Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001001570.2

Sequence Length

2033 nt

GC Content

0.5401

GAGCGGAGGAGACCCUGCGGCGCGCGGCGGCGGCUCCCGGGCGUCCCGGGCCCGGUGGCGGCGCGGCUGUGGUUGGCUGAGCGCCGCGGGCCGCCCCCCGCCCGCCCCCUCCCCUGCUCCCCUCCCCCGCCUCCCGCGGCGGCUGGCGUCGGGAAAGUACAGUAAAAAGUCCGAGUGCAGCCGCCGGGCGCAGGAUGGGAUCCGGCUCCUCCAGCUACCGGCCCAAGGCCAUCUACCUGGACAUCGAUGGACGCAUUCAGAAGGUAAUCUUCAGCAAGUACUGCAACUCCAGCGACAUCAUGGACCUGUUCUGCAUCGCCACCGGCCUGCCUCGGAACACGACCAUCUCCCUGCUGACCACCGACGACGCCAUGGUCUCCAUCGACCCCACCAUGCCCGCGAAUUCAGAACGGAAUGAGCUCAUUCUCUAUACAUCACUCCGUAACUUGUUGUUUUUACCUAGUAAGGAGUCAUGGGCGUCCCACCAGCACUCCGUACAAAGUGAGACCUGUGGCCAUCAAGCAACUCUCCGAGCAUUCAAAAUCAAUGAACUGAAAGCUGAAGUUGCAAAUCACUUGGCUGUCCUAGAGAAACGCGUGGAAUUGGAAGGACUAAAAGUGGUGGAGAUUGAGAAAUGCAAGAGUGACAUUAAGAAGAUGAGGGAGGAGCUGGCGGCCAGAAGCAGCAGGACCAACUGCCCCUGUAAGUACAGUUUUUUGGAUAACCACAAGAAGUUGACUCCUCGACGCGAUGUUCCCACUUACCCCAAGUACCUGCUCUCUCCAGAGACCAUCGAGGCCCUGCGGAAGCCGACCUUUGACGUCUGGCUUUGGGAGCCCAAUGAGAUGCUGAGCUGCCUGGAGCACAUGUACCACGACCUCGGGCUGGUCAGGGACUUCAGCAUCAACCCUGUCACCCUCAGGAGGUGGCUGUUCUGCGUCCACGACAACUACAGAAACAACCCCUUCCACAACUUCCGGCACUGCUUCUGCGUGGCCCAGAUGAUGUACAGCAUGGUCUGGCUCUGCAGUCUCCAGGAGAAGUUCUCACAAACGGAUAUCCUGAUCCUAAUGACAGCGGCCAUCUGCCACGAUCUGGACCAUCCCGGCUACAACAACACGUACCAGAUCAAUGCCCGCACAGAGCUGGCGGUCCGCUACAAUGACAUCUCACCGCUGGAGAACCACCACUGCGCCGUGGCCUUCCAGAUCCUCGCCGAGCCUGAGUGCAACAUCUUCUCCAACAUCCCACCUGAUGGGUUCAAGCAGAUCCGACAGGGAAUGAUCACAUUAAUCUUGGCCACUGACAUGGCAAGACAUGCAGAAAUUAUGGAUUCUUUCAAAGAGAAAAUGGAGAAUUUUGACUACAGCAACGAGGAGCACAUGACCCUGCUGAAGAUGAUUUUGAUAAAAUGCUGUGAUAUCUCUAACGAGGUCCGUCCAAUGGAAGUCGCAGAGCCUUGGGUGGACUGUUUAUUAGAGGAAUAUUUUAUGCAGAGCGACCGUGAGAAGUCAGAAGGCCUUCCUGUGGCACCGUUCAUGGACCGAGACAAAGUGACCAAGGCCACAGCCCAGAUUGGGUUCAUCAAGUUUGUCCUGAUCCCAAUGUUUGAAACAGUGACCAAGCUCUUCCCCAUGGUUGAGGAGAUCAUGCUGCAGCCACUUUGGGAAUCCCGAGAUCGCUACGAGGAGCUGAAGCGGAUAGAUGACGCCAUGAAAGAGUUACAGAAGAAGACUGACAGCUUGACGUCUGGGGCCACCGAGAAGUCCAGAGAGAGAAGCAGAGAUGUGAAAAACAGUGAAGGAGACUGUGCCUGAGGAAAGCGGGGGGCGUGGCUGCAGUUCUGGACGGGCUGGCCGAGCUGCGCGGGAUCCUUGUGCAGGGAAGAGCUGCCCUGGGCACCUGGCACCACAAGACCAUGUUUUCUAAGAACCAUUUUGUUCACUGAUACAAAAAAAAAAAAAGGAAUUCAUGAUGCUGUACAGAAUUUUAUUUUUAAACUGUCUUUUAAAUAAUAUAUUCUUAUACGGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-670.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -708.86

