Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001013398.2

Sequence Length

2631 nt

GC Content

0.5135

AGAUGCGAGCACUGCGGCUGGGCGCUGAGGAUCAGCCGCUUCCUGCCUGGAUUCCACAGCUUCGCGCCGUGUACUGUCGCCCCAUCCCUGCGCGCCCAGCCUGCCAAGCAGCGUGCCCCGGUUGCAGGCGUCAUGCAGCGGGCGCGACCCACGCUCUGGGCCGCUGCGCUGACUCUGCUGGUGCUGCUCCGCGGGCCGCCGGUGGCGCGGGCUGGCGCGAGCUCGGCGGGCUUGGGUCCCGUGGUGCGCUGCGAGCCGUGCGACGCGCGUGCACUGGCCCAGUGCGCGCCUCCGCCCGCCGUGUGCGCGGAGCUGGUGCGCGAGCCGGGCUGCGGCUGCUGCCUGACGUGCGCACUGAGCGAGGGCCAGCCGUGCGGCAUCUACACCGAGCGCUGUGGCUCCGGCCUUCGCUGCCAGCCGUCGCCCGACGAGGCGCGACCGCUGCAGGCGCUGCUGGACGGCCGCGGGCUCUGCGUCAACGCUAGUGCCGUCAGCCGCCUGCGCGCCUACCUGCUGCCAGCGCCGCCAGCUCCAGGUGAGCCGCCCGCGCCAGGAAAUGCUAGUGAGUCGGAGGAAGACCGCAGCGCCGGCAGUGUGGAGAGCCCGUCCGUCUCCAGCACGCACCGGGUGUCUGAUCCCAAGUUCCACCCCCUCCAUUCAAAGAUAAUCAUCAUCAAGAAAGGGCAUGCUAAAGACAGCCAGCGCUACAAAGUUGACUACGAGUCUCAGAGCACAGAUACCCAGAACUUCUCCUCCGAGUCCAAGCGGGAGACAGAAUAUGGUCCCUGCCGUAGAGAAAUGGAAGACACACUGAAUCACCUGAAGUUCCUCAAUGUGCUGAGUCCCAGGGGUGUACACAUUCCCAACUGUGACAAGAAGGGAUUUUAUAAGAAAAAGCAGUGUCGCCCUUCCAAAGGCAGGAAGCGGGGCUUCUGCUGGUGUGUGGAUAAGUAUGGGCAGCCUCUCCCAGGCUACACCACCAAGGGGAAGGAGGACGUGCACUGCUACAGCAUGCAGAGCAAGUAGACGCCUGCCGCAAGGUUAAUGUGGAGCUCAAAUAUGCCUUAUUUUGCACAAAAGACUGCCAAGGACAUGACCAGCAGCUGGCUACAGCCUCGAUUUAUAUUUCUGUUUGUGGUGAACUGAUUUUUUUUAAACCAAAGUUUAGAAAGAGGUUUUUGAAAUGCCUAUGGUUUCUUUGAAUGGUAAACUUGAGCAUCUUUUCACUUUCCAGUAGUCAGCAAAGAGCAGUUUGAAUUUUCUUGUCGCUUCCUAUCAAAAUAUUCAGAGACUCGAGCACAGCACCCAGACUUCAUGCGCCCGUGGAAUGCUCACCACAUGUUGGUCGAAGCGGCCGACCACUGACUUUGUGACUUAGGCGGCUGUGUUGCCUAUGUAGAGAACACGCUUCACCCCCACUCCCCGUACAGUGCGCACAGGCUUUAUCGAGAAUAGGAAAACCUUUAAACCCCGGUCAUCCGGACAUCCCAACGCAUGCUCCUGGAGCUCACAGCCUUCUGUGGUGUCAUUUCUGAAACAAGGGCGUGGAUCCCUCAACCAAGAAGAAUGUUUAUGUCUUCAAGUGACCUGUACUGCUUGGGGACUAUUGGAGAAAAUAAGGUGGAGUCCUACUUGUUUAAAAAAUAUGUAUCUAAGAAUGUUCUAGGGCACUCUGGGAACCUAUAAAGGCAGGUAUUUCGGGCCCUCCUCUUCAGGAAUCUUCCUGAAGACAUGGCCCAGUCGAAGGCCCAGGAUGGCUUUUGCUGCGGCCCCGUGGGGUAGGAGGGACAGAGAGACAGGGAGAGUCAGCCUCCACAUUCAGAGGCAUCACAAGUAAUGGCACAAUUCUUCGGAUGACUGCAGAAAAUAGUGUUUUGUAGUUCAACAACUCAAGACGAAGCUUAUUUCUGAGGAUAAGCUCUUUAAAGGCAAAGCUUUAUUUUCAUCUCUCAUCUUUUGUCCUCCUUAGCACAAUGUAAAAAAGAAUAGUAAUAUCAGAACAGGAAGGAGGAAUGGCUUGCUGGGGAGCCCAUCCAGGACACUGGGAGCACAUAGAGAUUCACCCAUGUUUGUUGAACUUAGAGUCAUUCUCAUGCUUUUCUUUAUAAUUCACACAUAUAUGCAGAGAAGAUAUGUUCUUGUUAACAUUGUAUACAACAUAGCCCCAAAUAUAGUAAGAUCUAUACUAGAUAAUCCUAGAUGAAAUGUUAGAGAUGCUAUAUGAUACAACUGUGGCCAUGACUGAGGAAAGGAGCUCACGCCCAGAGACUGGGCUGCUCUCCCGGAGGCCAAACCCAAGAAGGUCUGGCAAAGUCAGGCUCAGGGAGACUCUGCCCUGCUGCAGACCUCGGUGUGGACACACGCUGCAUAGAGCUCUCCUUGAAAACAGAGGGGUCUCAAGACAUUCUGCCUACCUAUUAGCUUUUCUUUAUUUUUUUAACUUUUUGGGGGGAAAAGUAUUUUUGAGAAGUUUGUCUUGCAAUGUAUUUAUAAAUAGUAAAUAAAGUUUUUACCAUUAAAAAAAUAUCUUUCCCUUUGUUAUUGACCAUCUCUGGGCUUUGUAUCACUAAUUAUUUUAUUUUAUUAUAUAAUAAUUAUUUUAUUAUAAUAAAAUCCUGAAAGGGGAAAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-922.