Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001001502.3

Sequence Length

1555 nt

GC Content

0.6585

AGAGCUGCCGCAGCGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCGCGCGAGCUCGCAGGGCGCGAGGAACGAGCGGUGGCUGGCUACGCACCCGAGACCCGGGCACUGCUGCGCUCCUGCUCAGGACCCGCGACCCGAGCGCCUGAUCCCGGCCCUAUCCCCCCUCCGGCCCCUGGUCCACCCCGGCCUGGCCUAGCGGAGCCCCCGCGUCCGCCCGCCGCAGCCGCCGCUCCAUCCCCAGCCCCGGCCCCGCAUCCAGGCGGGUCCUGGAUAUUCGCGCCGAACCCAGCACUCCGGUUCGACGGGGCUGCAGUUUGCAGGGCCCGGAUAACCGAGGCAGUGGCCCCUCCCGCGUCCCCAGGUUUCAAGGACGCUAGGACUCUCCGCGGCCCUGAGGCUUCGCACUGGGGAGUGGGGCCGCCAGGAUGGACGUGUUCAUGAAGGGCCUGUCCAUGGCCAAGGAGGGCGUUGUGGCAGCCGCGGAGAAAACCAAGCAGGGGGUCACCGAGGCGGCGGAGAAGACCAAGGAGGGCGUCCUCUACGUCGGAAGCAAGACCCGAGAAGGUGUGGUACAAGGUGUGGCUUCAGUGGCUGAAAAAACCAAGGAACAGGCCUCACAUCUGGGAGGAGCUGUGUUCUCUGGGGCAGGGAACAUCGCAGCAGCCACAGGACUGGUGAAGAGGGAGGAAUUCCCUACUGAUCUGAAGCCAGAGGAAGUGGCCCAGGAAGCUGCUGAAGAACCACUGAUUGAGCCCCUGAUGGAGCCAGAAGGGGAGAGUUAUGAGGACCCACCCCAGGAGGAAUAUCAGGAGUAUGAGCCAGAGGCGUAGGGGCCCAGGAGAGCCCCCACCAGCAGCACAAUUCUGUCCCUGUCCCUGCCCCGCCCCCCAGAGCCAGGGCUGUCCUUAGACUCCUUCUCCCCAAUCACGAGAUCUUCCUUCCGCUCUGAGGCAACCCCCUCGGAGCCUGUGUUAGUGUCUGUCCAUCUGUCUGUCCUACCCGCCCGCGUCCAACCCCGGGGCAUGGACAGGGCCAGGGUUGCGGUCGCGGCUGGGAGCCUCGCCCCUCCAGUGUUGCCUCCUCCCAUCCAGCGUCUGCGCGGAUGUAGCAUGUUCUAUGUGUUUUUAAACGAAGAUCCGAGCGACGGCUCCUCCCCGAUCCCCGACAGUGGCUCUCCAAGCGGCCCCCGGGCAGCCCCAGAGCACCCCGCCCGACUCCCAUUAACCUCGAGAACCUUUUUUUUUUUAACCAAAACCAGGAGCCAGGCUGUGCCAUGUCCCCCGCCCCCCAUCCCAGCCGGCCCGGUCCGAACGCGGGCGUCGUGUGUUGUGAUUGUGGCAUGGAGAGUCCCCAUCCCCCCCAUGUGAGCGUGUCCCGGGCGGGUGGGCCCGGCCGCCCCCGAGAGUCCAUGAAUAAAGCUAAUCUGUCUGUAGCCAGAGCCGCACCGGCAGGGCUGGGCUGGGCGCCGGGUGGGGGCGACACGUGGCGGCGAGUCUUCCAGGUCCCAGCCUACCCCUCUGUGCUCUUUGGGGUCUGGCACACACAGCCCAGGUACAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-666.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -691.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 402.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((((((((((((((((...((.(((((...(((.((((.((.(.((((.((((((.((((.(((((((((.((((((.((....))))..)))).))))))).)).))))))....).))))))).))).)))))))...)))))))..)))...((((((((((((((......((((.((((...(((((((....)).)))))..))))..))))..(((((((((((((...((((((((.(((((((.....)))))))........((((((.........)))))).)))))))).(((((.(((((((((((.......(((....)))(((...((((((...........)))))).)))....)))).)))))))))))).....))))))).)))))).))))))(((((((.((((.....)))).)))))))))))..))))))))))))))))))..........(((...(((((((.(((.((((.((.((....((((..(((((((..((.(((((((((.........))).......((((((((..((.(((((((..(((.((((((((..((((...............