Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001012331.2
Sequence Length
2651 nt
GC Content
0.6277
GGAGGCCUGGCAGCUGCAGCUGGGAGCGCACAGACGGCUGCCCCGCCUGAGCGAGGCGGGCGCCGCCGCGAUGCUGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCUUGGCUGGCACAGCUGGGCUGCGGGGCCGGGCAGCCUGCUGGCUUGGCUGAUACUGGCAUCUGCGGGCGCCGCACCCUGCCCCGAUGCCUGCUGCCCCCACGGCUCCUCGGGACUGCGAUGCACCCGGGAUGGGGCCCUGGAUAGCCUCCACCACCUGCCCGGCGCAGAGAACCUGACUGAGCUCUACAUCGAGAACCAGCAGCAUCUGCAGCAUCUGGAGCUCCGUGAUCUGAGGGGCCUGGGGGAGCUGAGAAACCUCACCAUCGUGAAGAGUGGUCUCCGUUUCGUGGCGCCAGAUGCCUUCCAUUUCACUCCUCGGCUCAGUCGCCUGAAUCUCUCCUUCAACGCUCUGGAGUCUCUCUCCUGGAAAACUGUGCAGGGCCUCUCCUUACAGGAACUGGUCCUGUCGGGGAACCCUCUGCACUGUUCUUGUGCCCUGCGCUGGCUACAGCGCUGGGAGGAGGAGGGACUGGGCGGAGUGCCUGAACAGAAGCUGCAGUGUCAUGGGCAAGGGCCCCUGGCCCACAUGCCCAAUGCCAGCUGUGGUGUGCCCACGCUGAAGGUCCAGGUGCCCAAUGCCUCGGUGGAUGUGGGGGACGACGUGCUGCUGCGGUGCCAGGUGGAGGGGCGGGGCCUGGAGCAGGCCGGCUGGAUCCUCACAGAGCUGGAGCAGUCAGCCACGGUGAUGAAAUCUGGGGGUCUGCCAUCCCUGGGGCUGACCCUGGCCAAUGUCACCAGUGACCUCAACAGGAAGAACGUGACGUGCUGGGCAGAGAACGAUGUGGGCCGGGCAGAGGUCUCUGUUCAGGUCAACGUCUCCUUCCCGGCCAGUGUGCAGCUGCACACGGCGGUGGAGAUGCACCACUGGUGCAUCCCCUUCUCUGUGGAUGGGCAGCCGGCACCGUCUCUGCGCUGGCUCUUCAAUGGCUCCGUGCUCAAUGAGACCAGCUUCAUCUUCACUGAGUUCCUGGAGCCGGCAGCCAAUGAGACCGUGCGGCACGGGUGUCUGCGCCUCAACCAGCCCACCCACGUCAACAACGGCAACUACACGCUGCUGGCUGCCAACCCCUUCGGCCAGGCCUCCGCCUCCAUCAUGGCUGCCUUCAUGGACAACCCUUUCGAGUUCAACCCCGAGGACCCCAUCCCUGACACUAACAGCACAUCUGGAGACCCGGUGGAGAAGAAGGACGAAACACCUUUUGGGGUCUCGGUGGCUGUGGGCCUGGCCGUCUUUGCCUGCCUCUUCCUUUCUACGCUGCUCCUUGUGCUCAACAAAUGUGGACGGAGAAACAAGUUUGGGAUCAACCGCCCGGCUGUGCUGGCUCCAGAGGAUGGGCUGGCCAUGUCCCUGCAUUUCAUGACAUUGGGUGGCAGCUCCCUGUCCCCCACCGAGGGCAAAGGCUCUGGGCUCCAAGGCCACAUCAUCGAGAACCCACAAUACUUCAGUGAUGCCUGUGUUCACCACAUCAAGCGCCGGGACAUCGUGCUCAAGUGGGAGCUGGGGGAGGGCGCCUUUGGGAAGGUCUUCCUUGCUGAGUGCCACAACCUCCUGCCUGAGCAGGACAAGAUGCUGGUGGCUGUCAAGGCACUGAAGGAGGCGUCCGAGAGUGCUCGGCAGGACUUCCAGCGUGAGGCUGAGCUGCUCACCAUGCUGCAGCACCAGCACAUCGUGCGCUUCUUCGGCGUCUGCACCGAGGGCCGCCCCCUGCUCAUGGUCUUUGAGUAUAUGCGGCACGGGGACCUCAACCGCUUCCUCCGAUCCCAUGGACCUGAUGCCAAGCUGCUGGCUGGUGGGGAGGAUGUGGCUCCAGGCCCCCUGGGUCUGGGGCAGCUGCUGGCCGUGGCUAGCCAGGUCGCUGCGGGGAUGGUGUACCUGGCGGGUCUGCAUUUUGUGCACCGGGACCUGGCCACACGCAACUGUCUAGUGGGCCAGGGACUGGUGGUCAAGAUUGGUGAUUUUGGCAUGAGCAGGGAUAUCUACAGCACCGACUAUUACCGUGUGGGAGGCCGCACCAUGCUGCCCAUUCGCUGGAUGCCGCCCGAGAGCAUCCUGUACCGUAAGUUCACCACCGAGAGCGACGUGUGGAGCUUCGGCGUGGUGCUCUGGGAGAUCUUCACCUACGGCAAGCAGCCCUGGUACCAGCUCUCCAACACGGAGGCAAUCGACUGCAUCACGCAGGGACGUGAGUUGGAGCGGCCACGUGCCUGCCCACCAGAGGUCUACGCCAUCAUGCGGGGCUGCUGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCAUCAAGGAUGUGCACGCCCGGCUGCAAGCCCUGGCCCAGGCACCUCCUGUCUACCUGGAUGUCCUGGGCUAGGGGGCCGGCCCAGGGGCUGGGAGUGGUUAGCCGGAAUACUGGGGCCUGCCCUCAGCAUCCCCCAUAGCUCCCAGCAGCCCCAGGGUGAUCUCAAAGUAUCUAAUUCACCCUCAGCAUGUGGGAAGGGACAGGUGGGGGCUGGGAGUAGAGGAUGUUCCUGCUUCUCUAGGCAAGGUCCCGUCAUAGCAAUUAUAUUUAUUAUCCCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1227.