Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001003801.2

Sequence Length

1907 nt

GC Content

0.5826

ACUCCGCUCGAGUAGAAGUGUGAGAGAGCCCAGCAGGACUCAGAGGGGAGAGUUGGAGGAAAAAAAAAGGCAGAAAAGGGAAAGAAAGAGGAAGAGAGAGAGAGAGUGAGAGGAGCCGCUGAGCCCACCCCGAUGGCCGCGGACGAAGUUGCCGGAGGGGCGCGCAAAGCCACGAAAAGCAAACUUUUUGAGUUUCUGGUCCAUGGGGUGCGCCCCGGGAUGCCGUCUGGAGCCCGGAUGCCCCACCAGGGGGCGCCCAUGGGCCCCCCGGGCUCCCCGUACAUGGGCAGCCCCGCCGUGCGACCCGGCCUGGCCCCCGCGGGCAUGGAGCCCGCCCGCAAGCGAGCAGCGCCCCCGCCCGGGCAGAGCCAGGCACAGAGCCAGGGCCAGCCGGUGCCCACCGCCCCCGCGCGGAGCCGCAGUGCCAAGAGGAGGAAGAUGGCUGACAAAAUCCUCCCUCAAAGGAUUCGGGAGCUGGUCCCCGAGUCCCAGGCUUACAUGGACCUCUUGGCAUUUGAGAGGAAACUGGAUCAAACCAUCAUGCGGAAGCGGGUGGACAUCCAGGAGGCUCUGAAGAGGCCCAUGAAGCAAAAGCGGAAGCUGCGACUCUAUAUCUCCAACACUUUUAACCCUGCGAAGCCUGAUGCUGAGGAUUCCGACGGCAGCAUUGCCUCCUGGGAGCUACGGGUGGAGGGGAAGCUCCUGGAUGAUCCCAGCAAACAGAAGCGGAAGUUCUCUUCUUUCUUCAAGAGUUUGGUCAUCGAGCUGGACAAAGAUCUUUAUGGCCCUGACAACCACCUCGUUGAGUGGCAUCGGACACCCACGACCCAGGAGACGGACGGCUUCCAGGUGAAACGGCCUGGGGACCUGAGUGUGCGCUGCACGCUGCUCCUCAUGCUGGACUACCAGCCUCCCCAGUUCAAACUGGAUCCCCGCCUAGCCCGGCUGCUGGGGCUGCACACACAGAGCCGCUCAGCCAUUGUCCAGGCCCUGUGGCAGUAUGUGAAGACCAACAGGCUGCAGGACUCCCAUGACAAGGAAUACAUCAAUGGGGACAAGUAUUUCCAGCAGAUUUUUGAUUGUCCCCGGCUGAAGUUUUCUGAGAUUCCCCAGCGCCUCACAGCCCUGCUAUUGCCCCCUGACCCAAUUGUCAUCAACCAUGUCAUCAGCGUGGACCCUUCAGACCAGAAGAAGACGGCGUGCUAUGACAUUGACGUGGAGGUGGAGGAGCCAUUAAAGGGGCAGAUGAGCAGCUUCCUCCUAUCCACGGCCAACCAGCAGGAGAUCAGUGCUCUGGACAGUAAGAUCCAUGAGACGAUUGAGUCCAUAAACCAGCUCAAGAUCCAGAGGGACUUCAUGCUAAGCUUCUCCAGAGACCCCAAAGGCUAUGUCCAAGACCUGCUCCGCUCCCAGAGCCGGGACCUCAAGGUGAUGACAGAUGUAGCCGGCAACCCUGAAGAGGAGCGCCGGGCUGAGUUCUACCACCAGCCCUGGUCCCAGGAGGCCGUCAGUCGCUACUUCUACUGCAAGAUCCAGCAGCGCAGGCAGGAGCUGGAGCAGUCGCUGGUUGUGCGCAACACCUAGGAGCCCAAAAAUAAGCAGCACGACGGAACUUUCAGCCGUGUCCCGGGCCCCAGCAUUUUGCCCCGGGCUCCAGCAUCACUCCUCUGCCACCUUGGGGUGUGGGGCUGGAUUAAAAGUCAUUCAUCUGACAGCAGCCGUGUGGUCAUUGGAAACUGGGGAGGGGAGGGGGAGAGAAGGGGAAGGGAAGAAGGUGGGGAGGCAGUGGGUCCCUCGGGACGACUCCCCAUUCCCUUCCCUUGGAUUCUUCUCCUUACUCAAUUUUCCCUAGACCUAAAAACAGUUUGGCAGAAGACAUGUUUAAUAACAUUUUCAUAUUUAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-753.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -783.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 596.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.....))))..(((((((((((((.((....)).)))........(((((((...........((((.....((((...(((((.(...(.((((...(((((...((((((.(((..((.(.((((..((((.((.......)).))))..)))).).))..)))..(((((((....))))))).))))))((((((((((.(((.((((.((.((.(((((((...)))))))...)))).)))))))))))))))))....(((((.(((......))).)))))..(((((((..(((((.((((((..((((((.....))))))......((.....))((((......)))).......(((.....))).))))))))))).((.....))...)))))))...((((((.((..((((((((...((.....))...)))).))))...(((((((((........)))))))))...((((.(((((.(((((.......(.((((....((((((....(((((.(((....))))))))..))))))....)))).)))))).)))))))))......))..)))))))))))...)))))..).)))))..)))).....))))...((((.((...))..))))(((((((.((((((((.(((..((((((.(((((((((.((((......))))......((((.(((((....)))))..))))........(.(((((..(((.........(((((((((((((.....((((((((((((.