Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001005415.2
Sequence Length
1380 nt
GC Content
0.6138
GGACGCAGGUGCCGGCCGGAGCGGAGCUAGUGGCGCCGACGGGCCGGGCCGGGCCGGGACCGGGGCCGAGGCGAACCGAGGGGCCUGUGCGGCCGCCCGGCCCGGCCGCGGAUCAGGCUCCUGGAACCAUGGGCCUCAGGCCCUGAGGAUACGGGGCUCCCGGUGGCCAUGACGACGGGUGACUGCUGCCACCUCCCCGGCUCCCUGUGUGACUGCUCCGGCAGCCCUGCCUUCUCCAAGGUCGUGGAGGCUACGGGCCUCGGACCGCCCCAGUAUGUGGCACAGGUGACUUCAAGGGAUGGCCGGCUCCUCUCCACCGUCAUCCGUGCCUUGGACACACCGAGUGAUGGUCCUUUCUGCCGGAUCUGCCAUGAGGGAGCGAACGGGGAGUGCUUGCUGUCCCCGUGUGGCUGCACCGGCACGCUGGGUGCCGUGCAUAAGAGCUGUCUGGAGAAGUGGCUUUCCUCAUCUAACACCAGCUACUGCGAGCUGUGCCACACGGAGUUUGCAGUGGAGAAACGGCCUCGACCCCUCACAGAGUGGCUGAAGGACCCGGGGCCGCGGACGGAGAAGCGGACACUGUGCUGCGACAUGGUGUGUUUCCUGUUCAUCACACCGCUGGCCGCCAUCUCAGGCUGGUUGUGCCUGCGCGGGGCCCAGGACCACCUCCGGCUCCACAGCCAGCUGGAGGCCGUGGGUCUCAUUGCCCUCACCAUCGCCCUCUUCACCAUCUAUGUCCUCUGGACGCUGGUCUCCUUCCGCUACCACUGCCAGCUGUACUCCGAGUGGAGAAAGACCAACCAGAAAGUUCGCCUGAAGAUCCGGGAGGCGGACAGCCCCGAGGGCCCCCAGCAUUCUCCACUGGCAGCUGGACUCCUGAAGAAGGUGGCAGAGGAGACACCAGUAUGAAUGCUGGGCUCUCCGGACCCUGCAGCAGAGAGGCCAGAGGUAGCUGGUGAUACCCUGUCCUGUGGAAGGACUUCCACUUCAACACUUCCACUUCAACAGUUCCCGCACGGCCUGAACGCUUCUUAGGCCAAGAGACACCAUGCAGAGCCUAGUCUGUGAUCCUGUGUGAAGAUAUUUUCAGGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCAUAUGGAGGACAGGUGGACAUGGUCCUGAGCUCUGGACGGAGCAGGCACCCUGAUCUCAUUCUGAGGUCCACAUGGCACCUUCUGGGCCAGCAGCUGUGGCCGGUGUAUCAAGGGCGCCCUUAAAGCUGGAACAUUCCAGCAAGCUUCUUGCGCUUCUCUGCACCCGGCAGGCCCACUUUCCUGGCACCCUCGACUUUAUAUAAAAGUUGCACUGCGUUUCAAAAACCCACCCCUGAAUGAAUAAAAGGAGCCCUGGCUGGACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-598.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -619.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((.((((((((..(((.(((...))).))).(((((((((((((((..((.((((((((..((....))....)))))...)))))))))))))))))).)).....(((((((((((...(((((((..(((((((......))))))).(((((((((((....(((((.(((.((.((...((((((((((((((..(((.(.(.(((((((((((.((((((...........))))))...))))...((((((..(((.....)))(((.((((..(((((((.((((..(((...........)))..)))).)))))))..))))..))).))))))....))))))).).).))).)))))))...))))))).))..)).)))))))))))))..))))))...(((((((((.(((((...(((((..(((((((.(.((....)).).)))....))))((((((((((((.((.....)).)))))))))))).....((((((((...(((..(((.....))).)))...)))))))).((((((.(((((..((((((((......))))))))))))))))))).......((((((((((.......(((((...((((((((.((((((.(((((((((((((((((........))))))))).((((((((((.......((((((.(..(((((...((.(((..((((...))))((((((((((((..((((((....(((((((....((.(((((((((..............((((((((...........)))))))).((((...))))........))))))))))))))))))............)))))).)))))))..))))).((..(((.(((.((....))))).))).)).)))))..)))))..).))))))....((((...(((((((................)))))))....)))).........(((((((.......)))))))..))))).)))))......(((.(((((..(((((((((((((.........................)))))))))).)))..))))))))...)))))))).))))))......))))))))...(((((((...)))))))....((((.((....)))))).)))))))))))))))....((((....))))...((((((....)))))).)))))..)))))......))))))))))))))))..))))..(((....(((((((.....)))))))...)))..((((............))))........)))))))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,,,,,{({(((((({(..(((.(((...})).))).{{||((((((((((({(((.{(((((((,,((,...}|...,||))},.,|||}}}))))))))))))}))...},|||||||{{{{...{(((((|..(((((((......))))))}.(((((((((((....(((((.(((.((.(,{{.((((((((((((((.{(((.(.(.(((((((({{(.(((((,...,,}},.}.)|||||,..,)))}},((((({,,{((....,})){((.((((..(((((((.((((..(((...........)))..)))).)))))))..))))..))).,)))))...}))))))).}.).))),)))))))...)))))))})}..)).))))))))))))),.})))))...(((((((((.{{((.,,{(((((..{((((((,(.((....}}.}.}}}....}}}}((((((((((((.((.....)).)))))))))))).....((((((((...(((..(((.....))).)))...)))))))).((((((.(((((,.((((((((......))))))))))))))))))).....,,((((((((((.......{({{(,,.((((((((.((((((.(((((((((((((((((........)))))))))..{.((((......)))),|,{{{.{,.{{{{{,{{((,,((,.{{(({{{||,|(((((((((((({.((((((...,(((((((....((.(((((((((.,............((((((((...........)))))))).((((...))))......,.)))))))))))))))))).,.......,..)))))).)))))))..)))))..,..(((.(((.((....))))).))).}},}},)}}})))))}}).))))))...{(((({{{(((((((................)))))))....,,,|,.....,..(((((((.......)))))))..,.,...{{{{(((((,.....|||},{{(((((,{{({{,,......}}}}}}}............,)))))))},.)))))))))),),...)))))))).)))))}...,..))))))))...(((((({...}))))))....{(((.((....)))))).))))))))))))))),...{{((,.,,)))}...((((((....)))))).))),,}}))}))......)))))))))})))))}..}))).,||{,...(((((((.....)))))))...)))||||,.......,...{,{...........)))})}})))))))).}....
Back