Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001012478.2

Sequence Length

2134 nt

GC Content

0.6036

AGCCGAAGCGGCUGGAGCGGGCGGCAAGGCGAGGCGAAAGCUGCACAGGGCCCUACGCGGCCGCCUCAGCAUGUCGGACUUCGACGAGUUCGAGCGGCAGCUCAACGAGAAUAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCAUCGGAAGCGCAGCCACAGCCGCUCUCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGGACCAGCGGAGCGCCUCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCUUUGACCAGAGGCGCUAAAGAGGAGCACGGUGGACUGAUUCGUUCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGUCCGUAAAUACUGGGACGUGCCACCCCCAGGCUUUGAGCACAUCACCCCAAUGCAGUACAAGGCCAUGCAAGCUGCGGGUCAGAUUCCAGCCACUGCUCUUCUCCCCACCAUGACCCCUGACGGUCUGGCUGUGACCCCAACGCCGGUGCCCGUGGUCGGGAGCCAGAUGACCAGACAAGCCCGGCGCCUCUACGUGGGCAACAUCCCCUUUGGCAUCACUGAGGAGGCCAUGAUGGAUUUCUUCAACGCCCAGAUGCGCCUGGGGGGGCUGACCCAGGCCCCUGGCAACCCAGUGUUGGCUGUGCAGAUUAACCAGGACAAGAAUUUUGCCUUUUUGGAGUUCCGCUCAGUGGACGAGACUACCCAGGCUAUGGCCUUUGAUGGCAUCAUCUUCCAGGGCCAGUCACUAAAGAUCCGCAGGCCUCACGACUACCAGCCGCUUCCUGGCAUGUCAGAGAACCCCUCCGUCUAUGUGCCUGGGGUUGUGUCCACUGUGGUCCCCGACUCUGCCCACAAGCUGUUCAUCGGGGGCUUACCCAACUACCUGAACGAUGACCAGGUCAAAGAGCUGCUGACAUCCUUUGGGCCCCUCAAGGCCUUCAACCUGGUCAAGGACAGUGCCACGGGGCUCUCCAAGGGCUACGCCUUCUGUGAGUACGUGGACAUCAACGUCACGGAUCAGGCCAUUGCGGGGCUGAACGGCAUGCAGCUGGGGGAUAAGAAGCUGCUGGUCCAGAGGGCGAGUGUGGGAGCCAAGAAUGCCACGCUGAGCACCAUCAAUCAGACGCCUGUGACCCUGCAAGUGCCGGGCUUGAUGAGCUCCCAGGUGCAGAUGGGCGGCCACCCGACUGAGGUCCUGUGCCUCAUGAACAUGGUGCUGCCUGAGGAGCUGCUGGACGACGAGGAGUAUGAGGAGAUCGUGGAGGACGUGCGGGACGAGUGCAGCAAGUACGGGCUUGUCAAGUCCAUCGAGAUCCCCCGGCCUGUGGACGGCGUCGAGGUGCCCGGCUGCGGAAAGAUCUUUGUGGAGUUCACCUCUGUGUUUGACUGCCAGAAAGCCAUGCAGGGCCUGACGGGCCGCAAGUUCGCCAACAGAGUGGUUGUCACAAAAUACUGUGACCCCGACUCUUAUCACCGCCGGGACUUCUGGUAGAGGCGGCUGGGGGAGGGUGGGGGCAGGGCUGGCUGGGGGCUUCUCCCCACUCCCGCCCCCCCCUUAUCCCCCUCUGAAGACGAUGGGCAGAGGAGUGACAGCCGCAGACACACGACAGCCGGCAGCAACUGGAAUGGCAGCAAUUAAGGGUGGGGGGCGGGGGUUGGGGGGUUGGGGGGUUAGGGCAGGGAGGGGACUGGGGAAGUGCGCACACAGCCCACACAGACAACACGCACCCACACAGACACAGAGGGAAGGGGUUGGGAUGGGGACAGGGUGCACAGCAGGGCGGGGUAGGACCCCAGCCCCUCCCAAAACAGCCUCUCCUUCUCCCAUAGACCCCUUUCUUCUCCCCUUCCCCACGGUAGGAACAUAGCGUGUUUAUAUUUUAUGGCCAAACUAUUUUGAAUUUUGUUGUCCGGCCCUCAGUGCCCUGCCCUCUCCCUUACCAGGACCACAGCUCUGUUCCUUCGGCCUCUGGUCCUCUCUGGUCCCCUCCUGGGUUUCUUACGUAGUUGAUUUUUCCUCUUUAGUCUCCCCCGACCUGCGCCCAGCCCCGUGGCCCCUGCCCCUCUCCUACUCUCUGUGGCAGUUUCAUAUUUGCUAAGACGAAUUUGCUCAUUAAACAUUUUGUUGUAUUUUACUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-873.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -906.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 531.04

