Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001010972.2

Sequence Length

2225 nt

GC Content

0.6373

GCAGAGUCUGCGGACCCGGCGCCGAGGCGGCCACCCGAGACGCGGCGCGCACGCUCCGGCCUGCGCCCGGCCCGGCCAUGGCGGCCCCCCGCCCGUCUCCCGCGAUCUCCGUUUCGGUCUCGGCUCCGGCUUUUUACGCCCCGCAGAAGAAGUUCGGCCCUGUGGUGGCCCCAAAGCCCAAAGUGAAUCCCUUCCGGCCCGGGGACAGCGAGCCUCCCCCGGCACCCGGGGCCCAGCGCGCACAGAUGGGCCGGGUGGGCGAGAUUCCCCCGCCGCCCCCGGAAGACUUUCCCCUGCCUCCACCUCCCCUUGCUGGGGAUGGCGACGAUGCAGAGGGUGCUCUGGGAGGUGCCUUCCCGCCGCCCCCUCCCCCGAUCGAGGAAUCAUUUCCCCCUGCGCCUCUGGAGGAGGAGAUCUUCCCUUCCCCGCCGCCUCCUCCGGAGGAGGAGGGAGGGCCUGAGGCCCCCAUACCGCCCCCACCACAGCCCAGGGAGAAGGUGAGCAGUAUUGAUUUGGAGAUCGACUCUCUGUCCUCACUGCUGGAUGACAUGACCAAGAAUGAUCCUUUCAAAGCCCGGGUGUCAUCUGGAUAUGUGCCCCCACCAGUGGCCACUCCAUUCAGUUCCAAGUCCAGUACCAAGCCUGCAGCCGGGGGCACAGCACCCCUGCCUCCUUGGAAGUCCCCUUCCAGCUCCCAGCCUCUGCCCCAGGUUCCGGCUCCGGCUCAGAGCCAGACACAGUUCCAUGUUCAGCCCCAGCCCCAGCCCAAGCCUCAGGUCCAACUCCAUGUCCAGUCCCAGACCCAGCCUGUGUCUUUGGCUAACACCCAGCCCCGAGGGCCCCCAGCCUCAUCUCCGGCUCCAGCCCCUAAGUUUUCUCCAGUGACUCCUAAGUUUACUCCUGUGGCUUCCAAGUUCAGUCCUGGAGCCCCAGGUGGAUCUGGGUCACAACCAAAUCAAAAAUUGGGGCACCCCGAAGCUCUUUCUGCUGGCACAGGCUCCCCUCAACCUCCCAGCUUCACCUAUGCCCAGCAGAGGGAGAAGCCCCGAGUGCAGGAGAAGCAGCACCCCGUGCCCCCACCGGCUCAGAACCAAAACCAGGUGCGCUCCCCUGGGGCCCCAGGGCCCCUGACUCUGAAGGAGGUGGAGGAGCUGGAGCAGCUGACCCAGCAGCUAAUGCAGGACAUGGAGCAUCCUCAGAGGCAGAAUGUGGCUGUCAACGAACUCUGCGGCCGAUGCCAUCAACCCCUGGCCCGGGCGCAGCCAGCCGUCCGCGCUCUAGGGCAGCUGUUCCACAUCGCCUGCUUCACCUGCCACCAGUGUGCGCAGCAGCUCCAGGGCCAGCAGUUCUACAGUCUGGAGGGGGCGCCGUACUGCGAGGGCUGUUACACUGACACCCUGGAGAAGUGUAACACCUGCGGGGAGCCCAUCACUGACCGCAUGCUGAGGGCCACGGGCAAGGCCUAUCACCCGCACUGCUUCACCUGUGUGGUCUGCGCCCGCCCCCUGGAGGGCACCUCCUUCAUCGUGGACCAGGCCAACCGGCCCCACUGUGUCCCCGACUACCACAAGCAGUACGCCCCGAGGUGCUCCGUCUGCUCUGAGCCCAUCAUGCCUGAGCCUGGCCGAGAUGAGACUGUGCGAGUGGUCGCCCUGGACAAGAACUUCCACAUGAAGUGUUACAAGUGUGAGGACUGCGGGAAGCCCCUGUCGAUUGAGGCAGAUGACAAUGGCUGCUUCCCCCUGGACGGUCACGUGCUCUGUCGGAAGUGCCACACUGCUAGAGCCCAGACCUGAGUGAGGACAGGCCCUCUUCAGACCGCAGUCCAUGCCCCAUUGUGGACCACCCACACUGAGACCACCUGCCCCCACCUCAGUUAUUGUUUUGAUGUCUAGCCCCUCCCAUUUCCAACCCCUCCCUAGCAUCCCAGGUGCCCUGACCCAGGACCCAACAUGGUCUAGGGAUGCAGGAUCCCCGCCCUGGGGUCUGGUCCUCGCCCAUCCUGCAGGGAUUGCCCACCGUCUUCCAGACACCCCACCUGAGGGGGGCACCAGGUUUAGUGCUGCUGCUUUCACUGCUGCACCCGCGCCCUCGGCCGGCCCCCCGAGCAGCCUUUGUACUCUGCUUGCGGAGGGCUGGGAGACCCUCCAGGACAUUCCCACCCUCCCCCAUGCUGCCAAGUUGUAGCUAUAGCUACAAAUAAAAAAAAACCUUGUUUUCCAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-903.