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1270.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 628.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((((((.(((((.(((((.(((..(((((((((((((.....))))))...(((((.((......)).))))).((((.(..((((((((((((...)))))))))))).).)))))))))))..)))))..(((.(.....((((((.(.(((((........))))))))))))..).))).(((.(((((((((((..(((...))))))))...)))))).)))(((.(((((.(((((.((((((((((((....(((.(((.(.(((......))).)))))))..))))).(((((.((...(((((((((.(((((((((.((....)).)).....((((....))))...(.(((((((((.....((((.....))))............((((((..(((.((((.(((...(((((((..(((((...((((((((((((....(((.((((((((..(((((..((((((.....)))))).)))))..)).)))))).)))......(((.((((((....)))))).))))))).))))))))))))).(((((((..((((..((..(((((((.((((((.(((((...)))))...))))))....((((.((((.....))))))))..((((..((.(((((..((((..((....((((((((((..(.(((((((((((((((((((((((.(.(((((((((.(.(((((((((............)))))).((((((((((((((((((......(.((((((.(((........))).)))))).).....)))))).))).(((....))).......(((((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((....))))))).)))).)))))....((((.(((.((((((....))))))))).).)))((((((((...))))))))...)))))).(((.(((((.((.((((((....((((((.((.(((.((.((((((((.((((...(((..(((...........)))..)))...))))))).))))).)))))))))))))....)))))).))))).)).))))))))..))))))).....(((........)))))))))))).....))).)..)))))))))).)))))))).)))).)))....(((((...........))))).(((((((.(((((.((((((...((..(((.....))).))...))).)))..((((((........)))))))))))))))).)).(((((((.((((((.....((((((((((...(((((.((((((...((((.....))))..)))).)).))))).......((......))(((.(((...))))))...))))).))))))))))).))))..)))..(((......))))))))))).)..)))))))))).....))..))))..))))).))..)))).((((((.(((............))).))))))(((..((((.((((....(((((.((....)))))))...))))))))..)))...(((((..((((.((((....)))).)))))))))......((((((....))))))...)))))))))..))))..))))))))))))))((((.(((..(((((.((.........((((.....)))).(((((..........))))).))))))).))).))))...))))))).)))..))))))(((((....((((((.......))))))...)))))))))))))).)....)).))))).))))..))))))).)))))...))))..))).)))))))))).))).(((((((((((...))))))))))).))).))))).)))))).)))))))).))..((((((((((....((((((((((((........((((((..(((((((.(((...........))))))))))..))))))(((((((((...)))))))))..((((((((((((((.((((.((..........((((((....))))))...((((.(((...((((..((((((((.((((((((.((..(((.((((((..(((((....))..)))..))))))))))).))))))))))).............)))))..))))..)))...)))).((((.....))))(((......))).....(((((.(((((.((((...))))))))).)))))(((((....((((...(((.((((((((((((((((.((((((((((((((....((....(((((...)))))....))(((((((....((((((((((((.((.(((.........))).)))))))))))))).((((.(((((...)))))..)))))))))))....))))))).(((.....))))))).....))).)))))))))))(((((((................)))))))