Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001009.4
Sequence Length
741 nt
GC Content
0.5803
CUCUUCCUGUCUGUACCAGGGCGGCGCGUGGUCUACGCCGAGUGACAGAGACGCUCAGGCUGUGUUCUCAGGAUGACCGAGUGGGAGACAGCAGCACCAGCGGUGGCAGAGACCCCAGACAUCAAGCUCUUUGGGAAGUGGAGCACCGAUGAUGUGCAGAUCAAUGACAUUUCCCUGCAGGAUUACAUUGCAGUGAAGGAGAAGUAUGCCAAGUACCUGCCUCACAGUGCAGGGCGGUAUGCCGCCAAACGCUUCCGCAAAGCUCAGUGUCCCAUUGUGGAGCGCCUCACUAACUCCAUGAUGAUGCACGGCCGCAACAACGGCAAGAAGCUCAUGACUGUGCGCAUCGUCAAGCAUGCCUUCGAGAUCAUACACCUGCUCACAGGCGAGAACCCUCUGCAGGUCCUGGUGAACGCCAUCAUCAACAGUGGUCCCCGGGAGGACUCCACACGCAUUGGGCGCGCCGGGACUGUGAGACGACAGGCUGUGGAUGUGUCCCCCCUGCGCCGUGUGAACCAGGCCAUCUGGCUGCUGUGCACAGGCGCUCGUGAGGCUGCCUUCCGGAACAUUAAGACCAUUGCUGAGUGCCUGGCAGAUGAGCUCAUCAAUGCUGCCAAGGGCUCCUCGAACUCCUAUGCCAUUAAGAAGAAGGACGAGCUGGAGCGUGUGGCCAAGUCCAACCGCUGAUUUUCCCAGCUGCUGCCCAAUAAACCUGUCUGCCCUUUGGGGCAGUCCCAGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-269.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -283.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 185.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((......))))))(((.(((((....(((((.((((.((.(......))).))))))).))..))))).)))((.(.(((((((..((((((((((((((..((((((..........))))))....((.((...(((((((((((.((((.(((..(((((((((((.......))))))....))))).((((.....))))((((((...)).))))(((((....)))))....(((((.((...))...((((..((((((((((...........))))))))))..)))).((((......))))..))))))))))).).)))))))))))..))...))((((((.......((((((....(((.(....))))..))))))..((((((......)))))).((((((((.((((((((...((.((((....((((((((((.(.((((......))))..).))).))))))).....(((((.((((.((..((((....))))...)).))))))))).)))).))...))))))))........))))))))..((((.(.((((((.(((.....)))...)))))).).)))))))))))))...))))...........((((..((((.......))))...)))).))))))).........)))))))))).......(((.((((((....))))))...)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{{(.,,....,,|||{(((((.(((((....(((((.((((.((.(.....,})).)))}))).))..))))).}||((,{,(((({((,,((((((({(({{{{..((((((......,.|,}}}}}}..,.({,{|.},(((((((((((.(((,{(((..,(((,((((((.......)))))).}},||,|..(((({{{..||.{((((({...}).))))|||||}}}})},))....(((((.,,...}}...((((..((((((((((...........))))))))))..)))).((((......))))..))))))))))).).)))))))))))..,|.{{{{({{(((.......,{{{{|,,..|||,|....,,))},))}||},.(((({,..,{,,}}}|||.((((((((.((((((((...((.((((....((((((((((,(.((((......)))).,).))).))))))).....(((((.((((.{{..((((....))))...)).))))))))).)))).))...))))))))........)))))))).}||||,({((((((,(((.....))}...)))))}.)}||||||||,.,{{{{.,.,,.....,..,.}))},}}}},}))}}}),)})},..}.)).})))))).......,.)))))))))).......,{(.((((((....)))))).,.))).,.
Back