Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000973.5

Sequence Length

845 nt

GC Content

0.6047

CUCUUUCGGCCGCGCUGGUGAACAGGACCCGUCGCCAUGGGCCGUGUGAUCCGUGGACAGAGGAAGGGCGCCGGGUCUGUGUUCCGCGCGCACGUGAAGCACCGUAAAGGCGCUGCGCGCCUGCGCGCCGUGGAUUUCGCUGAGCGGCACGGCUACAUCAAGGGCAUCGUCAAGGACAUCAUCCACGACCCGGGCCGCGGCGCGCCCCUCGCCAAGGUGGUCUUCCGGGAUCCGUAUCGGUUUAAGAAGCGGACGGAGCUGUUCAUUGCCGCCGAGGGCAUUCACACGGGCCAGUUUGUGUAUUGCGGCAAGAAGGCCCAGCUCAACAUUGGCAAUGUGCUCCCUGUGGGCACCAUGCCUGAGGGUACAAUCGUGUGCUGCCUGGAGGAGAAGCCUGGAGACCGUGGCAAGCUGGCCCGGGCAUCAGGGAACUAUGCCACCGUUAUCUCCCACAACCCUGAGACCAAGAAGACCCGUGUGAAGCUGCCCUCCGGCUCCAAGAAGGUUAUCUCCUCAGCCAACAGAGCUGUGGUUGGUGUGGUGGCUGGAGGUGGCCGAAUUGACAAACCCAUCUUGAAGGCUGGCCGGGCGUACCACAAAUAUAAGGCAAAGAGGAACUGCUGGCCACGAGUACGGGGUGUGGCCAUGAAUCCUGUGGAGCAUCCUUUUGGAGGUGGCAACCACCAGCACAUCGGCAAGCCCUCCACCAUCCGCAGAGAUGCCCCUGCUGGCCGCAAAGUGGGUCUCAUUGCUGCCCGCCGGACUGGACGUCUCCGGGGAACCAAGACUGUGCAGGAGAAAGAGAACUAGUGCUGAGGGCCUCAAUAAAGUUUGUGUUUAUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-331.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -348.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 287.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..((((((((((((((((((((((.((((.....((.(((.........)))..))...)))).))))))).))))).(((((((((((.(((.((.....)).))).))))..))))))).(((((((.((((..(((((.((((........((((((((((..(((.....)))..)))((((((...(((((((((((((((..((((((....(((..(((((.(((.((....)).)))))))).)))......))))))...)))........(((((..(((((........)))))..)))))...........((((..((((((.....))))))..)))).))))).......)))))))))))))(((((((((((((((.(((.((((.(((.((.((((..((((((..........................))))))...........)))).))..)))))))...)))))))....))))).))))))((((((.((....)))))))).((((((((.((((((..(((((..((.....(((((((((.(..((((((((..((.((..................)).))..))))))).)..).))))))).))(((((.....)))))....(((....)))(((((...)))))..))..)))))....))))))))).)))))..)))))))..)))))))))..)))))))).)))...(.((((..((((.....)))).)))).))))).....)))).)).))))))).............(((....(((((.......)))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

....{{(((({(,((.{((((((((...(((((((,.((((((({{.(((((.((((..((((..({((((((((((((.({...(((((((((((.(((.((.....)).))).))))..)))))))(((((((.{{.{(,.{(({,..,{((.......,)}).}}))},.})}....))))))))).)))))).)))))).)}))))((({...})))..)))))))))}}...))))))).,..))}}))))..))))))))})),|}}|||(((((,,(((((((((((((((,{,...(((({{{..(((({({,(({......((((..(((({(,....))))))..)))),|||(((,{,..,,||||||{|||.|{{{{{{{||||{{{{.|||,{|||||||,||,{(((,.((((((......,.....,.............))))))...,.......)))),)),})}})))),,.))))}}||,...||||,||||}}}{((({.({.,,{,|,,||}}||{||{{||||||||||||||....||......,,.||||,..})}|}|))||||{{|||||,......,|||..,.{(({.,,.|{(((((({......,,,)))))))}....}}}}||||,|}.{((....))}(((((...))))).|}},,,}})}..}}})))},},,,|||(|(,{{||||||,||}|||.||,.,|||}}}}),.))))})),.))}))}}})).}|||||.|{},,.}}.,,,},,}{|{},||........}}..)}}||||,,}))},.....}})))))}..))))).