Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001001569.2

Sequence Length

1808 nt

GC Content

0.5398

GAGCGGAGGAGACCCUGCGGCGCGCGGCGGCGGCUCCCGGGCGUCCCGGGCCCGGUGGCGGCGCGGCUGUGGUUGGCUGAGCGCCGCGGGCCGCCCCCCGCCCGCCCCCUCCCCUGCUCCCCUCCCCCGCCUCCCGCGGCGGCUGGCGUCGGGAAAGUACAGUAAAAAGUCCGAGUGCAGCCGCCGGGCGCAGGAUGGGAUCCGGCUCCUCCAGCUACCGGCCCAAGGCCAUCUACCUGGACAUCGAUGGACGCAUUCAGAAGCACUCCGUACAAAGUGAGACCUGUGGCCAUCAAGCAACUCUCCGAGCAUUCAAAAUCAAUGAACUGAAAGCUGAAGUUGCAAAUCACUUGGCUGUCCUAGAGAAACGCGUGGAAUUGGAAGGACUAAAAGUGGUGGAGAUUGAGAAAUGCAAGAGUGACAUUAAGAAGAUGAGGGAGGAGCUGGCGGCCAGAAGCAGCAGGACCAACUGCCCCUGUAAGUACAGUUUUUUGGAUAACCACAAGAAGUUGACUCCUCGACGCGAUGUUCCCACUUACCCCAAGUACCUGCUCUCUCCAGAGACCAUCGAGGCCCUGCGGAAGCCGACCUUUGACGUCUGGCUUUGGGAGCCCAAUGAGAUGCUGAGCUGCCUGGAGCACAUGUACCACGACCUCGGGCUGGUCAGGGACUUCAGCAUCAACCCUGUCACCCUCAGGAGGUGGCUGUUCUGCGUCCACGACAACUACAGAAACAACCCCUUCCACAACUUCCGGCACUGCUUCUGCGUGGCCCAGAUGAUGUACAGCAUGGUCUGGCUCUGCAGUCUCCAGGAGAAGUUCUCACAAACGGAUAUCCUGAUCCUAAUGACAGCGGCCAUCUGCCACGAUCUGGACCAUCCCGGCUACAACAACACGUACCAGAUCAAUGCCCGCACAGAGCUGGCGGUCCGCUACAAUGACAUCUCACCGCUGGAGAACCACCACUGCGCCGUGGCCUUCCAGAUCCUCGCCGAGCCUGAGUGCAACAUCUUCUCCAACAUCCCACCUGAUGGGUUCAAGCAGAUCCGACAGGGAAUGAUCACAUUAAUCUUGGCCACUGACAUGGCAAGACAUGCAGAAAUUAUGGAUUCUUUCAAAGAGAAAAUGGAGAAUUUUGACUACAGCAACGAGGAGCACAUGACCCUGCUGAAGAUGAUUUUGAUAAAAUGCUGUGAUAUCUCUAACGAGGUCCGUCCAAUGGAAGUCGCAGAGCCUUGGGUGGACUGUUUAUUAGAGGAAUAUUUUAUGCAGAGCGACCGUGAGAAGUCAGAAGGCCUUCCUGUGGCACCGUUCAUGGACCGAGACAAAGUGACCAAGGCCACAGCCCAGAUUGGGUUCAUCAAGUUUGUCCUGAUCCCAAUGUUUGAAACAGUGACCAAGCUCUUCCCCAUGGUUGAGGAGAUCAUGCUGCAGCCACUUUGGGAAUCCCGAGAUCGCUACGAGGAGCUGAAGCGGAUAGAUGACGCCAUGAAAGAGUUACAGAAGAAGACUGACAGCUUGACGUCUGGGGCCACCGAGAAGUCCAGAGAGAGAAGCAGAGAUGUGAAAAACAGUGAAGGAGACUGUGCCUGAGGAAAGCGGGGGGCGUGGCUGCAGUUCUGGACGGGCUGGCCGAGCUGCGCGGGAUCCUUGUGCAGGGAAGAGCUGCCCUGGGCACCUGGCACCACAAGACCAUGUUUUCUAAGAACCAUUUUGUUCACUGAUACAAAAAAAAAAAAAGGAAUUCAUGAUGCUGUACAGAAUUUUAUUUUUAAACUGUCUUUUAAAUAAUAUAUUCUUAUACGGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-602.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -638.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 395.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((.((..((((.(((.((.((((((((((((((.......))))))..((((((((((((....)))))..))))))))))))))).)))))))))............((((.(((..((((.....(((((((((...(((((................)))))...)))))))))))))..))).))))...))))))))).((((...(((((.(((..(((.((((.(((..(((((.((((........((((........)))).....)))).)))))..((((((.((..(((.((((............)))).)))))))))))..(((((((....(((((...((..(.....)..))...)))))...)))))))(((((((((((((((((....)).))))..((((.((.((((((..((((...)))).....(((((((...(((((((((...((((((.((((((........))))))(((((....))))).(((((.....((((.....))))......((((....)))).))))).((((((...(((((((((.......))).))))))))).)))......(((((((((.(.(((((.((....)).))..((((.......))))))).).)))))))))....)))).))...)))).)))))..)))))))(((...)))................)))))).)).)))).(.(((.