Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000970.6

Sequence Length

921 nt

GC Content

0.4593

CUCUUUCCCAUCUUGCAAGAUGGCGGGUGAAAAAGUUGAGAAGCCAGAUACUAAAGAGAAGAAACCCGAAGCCAAGAAGGUUGAUGCUGGUGGCAAGGUGAAAAAGGGUAACCUCAAAGCUAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCAUUGCAGCCGCAACCCUGUCCUUGUCAGAGGAAUUGGCAGGUAUUCCCGAUCUGCCAUGUAUUCCAGAAAGGCCAUGUACAAGAGGAAGUACUCAGCCGCUAAAUCCAAGGUUGAAAAGAAAAAGAAGGAGAAGGUUCUCGCAACUGUUACAAAACCAGUUGGUGGUGACAAGAACGGCGGUACCCGGGUGGUUAAACUUCGCAAAAUGCCUAGAUAUUAUCCUACUGAAGAUGUGCCUCGAAAGCUGUUGAGCCACGGCAAAAAACCCUUCAGUCAGCACGUGAGAAAACUGCGAGCCAGCAUUACCCCCGGGACCAUUCUGAUCAUCCUCACUGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGUGGUUUUCCUGAAGCAGCUGGCUAGUGGCUUAUUACUUGUGACUGGACCUCUGGUCCUCAAUCGAGUUCCUCUACGAAGAACACACCAGAAAUUUGUCAUUGCCACUUCAACCAAAAUCGAUAUCAGCAAUGUAAAAAUCCCAAAACAUCUUACUGAUGCUUACUUCAAGAAGAAGAAGCUGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGUGAGAUCUUCGACACAGAAAAAGAGAAAUAUGAGAUUACGGAGCAGCGCAAGAUUGAUCAGAAAGCUGUGGACUCACAAAUUUUACCAAAAAUCAAAGCUAUUCCUCAGCUCCAGGGCUACCUGCGAUCUGUGUUUGCUCUGACGAAUGGAAUUUAUCCUCACAAAUUGGUGUUCUAAAUGUCUUAAGAACCUAAUUAAAUAGCUGACUACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-247.84 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -265.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 272.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((....))))))(((((...................................))))).((((.....)))).....(((((((((((......(((((.........(((....))).......((((...))))..(((....))))))))..)))))))...(((((((((((((.......))))))))...)))))......)))).((((........))))((((((...........)))))).........))))))).(((((((.((..((((.......(((((.((.(((((..((((....(((.((((((.(((....(((((((..................(((((((((..(((.(((((......))))).)))((.......))))))))).))...((......)))))))...))....)))))))))))).))))..))))))).))))).....))))..))....((((....((((....(((((((((((((.((.........)).))))).))((((((......(((((.....)).))).......))))))..(((..((((((....((..........)).....))))))..))).........((((.....))))....((((.....)))).)))))))))))))).((((((((....(((((...(((......)))...................((((((((((((.(((((..(((..((((.(((........(((((....)))))...((((.......))))))).))))..)))))))))))).))))))))................)))))...))))))))............)))))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{({{{,((((((....))))))(((((.......{{.,,.,,,......||..,,.......))))}..,,,.....|||{({..,,((((((({(({{....((({{..,||....(((....))).......((((...)))).,(((....)))}}|||{{|{(({(,{{{(((((((((((((.......))))))))...}},||,,...{{({{.((((,,,,,...|||}{{(((({{{,...{{..|||||,...........{{(((({..{{{{|((..((((.......(((({,((.(((((..((({..,.(((.((((((.(((....{{{{(({...|}}..,|......,.,,{((((((..{((.(((({..,,,.}}})).)})||,......,,))))))}.,|,..{|,,....,}}))}},..,},...)))))))))))).))))..)))))}),))))).....))))..))..}))}}}..)))))))...,}}}))))|)||}}}|}..,,.}}}}}|}}}||,|||||))|.|,|...,|}|}}}}})),}}),}|,}.}}}},|,..,,,,,||||||}}}}}}}}}}......,...{{{||,|||,.....,.......{{((,,.,,|}}|(((.((((.....)))))))){{,||,,}}}|.,.((((.,...)))).|.|||||......},..,,}},.....,,,},},.(((((((((((,,(((((..(((..((((.((({.......,{{{{....,}}},...,{{{.......))))))).))))..))))))))))))}}}))))))......(({.....))),,...{(((((.(((((.,.....,}.))))))))))).....}}}}}......