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -970.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 754.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((...(((((..((.((((.(((((((..((.....))))))..))).)))).))..)))))...(((((.((((..(((((((.((((.(((((((.((((((.(((((((((((((((.((((((((((((.((((.....)))....).)))))))).)))))))))..(((((((((((((.((...((((((.(((((((.(((((.((((((((.((((((...))).))).)))..)))))))))).).))((((((((((...))))))))))..)))))))))).)).)))))))).)))))...)))))))..)))))))))((((...((((((((((.(((.(((...(((....))).......(((.((((((((((((((((..(((((((((((.(((((((.....)).))))).)))).((((((.((.((.((((.(..(((.(((((....))).)).)))..).)))))).)))))))).((((.(((..((((((((.......)))).).)))..))).))))....)).)))))))))))).....)))))))))))).(((.(((((((.(.((((((((....(((((((((((((((((...............((((...(((...(((.......)))..)))))))..((((..((((((.((((........)))).))....))))...)))))))))))))......((((((.(........).))))))((.....))...((((((.........((((((..((((((..((...((((((((((...(((....(((....((((((....))))))..)))...)))...))))))))))...)).....))))))....))))))..)))))).(((((.....)))))))))))))....)).)))))).).)))).))).)))..........((((...((((.((((..((.((((((((.(((.(((.......((((((.((((((((((((((((.(((....((((((((.....(((........))).)))).))))...))).(((((((((.(((.(((.............))).)))........(((((((((((....)))))))))))((....((((((((....(((((((......)).)))))...))))...))))....)).)))))))))...(((...(((((((.((.(((...........))))).)))))))..)))(((((...(((...(.(.....))....)))...))))).))))))((((((((...))))))))...))))))))))...))))))))).))))))...)))))))..))))))))..))))...)))))).))))))))))))))..........(((((..............((((....))))...(((((.....(((.((((((((........((((..((((.(((.....(((((((.....((((.((...(((...............(((((((((((........)))))))))))...............))))).))))..))))))).......)))))))..)))).)))))))))))...))))).)))))...))))))).....)))).....(((((((((....)))))))))...(((((((.((((((((......))))))))))).)))).)))))))..)).))))))).....((((((..(((((((((........))))).....(((.(((......)))))).((((((..(..(((((((.(((((((.((((....))))))))))).(((((((((....)))))))))......((((...)))))))))))..)..))))))....((((((((.......((...................)).......)))))))).((((((.(((((((((....((((....))))((((.(((.((((...(((...((((...))))...).))...)))))))((((((((((.............((((((((.((((.....)))).)).....))))))...(((((......((((((((...((((..((((......)))).........))))..)))))))).......)))))........)))))))))).))))..((((((...)))))).)))).)))))))))))..((((((((((((((((...)))))))((((((((((((((...(((..........((((((....)))))))))))))).)))))))))...(((((..(((....))).)))))...............................)))))))))((((((.(((((((((((((.(((((.((((.((..........)).))))))))).))))))........))))))).))))))........))))