Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001006624.2

Sequence Length

2648 nt

GC Content

0.4588

CCUUUUUGGCGAGACAAUGUGCAAAUGACACCGUUUUGUGCUCACCAGGGCAAAGCAAGGGAGCGCCCUCACUUCAGCAUCUCAGCCCUGCUAAAGAAAAAGCUGCUGGGUAACAUCCUUUGUUUUUGCCCAGGGAAGCUUUAGCUGUGAUUCCCUUCAGCCGGCUCCUGAAUGUCAAAGCCAGCACAGGCCAGCCAGAAGAUGACACUGAGACUACAGGUUUGGAAGGCGGCGUUGCCAUGCCAGGUGCCGAAGAUGAUGUGGUGACUCCAGGAACCAGCGAAGACCGCUAUAAGUCUGGCUUGACAACUCUGGUGGCAACAAGUGUCAACAGUGUAACAGGCAUUCGCAUCGAGGAUCUGCCAACUUCAGAAAGCACAGUCCACGCGCAAGAACAAAGUCCAAGCGCCACAGCCUCAAACGUGGCCACCAGUCACUCCACGGAGAAAGUGGAUGGAGACACACAGACAACAGUUGAGAAAGAUGGUUUGUCAACAGUGACCCUGGUUGGAAUCAUAGUUGGGGUCUUACUAGCCAUCGGCUUCAUUGGUGCAAUCAUCGUUGUGGUUAUGCGAAAAAUGUCGGGAAGGUACUCGCCCUAAAGAGCUGAAGGGUUACGCCCUGCUGCCAACGUGCUUAAAAAAAGACCGUUUCUGACUCUGUGCCCUGUCCCUGAGCUCGUGGGAGAAGAUGACCCGUGGAACACUUGCCUGGCCCACUCAGAAUCCACGGUGACCUCUCCGCUUGCCAAAAUAACCGAAGGAAAGACCGUUCACCAGACUUGGCUCCUCUAAACAUUUGCUGUUCAAACAUGUUUUUGAAUAUACAUUCUAUAAAAGAUUAUUUGAAAGACAAAAUUCAUAGAAAAUGGAGCAAAACUGUAUAAACUGAUUUGUAACUAACACUGGACCAUUGGAUCGAUAUUAUAUGCUGUAACCAUGUGUCUCCGUCUGACCAUUCUUGUUAUUGUUAAAAUGCAGAGGAAUCUGGAAAUAUUUAUAUCCACGGAGUCCUUGGAUCCAGUGCUACGUCAGUAAAUAGCACCAGCAUUUUGCAAUUGCUGAUCUGCUGAAAUGUACACAUUCUGGUCUAGUUUGGUCUAUCUUUUAAAGCCUGAUCUGGUGUGAAUAAUCAACUAGGAAAUCUAAACUUGGAUAACACGUGGUGAACAACUGCCUUUAGCUGGUCCAGAUUAAUCAUUUCAAAGACAUCCAUUUUAGAUCACAAGCAGGAAGUCGAUAGUCUCAAAGGCACUUUGUUUCUCCCAAGUAGGCCACCAGGCAGCCUCUAGAGUUGCUUUACCCAAAUCCUUCUCCAGCCAUGACUUGGUGACUCUAAGCUUGCUCCCACCUGCCCCCUCCACUUCCCUCAGAUGAUGAGGAGCCAGGGCUAAGGGGGCAGCCUUCUCUCUUCCCAGUGAUGCACAUCCUUCACAUUGGCUGCUUUGUUCUGGAAUAUGGAUAUCUCAGCCUGGAUGCCGAGGAAGCUGCUGGAUGCUUAAUGGUGCUAGAGGCUCAAGUGUGUUUGAAACCAAGAGCCAGUUGUCCCCCAUGCAGAAAGAAAUCCUGUGUGAGCCUCUGGUAUGAGAAAUAAAAUCUGCCAGUUUUAUAACAUUCACUUUCUGCCUCUGAGGAAAGAUACAGGGAACAAAAAUCAAUUUGUACAGUCUUAAUAUUAAAAGCAGCUUGACUAAAUACCUGAUUUAAAAAUAGAAGACAUCCCCAGUCCUCAUGACAUACCGCAAAUAUCUGUGGGGUCCUGUUGAAAAGAACAAAAUAAAGGAGCCCAAGGGGUCAUUCUGUCUCAGCACCAUCCAGCCUGGCACUUCUCUUCCCAUAUAUCCAUUGGAUUUUUUUUUUUUUUUCCUAAACAAAGUUUUUACACUGAGCAGAUGCUCUGUCAUGAUGGCGGUUGUGCAAUUCUGGUAUCCUCUAAAUUUGUAAGCAUUCAUAAAACAGGAAAAAGUAAACUAUCAUUCGGAAGCACAGCCCAUUCCUCCCAUUUUUUGCAAUGAUGUCUGGAUGUUAUUUUAAACAGUGUGUCUGUGUGUUCCCAAAUCCAGCUGGCCCCACCAGCUCAGAUUCCAUUUUUUUUGUGUGUGUGUGUGAAACGUAGUCUGCAACUCUGCCUCCCGGCAAUUAUACAUGUGUCAGGAUGUCAAAAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACUACAGGUUCCUACCACCACACCCGGCCAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCGUAUCGGCGAGGAUGAUCUCUAUCUCUUGACCUCGUGAUCUGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGUGCCACUGCGCUCGGCCUCAGAUUCCAUAUUUGAACACCAGCUGAUUGAGAGAAGGGGAAUGAGAAGAGCUGGAUGAGUUUAAAUAACUCAUUGUUCAGAUUCCUGAACAGGAGUUGGGAUAAUGGCCAUCUUUUCUUUCCUAUCCUUUCUUCCCCCCUCACUGUGAAAAAUAACAGUCCACCCCAAGUCAUACACUGGACCCAGUGCCUGCGGGGACAGGACUGUGGGUUUCUUGGUCACACCUGUGUUGGUGCUCAAUGCAGUGUAGACAUGUUUUCAAAUAAAACAAAUGAUUGUGUACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-768.