((....))))).)((((((.((((...)))).)))))).))).))))))))((((...((((........)))).))))((((((..((.(((((((((........(((((((((....................)).)))))))...(((((..((((((((.(((((((((....(((....)))...((((((..((((.........))))..))))))..((((((....(((.((.(((.((...(((((..(((....((((.((((((......)))))).))))......(((((((...(((((.(((((.((((......)))).((((........))))((((((.(......(((.((.(((((((.(((((....((..(....)..))))))).)).(((((((.......((((.((((((((((((...(((((((((((.((...........))))))))))))).....))))))).......))).)).)))).......)))))))...(((((.....((((((.(((..........)))...))).))))))))..((((((...))))))..))))).)).))).........).)))))).))))).)))))(((((...((((((.......(((.((((.((((..((((((..(((....)))..))).)))..)))).))))))).......)))))).)))))...(((.......)))...(((((((.(((.((....)).))).))).........))))...)))))))......)))..))))).))))))).)))...)))))))))).)))))))))))))..))))))))))..)))))).))))))..))).))))..)))...))).)))))...))))..........((((..((((........((((((........)))))).........))))..))))...(((((.(((((..((((((((((......)))))).)))).)))))..)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((.((((.....((((.(((.((.((((((((((((((.......))))))..((((((((((({....}))))..))))))))))))))),)})))))))...)))).)))))).,.(((((((((({((.(((((((((,{.(((((....,...........))))).,,)))))))))}).).))).))))..(((((((((((..{....((((...)))),{({.,{..,....,(((((.((((....,...((((........)))).....)))).)))))..((((((.{{..(((.((((............)))).))))}))))))..(((((((....(((((...,,..{.....,..}}...)))))...)))))))}}},,},....{(((({....}).)))}.....,,,)..)))))))))))..,(((((({(.((((..(({,(..(((((((.,((.((((((((((........))))))))))))|(((((..(((..{((((((((.....{{.((..(((((((((({.{.(((..(((.((((((,({({{{|{{{{....,,,|||.|||}}|,|{(({{{{{{..(((((((((.(.(((({,{(.,..{{.{{..,.,...}}}}}}}))))).).)))))))))...{(((,,,....}}||,(({{(,({{((({.((({{.{{|..{{{|||,,,,}.,,|||||....,{{{{.{{{,(((,,,(((((.(({{(((((.((((...)))).)))))))}.}))}|{{,,|{{((,,,{{{{........||||.,}}},,|||...{||.,(((({....,|||,,((((((({(......|,...,........)).)))))))...(((.((.....)).)))||,|,|||....{(((.((((({.,((((((..((((.........))))..)))))).,(((((....(,{(((((.(((.,..(((((((...,....((((.((((((......)))))).)))),{{{{....}}},..((((,,(({......|)))}))}||||,|,....,,}),,|(((({...,))))}..)))))))..)))))).))))..)))))|{({........)))},,||||,.,{||,......,{{{,{{{{{(((((((.,,(((((((((((.((...........)))))))))))))..,,.))))))}..}}}},},,)))})))}.,.)))))).)))}}}})),.,.,)})))),,,,)}}},))))}.,))),..,)).}}}..(((....)))...}}))))))}.{{{{{,,,{{{,||.,,,||,|,,,.}.,,)))}),},.(((((((...((((((.......(((.((((.((((..((((((..(((....)))..))).)))..)))).)))))))...,...)))))).))))))).,,|.......}})}}))))}))}}}}.))))))..)))...)))}.}.))))),,))))..)).}}......))))..)))),}.,))).)))))}..)))))))..)))))))).))))))).}((((.((((...(((((((((...)))))))))....).))))))){((((.....)).))}......((((..((((........((((((........)))))).........))))..))))....{(((.(((((..((({((((({......)))))).})}}.)))))..))}))}..