Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000986.4
Sequence Length
560 nt
GC Content
0.4661
CUUUCUUUUCGCCAUCUUUUGUCUUUCCGUGGAGCUGUCGCCAUGAAGGUCGAGCUGUGCAGUUUUAGCGGGUACAAGAUCUACCCCGGACACGGGAGGCGCUACGCCAGGACCGACGGGAAGGUUUUCCAGUUUCUUAAUGCGAAAUGCGAGUCGGCUUUCCUUUCCAAGAGGAAUCCUCGGCAGAUAAACUGGACUGUCCUCUACAGAAGGAAGCACAAAAAGGGACAGUCGGAAGAAAUUCAAAAGAAAAGAACCCGCCGAGCAGUCAAAUUCCAGAGGGCCAUUACUGGUGCAUCUCUUGCUGAUAUAAUGGCCAAGAGGAAUCAGAAACCUGAAGUUAGAAAGGCUCAACGAGAACAAGCUAUCAGGGCUGCUAAGGAAGCAAAAAAGGCUAAGCAAGCAUCUAAAAAGACUGCAAUGGCUGCUGCUAAGGCACCUACAAAGGCAGCACCUAAGCAAAAGAUUGUGAAGCCUGUGAAAGUUUCAGCUCCCCGAGUUGGUGGAAAACGCUAAACUGGCAGAUUAGAUUUUUAAAUAAAGAUUGGAUUAUAACUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -170.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((.((..........((.((((((((((((.....)).)))(((((...(.....((((((...........((((....)))).((((...))))......((.((((((((((((..(((((.......)))))..)))..))))))))).))...((((...))))..(((.....)))(((((((((.....................))))))))).(((....)))...........)))))))..)))))....((((....((((((((.....(((.....))).....))))))))....))))((((....))))........(((((..((((......(((...(((((((((.(((..((......(((..(((..((((((....))).)))....))))))......)).))).....)))))).))).)))......))))..)))))..........))))))).)))).)))))))))..((((...)))).((((.(((((((....))))))).)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,(((((.((((((((,(({..,{{((.((({{{,||.||.{||{..{((({{((((({{{.((((((.,....,,,..((((....)))).((((...)))),{((((,,..,,,,}}}}}||{{(((({,....{(|...,)},.{{{{|..{((((({...,})))))..),)))},|...,,)))(((((((({{{......,...........,))))))))).{{{....}}}....}}...,.)))))).,{((((((..(((((....((((((((.....(((.....))).....))))))))....)))))..,...(((((((((.,...,.{{,...,,,..,.}))).)))))||||||..,..,{{.......||}.,}}.,)).......,}))))))..}}))|{{({{{..,|,,,,,.}...)))))),)).,}))))))))).)))))|,{,{(...{((((.((((((((,...})).)))....)))))))),))}|{{,.(((((({....})))))).})},.........
Back