Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001005464.3
Sequence Length
518 nt
GC Content
0.6525
GUUUUUCUCCCCGCCGCUGCGCUGGUAAGCCUGUGUUUUGGUUCGCUAUGGCCCGUACUAAGCAGACUGCUCGCAAGUCGACCGGCGGCAAGGCCCCGAGGAAGCAGCUGGCCACCAAGGCGGCCCGCAAGAGCGCGCCGGCCACGGGCGGGGUGAAGAAGCCGCACCGCUACCGGCCCGGCACCGUAGCCCUGCGGGAGAUCCGGCGCUACCAGAAGUCCACGGAGCUGCUGAUCCGCAAGCUGCCCUUCCAGCGGCUGGUACGCGAGAUCGCGCAGGACUUUAAGACGGACCUGCGCUUCCAGAGCUCGGCCGUGAUGGCGCUGCAGGAGGCCAGCGAGGCCUACCUGGUGGGGCUGUUCGAAGACACGAACCUGUGCGCCAUCCACGCCAAGCGCGUGACCAUUAUGCCCAAGGACAUCCAGCUGGCCCGCCGCAUCCGUGGAGAGCGGGCUUAAGAAGUGGCGGUUCGGCCGGAGGUUCCAUCGUAUCCAAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-222.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -231.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 156.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.((((((((((((((((((..((.((((....((((.(((.(((......)))))).))))...)))).))..))))))(((...)))........)))))(((((.....((((((.(....).)).)))))))))..))))))).))))))((((.(((((((((((((.(((.(((((....)))))..((((..(((.((((((..((....((.((.(((........))).)))).....))..)))))))))..))))(((((((.((.......)).))))))).......))).))))).((((((((.(((((((.((.((.(((....))).)).)).)).((((......)))))))))))))))))(((((.....)))))..............((....))((((.((.(.((((....)))).).)).))))......)))))))).)))).(((............)))....((((((....)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.(((((((..((.((((((..(({({((,...(({{((((.((({{........||{(,(({{{..|..,||,.,{((|{{{...))),)),}..,)))))})))}}....)))))))|))},}.))..))))))))..))))))).))))))((((.((((((((,((({{{|{.|,(({||..,||}|{.,,{|}.|||}|||{,{..,({{{{(((((.((.,....{{.|||{|},..,,,.},|||||||||||,.}}}}(((((((.({.......)).))))))).......(((.(({{((((((((((.((((((({((.{{.{||,,,.))).}}.}),}}{((((......))))))))))))))))}}))))).)))||||||,,,,,}}))}...|||,.,||,|||||,|{||,||.|||}}}},..})))))}......)))))))}.)))).|||.,.,},......,,,....((((((....)))))).....
Back