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -939.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 727.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..(((((...(((((((.((.((((..(((((.(((((.(((((.((....)).)))))..(((...)))..(((((....))))).((((...((((((.((((..((((((((((((.(((((..((((((((((((.............)))))).)))(((...(((..(((.(....))))..)))...)))...(((.((...((((((...))))))....)).)))......((((..((((((.((...)).))))))))))..((((....)))).((((...((((((((((.(((((((..((((.((((...(((((.((..(((((((...)))))))..)).))))).....)))).((((....))))((((.(.(((((((((((((.(................).))))))))))))).).)))).(((((...)))))......))))..).)).))))..)))).).))))).))))....(((((((((...(((.....))).((((((.(((...(((((.(((.((.(((((((..........))).))))))))).)))))....))).)))))).............)))))))))..)))..))))).).))))(((((((.........))))))).((((((....))))))(((...)))(((.(((..((((((.(((...((((((((((.((((..(((.((..((((.....(((((.((..(...((((((((.....((((((((((.(.((((((.(((.((((.......((((.......))))....((((....((((........))))...)))).........((((((.((((.(((((((.((....)))))))...))...))))))))))...))))))).)))))).)................(((((....))))).((.....(((((((..((((((((((((.((((((..(((((.(((.(((...))).)))..)))))...((((..(((.(.(((.(((((..(((((......)))...........))..)))))))).))))((((((....))))))..))))....)))))).))))....)))))..)))..))))))).....)).))))))))))...)))..))))).)..)).))))).....)))).(((((.(((..((((........)))).))).)))))....((.((((.(((.((((((.((((.(((.....((.((((.((((((....))).)))...))))))....))).)))).)))))).))).))))))(((.((.(((((((.((((.(((((...)))))))))((((..((((....(((.(((((.((((.((((((....)).).)))))))..(((((.(((((........((((..........)))))))))..)))))..))))).)))))))))))....(((.((((((((((....))))....)).)))).))).........))))))))))))..)).)))..))))))))))))))......))).))))))))).)))..))))))).))).).))))))...))))....(((((.....))))).((((....))))((((((((((((((.(((((((.(((...))).)))))..))..))))))).(((((((....)))((((((.(((..........))).))))))))))..(((((.((((......)))))))))...)))))))......((.(((((.....))))).))(((((...(((((((..(((((..........((((.((((.......................)))))))).((((...)))).(((.(((((......))))).))).((((((((((((.....))))...(((....))).))))))))(((....)))...((((...)))).......))))))))))))...))))).((((.((..........)).)))))))))..)))))..)))))).)).)).)))))))))))))))....((((((.((((((.