGCACAUUACACUUCUGUGGAUUUAAAGUCCUUGCCCCUCAGAUCAGCUUUGCUCCUGAAAUUGCAUCCGAAGAAGAAAGAAAGGGGAUGGUGGCUGCGUGGUCCCAGAGGCUGCAGACCAUCUGGAAGGAAGAGCCCAUCCCCUGCACAGCCCACUGGCACUUCGGGCAAUAACUCUGUGGCACGUGGGCAUCACGUAAGCAGCACACUAGGAGGCCCAGGCGCAGGCAAAGAGAAGAUGGUGCUGUCAUGAAAUAAAAUUACAACAUAGCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-381.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -402.93

Frequency: 0.0000

Diversity: 340.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((.((((...(((((((((((..((.(((....(((((((((.......)))))))))....))).).)....)).)))).))).))...))))))))))))))(((((.(((((....((((.....(((((.((((((.......)))))).)))))))))))))))))))((((.((....(((((((.(((........))).))).)))).....))...))))..............(((((((......)))))))..((((((....((((((.((((((..((.(((.(((.(((((....(((...((((((..(((((.(.........(.(((...((.(((.(((((..(((((((((......((((((.((.((((.....(((((((....(((....(((((((((((...(((.((((...(((.((((......((((((((((((..........((((....)))))))))))....((((((..(((((((..(((.((((.(((..((((........))))((.(.(((((.((((((......((((....)))))))))).))))).).))..((((((.........)))))).))))))).))))))))))))))))((((((((((.(.(((.((...)).)))((((((((....))))))))...(((.((((((((....))))))))...))).).)))))...))))).)))))......)))))))...))))))).)))))))).))))))))))))).)))).))..))))))......)).))))))).))))).))).))..))).).......).))))).....))))))..)))..))))).((((((((((((((.((((((..((.....(((.((......)).)))........((((((((.(((...(((......))).))).)).)))))).....))..))))).).)).)).))))...))))))))).))).))...)))))).))...........))))..))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

(({(({.{{(((((|({,,({,,(({,{{{,,,({((({{..{((((((((.......))))))))(((.....))).(((((((((.(((((((..,({({{((({...)))||||,.||{(({{.(((.(((({{(((((.((((((.,...,.)))))).))))}.})))))).))),))))..}...)))))).).)))))))))...}.)})))}}{{|{,..||,,|{||{{{,,.{{......,.(((((((......)))))))..((,{,({({{(((,,..,,|||}..|}}||{.,||.,,,,({{{.(({...{{{{{{..{||,|,}},},.,...}}|||,|,{{.(((.(((((..(((((((((......((((((.{{.{(,..{({.{((((((....{,{....(((((((((((....(((((((((((((.,.((((({..,((({.((((((({.,,...,,{|}|}}}})||.{{.((((........}))).}}|}|{{.((..((((...)))).)),,....})),}.))))))..,)}),)))))))))){{||...,||||..{{{{,.|||||.{((..((((((.......,.))))))....)})||||,|||||,((((((((((.((((..((.(((.((...)).)))))..)).)).)))))))}..,}},||.{{((((((....))))))))}}})))||,||,,,...,{{{(,{.{{{|||...,..})})))}).,.}}},)))))))).))),}})))))))})}}},)}..))))))......)))))}}))).))))).))),})},}}}})}}..{{{|{,,|||,,{..,,,,,,.,||||||||}||((||||||||(((({(({,,,.,,)).))))},.,,..,}}})),)))))}{{.,,({{,,|||}|{|}},|||},,,..}}|{||},||,||||}}.,}}}}}..}}}}},}.}},)).}}})}.,),)).,))....,...,.,}}}|||{|..{{........}},},.,)}}))..