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -821.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 650.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((....(((((....((((((..((((((....((((((.((((((((((((((((((((..((((......((((.(((.(((...)))..)))....))))..))))....))))))).)))))))((((..((((...((((..........)))).))))))))..((((((.(((((.((..(((..(((......(((.(((......)))))))))..)))((.(((((((((.((..(.....)..)).))))))))).)).......((((.....))))....)))))))))))))...)))))))).))))))))))....))).)))....)))))...)))).((((.......))))..((((((((((((((((..............((......)).......(((((.....)))))..((((((((((((((((((.((((((((((((((.(((((.(((.....))).)))))...(((((((((((......)))))))))))...((((.((((((((.((.(((((....))))).)).)))).(((((((((((..(((((((..(((........)))....(((((...)))))((((((((((..(((.....)))..))))...(((..........)))..((.(((..(((((((((.....(((((((........((((.....))))..)))))))((((...((((((((...........((((((.((((((...((((((..(((((((((((....((((((.((((((.((.((((.((((....))))...)))).))..)))))))).)))).....))))....))))).....((((((.((((((..(((.....((((((((((..(((.......((((((.......)))))).((((((......((((((.(((((.....)))).).))))))..(((.((....)).)))))))))))).))).))))))).)))))))))...(((((.(((((.........)))))...)))))...)))))))).))))))......)))))).))))))..........(((((.(((....))))))))...(((((((..(((((.......(((((..(((((((.......))..))).))..)))))........))))).)))))))..))))).))).))))...((((...))))......)))))))))....)))))...))))))...((((((((((.............................)))))))))).(((((((.((..(((((((((((.((.((((((.....))))).)..))))...)))))))))............((((...((((((.((.((((((.(((.((((((((..((((...(((........((((((((..(((((((.((((((..(((..((((((((.(((((.(((.((.((((........)))))).)))..((((..((((((((........((((((...((((((.((.........)))))))).)))))).......)))))))).((((((((..(.....(((((((((......)))))...(((((..((((.(((.(((.............))).)))...)))).))))).)))))..)))))).))......(((......)))(((.((((...................)))).)))..)))).......)))))))))))))..))))))))))))).)))......))))))..))........)))...))))..)))))))).........((((....)))).)))))).))).)).))))))...))))..((((.......((........))......))))..................)).)))).))))).)))))..)))))))))))..)))).)))).((((......)))))).)))))))))))).))).(((.((((((.....))))))..)))))))))))))))))))))))))).(((((((.(((((((...((((.....((((...(((((.((((((((((((......)))....))))).(((((....)))))..((((((......(((....)))......))))))...................((((((((((..((..(((....)))..))....)))))))))).((((....((...((((((....)).(((((......))))).....((((.((((....)))).).)))((((((.....)))))).(((.((.(((..(.(((((((((...((((((((.(((....(((....((((((.((((((((....))))))))))))))....)))..))).)))))))).....)))))))))...)..)))))))).......(((((((.((((..(.((..(((((....)))))