Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001012635.4
Sequence Length
726 nt
GC Content
0.5840
AGACUGCGUGCAGAAGGCCUUGGCUCCUUGAACUUUUGGCCGCCAUGUGCUUCCCGAAGGUCCUCUCUGAUGACAUGAAGAAGCUGAAGGCCCGAAUGGUGAUGUCGAGCCUGGCAGAGCUGGAGGACGACUUCAAAGAGGGCUACCUGGAGACAGUGGCGGCUUAUUAUGAGGAGCAGCACCCAGAGCUCACUCCUCUACUUGAAAAAGAAAGAGAUGGAUUACGGUGCCGAGGCAACAGAUCCCCUGUCCCGGAUGUUGAGGAUCCCGCAACCGAGGAGCCUGGGGAGAGCUUUUGUGACAAGGUCAUGAGAUGGUUCCAGGCCAUGCUGCAGCGGCUGCAGACCUGGUGGCACGGGGUUCUGGCCUGGGUGAAGGAGAAGGUGGUGGCCCUGGUCCAUGCAGUGCAGGCCCUCUGGAAACAGUUCCAGAGUUUCUGCUGCUCUCUGUCAGAGCUCUUCAUGUCCUCUUUCCAGUCCUACGGAGCCCCACGGGGGGACAAGGAGGAGCUGACACCCCAGAAGUGCUCUGAACCCCAAUCCUCAAAAUGAAGAUACUGACACCACCUUUGCCCUCCCCGUCACCGCGCACCCACCCUGACCCCUCCCUCAGCUGUCCUGUGCCCCGCCCUCUCCCGCACACUCAGUCCCCCUGCCUGGCGUUCCUGCCGCAGCUCUGACCUGGUGCUGUCGCCCUGGCAUCUUAAUAAAACCUGCUUAUACUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-263.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -276.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 204.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((((.(((...(((((((........(((((((((.((.((((.(..((((((((.(((...........((((..((((.(((((....)).))).)))).....))))...........))).))))))))..).)))).)))))))))))......)))))))....(((((.((((.(((((((.(((....)))..))))..(((((....(((....)))...)))))((......))..((((.((...)).)))).))))))))))))..(((((((((((((...))))))))..)))))...((((.(((((((...)))))).).))))((((.((((....(((.((((((..(((((.(((((.(((...(((...(((((((((((..((((((((....))))))))..))))).........(((((((.((((.(((((((((((..(((((.((........))..)))))..)))))))..)))).....)))).)))))))......(((.(((...))).))))))).))..)))...)))............(((((......((((........))))......))))).))))).)))))....))))))))))))))))).))).)).))))))))).))).....((((((........))))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((.((((((.(((..,(((((((,.......(((((((((.{{,((((.(..((((((((.(((.,.........((((..((((.((({{....,}.))).)))).....)))).........,.))).))))))))..).)))).)}))))))))).....,))))))).,{.(({{(.((((.{((((((.(((....}}}.,)))),.|||{{..{{{{({{,((|,,(({,,||,|||||||||.,{({{.{{..,)},}}}},)})))|}}||||{.{({((((((((((...))))))))}.}})))},|||{{.{((((((...)))))).},))),(({{.((((.,{{({..{((({({.((.((((((((((.....{{.....{{({.(((((..((((((((....))))))))..))))),)).....,(((((((.((((.(((((((((((..(((((.((........))..)))))..)))))))..)))).....)))).)))))))......(((.(({...})).)))...,.)))))))))}.}),)))}},,...,|||||,,,,..{{({........))))..},..}))))...||..,,,...)),},.,))).,}}}})))).))).)),,)))))))).))},.,,.(({((|,..}}},.)))},}........................
Back