..)))))).)).))))))).............(((((((((((((........))).))))))))))((((.....)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((((.,((((((.(((((((({...})))(((((((((((((,,.{((,((.((...{.(((((((.(((((.(((....(((({((({{..((((((..(((((((....(((...(((((.((((((((((((.({{(.....}}}....).)))))))).)))))))))))))))))))..)))))),},,))|||||||||({((((((.((.{((({{(({{((({....{{((((((((.,{(({({({.,|},{{{|||||{|,,.))))))))))||{{||,|||,,.))},))||||{{((((((((.(.(((((.((....)).))))).).)))))))}.((((((((((((((..(((((.((......))..)))))))))..))))))))))(,{(((.(((((((.....)).))))).))))){(((((,((.((.((((.(,,(((.(((((....})}.}).))),.).)))))),)))))))}.,,.))}..}))))}})))))))))}}}}..)))))})))))))).....(((.(.((.((((((({,({,{(,.....,}||.(((((((((.........)))))},))),....(((((((((...............((((...(({...(((....,},.,,..))}))))..((((..((((((.((((........)))).))....))))...)))))))))))))......}))))))))).))).)))))).))))).)))))))....)).)).},,...{(((((.,((((((..{{...((((((((((...(((.,..(((....((((((....)))))),.)))..,))).,.)))))))))}...)}.....)))))).,..)))))).)))))))))))))..(((((.((((((,(((,...,({.((((.{{...}})))).})),))))))),,).)))))....{(.(((.((((........)))).))}.}}...))))))))))}.{||,..,({(({(((({{.,.((((,,,.,,.,,...{{(((..(((((((.{{{{{((..(((.(.(((((((,{..((........}}.}.})))))).).)))..(((((((((((....))))))))))))))}......}})))).)))).))))),...)))).,.)})})),|,,,}}}},((((((((((((.,{...{(({{{(,,{,,......,({{{{{{.....|||,,.|||||||,,,{,({(({,,{{..,,,{...,{.,((({{{{{(({{{{..{{||||{.((((((((...)))))))),,,.,...,{|||(({((((,((({{{||||||||{||.{{{,....{{||....,.{{((....,...}))).}...}})),,,.}}....,,|||....,},.......((((....))))......}}})))),)}}}))})}),)|||||....}))))))),)})))),,,.....||||||{||,...{{......||,}|,,}}}},})}}}},}))))))..}.)))))))),,)))))))))))),{{{{{{|{((...,)}})))}})}.....,|,,,{{{{,,,({.{,,|||{((((...((((((((((........)))).)))))))))}}..(((((((((....)))))))))...(((((((.((((((((......))))))))))).))))...((((((((((((((((((((((..(((((({,,.(((((........)))))..,..,,,.,,|.,,...,||||,.||}},,}}|,|{{{,,,,..((((((,((({....})))}}})))|.{((((((({....})))))))),..,.{{{|{...))))))}}}}}.)))))).))))))))))))))....(((((((.,..(((((({....,,,{..,,,{{,,.,{,{(((((((((,,((((..,))},{((((....))))|,}|,.,,,{,,||||..}},},}})}}}},.}},.}})))}}}))|.{,({{{(({.{{{{...........}}}).))))))),},))))))).}}.)))))))..........)))))}.,(((((,....,|||}}{{{|....,.}))),,,...,,|||||{{||}|}}||{|||....,}|||||,,..{||.||,..||{||,,,.((((((...)))))),}}}})))))),))))}..((((((((((((((((...)))))))((((((((((((((,..,,..||||....,((((((....)))))))}}})))).)))))))))...(((((..(((....))).}))))..........,,........,..........)))))))))((((((.(((((((((((((.(((((.((((.,{.,,.......}}.))))))))).)))))}.......,))))))).))))))..}}}}}}.,,,)}))))))}))})))))))............,(((((((((({(({{{.....))))))))))))))|(((.....)))}.....