((((((..((.(.((.(((((((((...........((.(((((...)).))).))...(((((.....)))))(((..((((....))))...))).((((.((..(((((((.(((.((((((..((.((.((....)).))))...((((.(.(((.....))).).)))).((.(((...((.((((...(((((.((((((.((((((....(((.((.((((((.(((.(.((((((((.((((((((.(((((((.........((..((((.((...(((((....((((.........))))..........(((((((((......)))))))))........(((......)))..)))))....))..)))))).........))))))).)))))))).)))))))).).).)))).)))).))))))))))).......))))))....(((((.(((....))))))))..((.((.(((.(((........))).)))..)).))...)))))))))..)))))))..)))))).))).).))))))..)))))).))))))))).)).).))....)))))).............))))..)))))))).)))......))))))).))))))))))(.(((((((((((((.(((((((.(((((((....)).)))))((((.((((.((.....(((((((((.((.............((((.((.(.(.((..((((((.((....)).))))))..)).))))))))............)).))))).))))..)).))))))))..))))))).))))....))))))))))...)))))).))...))))))).))))....))..)))))).))))))))))(((.(((.......)))))).)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,.(((((((((((((((({...((.(((((.{,(((.((((.((.{.((((.((((((,{(({.(((((((((.(((({{.((....}),}..)))).))))))).)).))))))...,}.))))))},})).))))))).,.)))))))..)))..,((((((((((((((......((((.((((...(((((((....)).)))))..)))}..))))..(((((((((((((..,{(((((((,{(({(({,,,,.))}))}}..,{{.,.(({{{{........,)))))).))))))}|{(((((.(((((((((((.....{.(((....)))||({{.((((((...........))))))..)),...)))).))))))))))))..}}.))))))),)))))).))))))(((((((.((((.....)))).)))))))))))..)))))))))))))))))),..,,.....,||...(((((((.(((.((((.((.((....((((..(((((((..((.(((((((({.......,,|}}....}|,(((((((,.,((.(((((((.,(((.((((((((..((((..,,{{.........((((((,.((.(.((.(((((((((.,,,....{|.((.(((((...)).))).))...{((((,...}))))|(((..((((....))))...))),((((.((..(((((((.(((.((((((.{((.((.((....)).))|,,..(((({{.(,,..,.{||,.|.,}}}{((((((((({,.((({...{.(({.{{|||..,(((((....{{{.||,||{{((,((,{(.((((((((.((((((((.(((((((.......{,((..((((.({...(((((....{{{{.........}|||.,,.......(((((((((......)))))))))....,..||.|.,,,..,....)))))....}}..)))))).},......))))))).)))))))).)))))))).,,).))}),)))).))))))))})))).))))).))))))..(((((.(((....))))))))..((.((.(((.{((........))).)))..}}.))...)))))))),.}..}}},),,)))))).))).}.}))))).,)})))).))))))))).)).,.)).,..))))))........,.,..))))..)))))))).)))....,.))))))).)))))))))){.((((((((({{{{.((((((({(((({(({{,.,,.)))))((((.({({,{{,.,{.(((((((((.{{..,{{{,{{.,,.((((.,,.|,|,,,..|||,||}||}}..}}|))))}}.,)}.}}}})))}............)).))}}).)))).})},)))))))).})))))))}))))....)))))))))),,,}))))).)).,.))))))).))))....))..)))))).))))))))))(((.(((.......)))))).}}}......