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((..(((((((....(((((((((......(((....)))((((((((((....((.(((((.(((((.(((((.....))))).))).))))))).))...................(((((.(.......((((((...((...((((((((..((((.((.(((..((((..((((....).)))..))))..))).)).))))....((((((...(((...))).)))))).....(((....)))(((...(((((....))))).)))..(((((((((.((.(((((..(((.(((..(.((...)).)..))))))...))))).......((((((..((..((((...(((((((.((.(((.......)))..)).)))))))..(((...)))))))))..))))))))..))))))))).........((((......))))))))))))...))...))))))))))))(((((((.(((.((((.(((((...(((((.((......))))))).........)))))))))..(((((((((((...))).))))))))..(((((..((((((((((((((((......)))))))(.((((.....)))).)(((.(.(......).).)))........((((((..(((((((((..(((((((((.(((..(((((((..(((((((.((((....))))....)))))))(((......))).((.(((.(((..(((..((((.......))))...))).)))....))).)).......)))))))))).))))))))).(((((((((..(.((......)).)....)))))))))...........(((..(..(((((((((..(((.(((..(((...((....))....))).))))))..))))))))).)..))).....)))))))))..))))))..(((((((((......((((.((......))))))(.((((.((......)).)))).)(((..((((((...........))))))..))))))))))))(((((((.(........).)))))))((((..((((((......(((((..((.......))..))))))))))).)))))))))))))..))))))))..)))))))..)))))))))).((((....)))))))))))))...)))))))))(((((((((.(((((((.(((((((((.((((.(((((..((...((((((((((((((...((.((.(((((.((((((.(((((((.(.((.((.(.....).)))))))))).))...)))))).))))).)).)).)))))))))).))))(((...(((......)))))).))..))))).)))).))...(((((.(..((((((......))))))..).))))).......(((((....((((((....(((((((((((((((.((((((.(((..((.(((((......)))))))))))))))))))))..)))((((((...........)))))).....)))))))..)).)).))...)))))(((((.((((((.((.(((.....(((.(((((((((((((((.((((((((((((..(((((((((.(((((..(((((.(((((......................))))).............(((((((((((((((((.(((((.(((.((.......(((((((((...))))).)))).........)).))).))))).)))))...))))))))))))))))).)))))..((((.((((((...)))))).))))....((((..((................))..)))).......)))))))))..)))..((((((((((.((..(((......))).)).))))))....)))).(((....))).......((((((((......................))).)))))))))))))).))))))))))))))).)))......))).)).))))))...)))))...))).)))).)))))...)).)))))))))...........

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((..{((((((....(((((((((...,..(((....)))((((((((((,...((.(((({{(((((.(((((,...,))))).))).))))))).)){{.................{((((.(.......{(((((.,.((...((((((((..((((.((.(((..((((..((((....),}))..))))..))).)).))))....((((({...(({..{|||,||}}}|...,,(((....))){((...(((({....,)))).)))..(((((((((.((((({(((,{((,{,{..,.{{...}}.}..,,.,.....,||||.......,,{||}}.{{,,,,,{...{((({((.|{,|,,........}|,.|}.}}})))}..|,..,,})))))}}}}.,))))))),,))))))))).........((((......))))))))))))...))...))))))})))))(((((((.(((.((((.(((((...(((({{((......))))))).........)))))))))..(((((((((({...})).))))))))..(((((..((((((((((((((((....{{||||||{(({,..,||{{,{{{(|{{{{{.{.....||||{,|,........((({{{..(((((((((|.(((((((({.(((..(((((((..(((((({.((((....})))....})))))){{{.....,|||.{(,{((,{((..(((..{{{({,,....}})),..})).)}}....}}},,},}}.,}.)))))))))).})))))))).{((((((((..{.((......)).}....))))))))}..........,(((..(..(((((((((..(((.({(,.{{,...((.,,.||,,..,}|.))))}}..))))))))).},.))),|...})))}|||}..}}||||..{||||{{{{.|,,,.{||||,|......))))}}|,{{||,|{..,,.,)),))}).,||{..{{{{({...........)))))),,))}}}}}||||}(((((((.(........).))))))),{||.,|.||,,.,.,..||}}}},,,.}}}},.,))))))))))),},})))))))))))))..))))))))..))))))),.)))))))))).{{{{....})),)))))))))...)))))))))(((((((((.(((((((.(((((((((.((((.(((((..((...((((((((((((((...((.((.(((((.((((((.(((((((.{.((.((.(.....).))))}))))).))...)))))).))))).)).)).)))))))))).))))(((...(((......)))))).))..))))).)))).))...(((((,(..((((((......)))))).,).))))).......(((({..,,{{{|||....(((((((((((((((.((((((.(((..((.((((({....,))))))}))))))))))))}|.,)))((((((...........)))))).....}))))))..,,.},.}}..,))))){(({{.(({{{{.{{.{{{....,(((.(((((((((((((((.((((((((((((..(((({((((,((({({{((((..(((.({.....}}.}}}......,{{,|||..............{(((((((((((((((((.(((((.(((.((....,..(((((((((...})))).)))),.,,.....)).))).))))).))))}..,))))))))))))),,||,,||,,..||,|}},.,,,.,}))))},.,,......((((..((.............,,.))..))))},,}}}.))))}))))..))),.||{(((((((.((..(((......))).)).))))))}...,}}}.(((....))).......(((((,,(,.............|,,.....))))))))}))))))))).))))))))))))))),)))......))),}),}))))}...)))))...))),,))).)))))...)).)))))))))...........