Frequency: 0.0000

Diversity: 616.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((.((((.....((((.(((.((.((((((((((((((.......))))))..((((((((((((....)))))..))))))))))))))).)))))))))...)))).)))))).........((((((((((.((((((((((((((...((.(((((...((((((((.((((..(((((((((((((((((.((((.....(((((.((..((((...))))...)).)))))....((((..(((.....((((.....)))).(((.....))).......))).)))).))))))))))))))...))..)))))))))))))))..........))...)))))))..))..)))))))..((((......))))...(((.(((((....(((((((((((.(((................))).)))))..........((((((...(((.(((((..(((........)))..))))).)))...)))))).((((((((((...((((((.((..(((.((((............)))).)))))))))))......(((((..(((((.((((...(((.((..((((..((.....((((((.(((.((((...((((((....)).))))............((((((((((...)))).((..((((......))))..)).......((((((((((........)))))))))).))))))....)))).))))))))).))))))...)))))..)))).)).)))..)))))(((((.(.(((((((((.......))).)))))).).))........(((((((((.(.(((((.((....)).))..((((.......))))))).).)))))))))..((((((...((((((((((.((.(((((((.(((...))).....))).)))).)))))..((((..((((..(((((.(((.((((...((((((.((((...)))).))))))((((((..(((((((((...((((........)))).)))))......((((..((((.....(((((((((((((((....................)).)))))))...(((.((.....)).)))((...(((....((((.((((((..((((((..((((.........))))..))))))..(((((....((.(((((.(((....(((((((........((((.((((((......)))))).)))).((((....))))..(((((.(((......))))))))((((.......))))..((((((...))))))..)))))))..)))))).))))..)))))((((........))))....................(((.((((((((((((...(((((((((((.((...........))))))))))))).....))))))).......))).)).)))....)))))).))))...)))...)).))))))))))))))(((.((.(((((((((((((((((....)))....))))..))))....)))))).)).)))((.((((...)))).))....(((((((...((((((.......(((.((((.((((..((((((..(((....)))..))).)))..)))).))))))).......)))))).))))))).(((.......)))....((.(((.(((.((....)).))).))).)).))))...)))))))))))))...)))))..))))..)))))))))))...))))))))))))))))))).))))))))))))))...))))))))))))....(((.(((((........))))).)))...)))..........((((..((((........((((((........)))))).........))))..))))...(((((.(((((..((((((((((......)))))).)))).)))))..)))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((.((((.....((((.(((.((.((((((((((((((.......))))))..((((((((((({....}))))..))))))))))))))),)})))))))...)))).)))))).,.,,{.,{((((((({({{(((((((((((({{...{(.{{{{{....,{(({{{.(({|||||||{|{{({{{{{|{|.((({,,,..((({(.,,..((((...))))...,,.}}}}}..,,((((,,{((.....((((,...,)))).(((.....))).....,,})).}}}}.|||}}}|||}}}||...|}}.,})))})))}})))),,..,.,,,,,,...)))))}}..,|..}}}))}}..((((,,,.,,))}},..(((.{((((,...((({{{{{,||,|,,|{{{,{{{(({.....{{{{{{,{{{.,{{...({((((((,..(((.(((((..(((........)))..))))).)))...}||}},,{,,,{|{{,,...((((((.{{..(((.((((............)))).))))}))))))...,,{{{{,,,,(((((...{,..{,.,.|}..|},,.}))}}...}}|})))}}}}}},|,}..,|||..}}})),||||..,,.}}}}}}}}}|||||||(,{{({{|..{{.((((..,,..|}}|{(((((..{{.((((((((((........))))))))))})|({{{{.,(({..{((((((((,....{{.{{.,((((((((((,.{.(((..(((.((((((,(,(((((((((.......))).)))))},|{{|{|{{{{..(((((((((.(.(((({,{(.,..{{.{{..,.,...}}}}}}}))))).).)))))))))...{(((,......}}||{((,{(,({{((({.(({,,.|||..|,,|||,},}}.}}|||||,....{{{{,{{(,(((,,,(((((,(({((((((.((((...)))).))))))}},}}}}|{{,,{{(((,,.{{{{........||||.,}}}},}||...{||.{(((({....,|||,,((((((({(......|,...,........)).)))))))...(((.((.....)).)))||,},|||....{({(.((((({.,((((((..((((.........))))..)))))).{(((((....(,{(((((.(((.,..(((((((...,....((((.((((((......)))))).)))),{{{|....}}},..((({,,(({.....,|))}}}}}|||},,,....,,}),,|(((({...,))))}..)))))))..)))))).))))..)))))|{({........)))},,|||||.,{||,......,{{{,|{{{{(((((((.,,(((((((((((.((...........)))))))))))))..,,.))))))}..}}}},},,)))})))}.,.)))))).)))}},,))}.,,,)}))))},,,)}}},})))}.,))}}..,}},}}}..{||,,,.)}},,.||})))}||,{({{{,,,((({||.,,,||,,,,,,}.,,))},),},.(((((((...((((((...,...(((.((((.((((..((((((..(((....)))..))).)))..)))).)))))))...,...)))))).))))))).|,|.......}})}}))))})}}}}},))))))..)))...))),.}.))))),,))))..}},}}......))))..)))),},}))).))))),..)))))))}}}))))))).)))))))})))))))),,.}))|}|))))),..},|||,|||{{..,....,))))),)),...}))..,.......((((..((((........((((((........)))))).........))))..))))...{{(((.(((((..((({((((({......)))))).})}}.)))))..)))))...