..))))))))....)))).)))))))))))........))))))))))))))......)).))).))))))).............))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.((((,(((.,{((((((((((.(.(((((,.((((.(((((((((.....))))))).)).)))},(((((((...(((({,.((({(.(((((((((((,({{.{{{(,{(({|{(,{,{|,|,|||||||||}}|}|,|||,,.....((({((.|,(({{{.....,,,}))))})})))).{|{,((((((.(((((((((((,{({((,,{{..(((((.,(((|...((((.....)))),|.))}}))))),(((((....(((.(((.{{(({.....})),.,))))))..))))).)}})).)|}),}}}}}..,})))))))))))))))}}){(((....)))},,,{{|.{{.|,{,(((((((((...,,(({{.....})))............((((((..(((.((((.(({...(((((((,.(((((...((((((((((((,{{,,{(.((((((((..(((((..((((((.....)))))).)))))..)).)))))).))),}....(((.((((((....)))))).)))))))}})))))))))))).(((((((..((((..((..(((((((.((((((.(((((...)))))...))))))....((((.((((.....))))))))..((((..((.(((((..((((..((....((((((((((..{.(((((((((((((((((((((((.(.(((((((((.{.(((((((((,........,..)))))).((((((((((((((((((,.....{.((((((.(((........))).)))))).}....,)))))).))).(((....}))......,(((((((.(((((((((((.(((((.(((((((((((....))))))).)))).)))))....,{((.(((.((((((....))))))))),).))}((((((((...))))))))...)))))).(((.(((((.((.((((((,,..((((((.((.(({{((.((((((((.((((...({({((((...........))).)))}...))))))).))))).))))))))))))).,,.)))))).))))).)).))))))))..))))))}.,...(((........)))))))))))).....))).}..)))))))))).)))))))).)))).)))..,,{(({,.........,.}}},,.{{{{{{||{{((({{{{(((.......((({.({,(||({{,,||}|,},....(((((........))))))}))))))))),)),|||((((.{((({{.....|||{||||{{,..{((({.((((((...{(((.....)))}..)))).)).})))}.......((,.....}}{|||||{...)))))}..,))})),))))))))))},)|}),.}},..,||,},,,.,}})))))))).,..)))))))))).....))..))))..))))).))..)))).((((((.(((............))).))))))(((,.((((.((((.,..(((({,({....}))))))..,)))))))).}}}|,.,(((((..((((.((((....)))).))))))))).}..}}((((((....))))))...)))))))))..))))..)))))))))))))}((((.(((..(((((.((...,.,...(((({{{.,||}}.{{{||,...,,}},,)}))).))))))).))).)))),,,))))))).)))..))))))(((((....((((((.......))))))...)))))))))))))).,...,})}}},|||},|,,..,))}.,.,..))))))))))),)|{((((((.(((((((((((((((((((...))))))))))}.((((({.(((((((({.(((((((((((.......|)))).))))))),||}|.,,((((((..((((((..(((((((.(((...........))))))))))..))))))..)))))}.(((({,.,{(((({.,,(((,((..,...(((((..,.........((((((....))))))..))))),,...}},))}.}})))|{((.((((((((.{{..(((.((((((.{(((((....,,.,),)}})))))))))}).))))))))})).,....})}}).})))).}))))).{{{,{.((((({((((....,|||}(((......))).}|.||,,,|,||||))))))),,))))))))).))).))))))}}..,,...,))).}}.(((((((((.(((....))).)))))).))}.)))).)))))))..,..))))).).)))))))))}..((((((((((((.((.(((.........))).)))))))))))))).}|||}||((({{{|||||.,|||||.||}}|....,|(((((((((({{((({.,{((((,,.,{((((|,{{{{,..(((((((................)))))))..)).)))))),.},,,,.})}))))))))))..{((((((.{{...,))))))))}))),})))))))},...}},,,,,,.,,,.,}},))))},
Back