((((((((........)))..((((....(((.((((....((((...((((.((((((....(((((((...)))))))..)))))).))))...)))))))))))(((((....)))))......((.((((..(((((.((((((.((...(((((.(((...((.....))....))).)))))(((((.(((........))).))))).((((((.........((((.((.(((.(((((((((..(..((.....))..)....)))))))))..))).)).)))))))..)))...)))))))))))))..))))..))..)))).......))))))))))(((((((....(((((((((.((............)).)).)).)))))....))))))))))))))))).)))).))))))))).))))).))))))))))))))))..)))...))..))))))..)))))))..(((........)))(((.(((......))))))...)))))))....(((....)))((((.(((((((((..(((((.((((.((..((((.((((..(((((.(((((((.(((......)))(((((((((((.....(((.(((((((((...((((....(((.((..((((((.((......)))))))))).)))))))..))))......))))).))).((((........)))).(((((.((((((((((((.((..((((.(((.....))).))))..)).............(((((.(.((....)).).))))).(((((.....(((...)))))))))))))))).)).)).).)))))))))))))))))))))).))...............)))))))..)))).)).)))).)))))..(((((((((((((((((((((.(((((((((((.....((((((((.......((((....))))..)))))))))))))))))))...))))))))))).))).....)))))))..........)))))))))))))..(((((....)))))))))))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.....))))..((((((((((((({((....||.}}|,,,((((,((((((((({,.......((((.....((((...(((((.{...(.((((...(((((...,((.((((((,.((,(.((((..((((.((.......)).))))..)))),|{||..|||..(((((((....))))))).}))},,((((((((((((((.((({(({..(.(((((((...))))))),..,.)).)))})))))))))))))....(((((.(((,....,))).))))),||,|||||..{{((({((((((..((((((..{,.||}|||.,|,..||}.}}.}}||{|..,,..)))).,.}}}.(((.....))).)))))))))))},|},.((((....,.))))...((((((.((..((((((((...((.....))...)))))))))...(((((((((........)))))))))...((((.(((((.(((((,......{.((((....((((((....(((((.(((....))))))))..))))))....)))).)))))).)))))))))......))..)))))))))))...)))),..}.)))))..)))).....)))),{{((((,({.,,{{,.|{{|}||}|}{,((((((((,.{,..(((({{,(((({(((({{{(({{{,,{||||,.....((((.(((((....)))))..))}}....}||,(({{|{.(((((,,.....|.,|||.,|||||{{{{,..|||||{,{{,|,|||||.|{{,.,,,,,.}},}}|||}||.,{{..(({({((((((......))))))||,}}..(((((((...)))))))..)))))..{((((....)))))||||(((((,,..,}}||....}}|||{{{{|||,||,,||))||||{.,,{{{{|.((({|.||{|,.,,}....))).||)))||,{|.|||,..,{{{,}||{|||||.{{..{{|........|||,.,{.,,,.,((((((((..{..{{.....}}.......))))))))|{{|||{||,|||||.,.....,{{{{{|{{{.{||{((((({..{({....((((......))))....{{(((({{,..||||}|...((((......))))..|,|{||}|.||}}}}},}|},{(((((...((((((((({{{.....,,,.}}}}.}}.,},))))))..))))))|,,,...||||||{|.,{,|{|{{{((((|,....|.}},|{|,|{|.,,,,,))))},...},})))}..|.|||}}}})))}})}.}})}.,||||||||,{.,||||,...(((((((((((..(((({.(({((((...)))}.)))},....))))..))...)))))))))||{...{||,..,))),,,}}}((((((.((......)))))))).)}))}}))})}))})}}.|,.|||.,.|||.{{{{.......|)},}|}||}}}}}}.))))))),,),}}}})|((((({((........|{...}}........)).))}))}))))),)))))))}..,.((((((.....{{,...})))))))))||||||.||{|,||||,}...,,,,)))),}}}},|}|}}}......({{{......}))).}})))).}})}))).,,||,,,||||||||({(((((((((({.(((((((((((.....((((((((.......((((....))))..)))))))))))))))))))...))))))))))).}})},}))))))),}.,,...{{{{{((((......)))).||||}...,,,,,))))))))))......