..)))))))...))))))))))).))..)))))))).)))))...))))....))))))))))))))))))..............))))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..,.(((((....((((((..((((((....((((((.((((((((((((((((((((..((((......((((.{((.(((...)))..})}....)))).,)))}....)))))))))))))))|{(({.{(((...((((.,........)))).)))))))}..(((({{{(((((.((..(((..(((,.....{((.(((......)))))))))..)))((,((((((((|.{{..{.....,..)).,)))))))).)).......((((.....))))....)))))))))))))...))))))))},)))))))))....))),,))....))))),..)))).((((.......))))..(((((((({{{((((,.,.......,....|}||,,,.{|,......||))),......|||..(((((((((((((({(((.(((((((((((({(,(((((.(((.....))).)))))...(((((((((((......)))))))))))...((((.((((((((.((.(((((....))))).)).)))}.(((((((((((..(((((((,.{{(........}}|,...(((((...))))){{{{{{{,{(,{(((.....}||,.,|||,,,{,{,{,{{{,,,,{||.,{{,({{,,(((((((((.,.,.(((((((.....,..{(({.....,)))..)))))))|({(.|,{{{(((((...........((((((.((((((...{{((({..{,(((((((((....((((((.((((((.,,,(((({((((....})))...}))),))..)))))))).)))).....))))....)))))....,||((({,{{,,,|,}|||.....{(((((((((.,(((({,,,,,,,{{{{..,,,,,}|||}||{{{{,,..|}}|||,,,,|||||,,,...}}})}}|||||.|{{({{.,,....,,.)}}}}))),))),))),))))|||.|||||||||{..(((((.,,(((...,}}...)))))...))))),..})))},},.}})))),,,},.)))))).)))))).........,(((((.(({....})})))))|..(((((({..(((({.....,,(((((..,{{((((.......)),.,}).,,..))))}.,...,..})))).})))))}..))))).))).)))}...|{||.,,}))},,,}}}})))}})}},|||||||,,,,||||||...({((({{({{...........,..,,,..,...,}.,,}))))))}}}}.||{{{||.,,..(((((((((((.,,.{(((((.....))))).)..,)))...)))))))))............((((.{.((((((.((.((({{,{(((.((((((((..((((...(({,{{{,,..{,{|||||,.{{(((((.((((((..(((..((((((((.((((({(,,.{(.{{{,...}}}..))))||,,||.{(((,..((((((((......,{((((({...((((((.((.........)))))))).)))))},}}....)))))))).{{((((((..,.....(((((((((......)))))...(((((..{{((.{(,.(((.,,......,...))).}))...}}}}.))))).))))}..)))))).)}.....,{{{......})||((.(((({{{......,,}.......)))).))),.)))).}}..}})})))))))))))..))))))))))))).)}},,,,..}}}}}}..)),.............))))..)))))))).........((((....)))).)))))).))).)).)))))).,.))))..{{{{......,((|.......,).,....)))}....,...........,.))}))))}))))}.)))))..)))))))))))..)))).)))).((((......)))).},)))))))))))).))).(((.((((((.....))))))..)))))))))))))))))),)))))))||((((((.(((((((...((((.....((((...(((((.((({((((((((......})}....))))).(((((....)))))..((((((......(((....)))......))))))........,..........(((((((((({,((.,(((....)))..)}.}},)))))))))),((((..,.((,,.((((({...|)}.,,{{{.,,.,.|||||{{..{((((.((((....)))).},}))|,,|||,,,,,))))},.{(,{((.(((..(.(((((((((,..((((((((.(((....(((....((((((.((((((((....))))))))))))))....)))..))).)))))))),,...}))))))))...,..))))))}).......(((((((.((((..(.((..(((((....)))))..)))))))...))))))))))).})..)))))))).)))))...))))....)))))))))))))))))},,............))))))))....