((.....))...))))))))))))......(((.(((((((((((....)))))))............)))).....)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((,{(((((.,,(({((((,(({{({{..{{(((,(((((.(((((.((....)).))))),,(({..||||..(((((....))))).|||{,,||||,||,|{||.,||||||||||,|,((({{,....(({{{||{{,.,......,,,.}|||||.|||{.,|,,|||,.,{{,{,...,|}|,{((|,,({{{...(({.((,,,(({{((,,,||}}||{{{{,|.,,,...,.)))))){(((((({(.{.....}}))))}}})|,(({{....}))}.((((.{{({(((((((,.{{{||||,.||{|.{||{},,|{|||,||,.{||||||...}))))))..)).)))}}.....}}}).||{{....))}}((((.(.(((((((((((((.(................}.))))))))))))).).)))).(((({...))))}......})))..,.}}.}}||..||||.|..||||||||(({(((({{(((((...(({.....))).{(((((.(((..{(((((.((,,(,,(((((((..........))).))))))))).))))).}..))).)))))}..,||,,,.,}}}}}}}|}||,{|||||.,{|{|{|.,{||(((((({..,.....,})),,,,.((((((....))))))|{{..,||}{((,||,{(((((((.(((...((((((((({,((((..(((.((..((((.....(((((.((..{...((((((((.....((((((((((.({{..(({{.,{,,{||.|||}..(({{.......}|}},.{{(({{....{{||,,......}|||{{,||,|{,..,.,,,((((.((((({{,..{({{{{{.((((.((({{(((.(......).))))))).)))),))},}})))))}}..,,..........{{((({{..,,,,..,({{{{{((((((({{,(((,,..,{{,.,,,,,,..|,,,,.|||.|||,,})))})))}}),,)),}}||{|.,,||}|}|||.((((,..|}||,.{{{{{,,|{{{{{..,....,..||}},,,,,.))}((((((....)))))),},,))})..),,)))})))).}}}))))}.{{{|...}}})}||,...)).))))))))))...)))..))))).)..)).))))).....)))).(((((.(((..((((........)))).))).)))))....((.((((.(((.((((((.((((.{((.....(,(((((.((((((....))).))).,.)))))}....))).)))).)))))).))).)))),|(((,(.,(((((((.,(((.(((((((((..{.....,....)))))))))}}|.(((((,((((.((({{(....||.}.})}))))..{((((.,(({,......||((({..........)))))))}},.))),)}})},,(((((,..)))))..||({(,(({{{{((((....)))),,,}}),)))),)),.........))))))))))))..)).)))..))))))))))))))......))).)))))))),.))),,)})}))).),)})}}})}}}.,|})}}..,.(((((.....)}))).......{,||||(((({({((({(({{({(((({.{({.,,|||,}}||}..||,,||||||,.{,({(((,...})){{{{{|.,{{,{(((...,,}}||||||}}}|||{,(((((,({((.,,,,.}}||}}|||...|}}}}}}.|,,..,,.{((((.....))))},))|||,,.}}||,||,|}||||||.....}}}}.|,{{}|}}|}......},,,,,,........,{{|(|{{{{((((.{,{{{{.(({.(((((......))))).))).|{||||,,{{{{},,,})))),,,|||,.,,}}},}}}}}))))))...,))}.,,||||...)))).,,,,..}}},))))))),.}}))))}.||||,|{.|,.....}.)),}))))}})}}}))})),.})}}}}})),)),)}}}})))}}))))),,|.((((((.((((((.,({....))...)))))))))))).....,||,...||{((((((....))))))}............,,,},,...,,,..