Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001014989.2
Sequence Length
1472 nt
GC Content
0.5999
GUACCCCAGAAUUCCCACUGUCAGGGCCUCCCUGCUCGCUGCCUCCCCGGGUCCUGGAUAUGGAGGCCACGGCUGCCAGCUGGCAGGUGGCUGUCCCCGUCUUGGGGGGGGCCAGCAGACCCUUGGGGCCUAGGGGUGCAGCCAGCCUGCUCCGAGCUCCCCUGCAGAUGGAGGAGGCCAUCCUGGUCCCCUGCGUGCUGGGGCUCCUGCUGCUGCCCAUCCUGGCCAUGUUGAUGGCACUGUGUGUGCACUGCCACAGACUGCCAGGCUCCUACGACAGCACAUCCUCAGAUAGUUUGUAUCCAAGGGGCAUCCAGUUCAAACGGCCUCACACGGUUGCCCCCUGGCCACCUGCCUACCCACCUGUCACCUCCUACCCACCCCUGAGCCAGCCAGACCUGCUCCCCAUCCCAAGAUCCCCGCAGCCCCUUGGGGGCUCCCACCGGACGCCAUCUUCCCGGCGGGAUUCUGAUGGUGCCAACAGUGUGGCGAGCUACGAGAACGAGGAACCAGCCUGUGAGGAUGCGGAUGAGGAUGAGGACGACUAUCACAACCCAGGCUACCUGGUGGUGCUUCCUGACAGCACCCCGGCCACUAGCACUGCUGCCCCAUCAGCUCCUGCACUCAGCACCCCUGGCAUCCGAGACAGUGCCUUCUCCAUGGAGUCCAUUGAUGAUUACGUGAACGUUCCGGAGAGCGGGGAGAGCGCAGAAGCGUCUCUGGAUGGCAGCCGGGAGUAUGUGAAUGUGUCCCAGGAACUGCAUCCUGGAGCGGCUAAGACUGAGCCUGCCGCCCUGAGUUCCCAGGAGGCAGAGGAAGUGGAGGAAGAGGGGGCUCCAGAUUACGAGAAUCUGCAGGAGCUGAACUGAGGGCCUGUGGAGGCCGAGUCUGUCCUGGAACCAGGCUUGCCUGGGACGGCUGAGCUGGGCAGCUGGAAGUGGCUCUGGGGUCCUCACAUGGCGUCCUGCCCUUGCUCCAGCCUGACAACAGCCUGAGAAAUCCCCCCGUAACUUAUUAUCACUUUGGGGUUCGGCCUGUGUCCCCCGAACGCUCUGCACCUUCUGACGCAGCCUGAGAAUGACCUGCCCUGGCCCCAGCCCUACUCUGUGUAAUAGAAUAAAGGCCUGCGUGUGUCUGUGUUGAGCGUGCGUCUGUGUGUGCCUGUGUGCGAGUCUGAGUCAGAGAUUUGGAGAUGUCUCUGUGUGUUUGUGUGUAUCUGUGGGUCUCCAUCCUCCAUGGGGGCUCAGCCAGGUGCUGUGACACCCCCCUUCUGAAUGAAGCCUUCUGACCUGGGCUGGCACUGCUGGGGGUGAGGACACAUUGCCCCAUGAGACAGUCCCAGAACACGGCAGCUGCUGGCUGUGACAAUGGUUUCACCAUCCUUAGACCAAGGGAUGGGACCUGAUGACCUGGGAGGACUCUCUUAGUUCUUACCUUUUGUGGUUCUCAAUAAAACAGAACUUAAAAAAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-592.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -616.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 298.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.....(((.(((((.((((...(((...((((.(((...(((...(((.((.(((((..((((.((...(..(((((((((((...(((.....)))((((((.....((((..(((((((((((((..(((...((((.(((((.((......))...))))).))))....)))..)))))).(.((((((((((((((((.((.....((((((...(((..(((((.(((....))).)))))..))).))))))......)).)))).........((((.....))))..)))))).)))))).)....)))))))...)))))))))).)))))))))))..).)).))))..))))))).))).))).))).))))))).(((..(((.(((((....((((.(((.(((((...)))))((((.((((...........)))).))))((((..((((((((......))))..))))..))))..(((......)))))).))))..))))).)))..))).............(((((((..((((((......(((.(((((.((..(((((.....(((....((((((((((((((((((((((((.(((((....((((...(..((((((((.((((..(((.......)))..))))..(((((....)))))((((((((((....))).))))(((((.(((((((((.(((....)))..)))).))..)))))))).((.(((((.............)))))))......)))))))))))..)....)))).....)))))))).........)))....))))))))))))..)).))))..)))..))))).)))))))..)))))))))...))))))).((((...))))((((((((...(((..(((((((..((((...((((...((.((((((((((((..((((.(((.(((((......(((((................)))))))))).)))))))......((((((.((((...(..(((((((((................(((....)))....(((((...)))))....))).))))))..)...)))).))))))(((.(.....))))....((((.((((((.(((((((....((((....))))..(((((.....((((((((((((((((((.....)))))))))))..)))))))...)))))....((((.....))))..))))))).)))))).)))).))).))))))))).))...))))...))))....))))))).)))..)))))))))))).))))).)))..((.((((((((......)))))))))).........)))))((((((.....))))))....((((..((((((.........))))))..))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((.....(((.(((((.((((..{(.((({((((.(((...(((,..(((.{{.(((((..((((.((...{..(((((((((((..((((.....})))|(((({{(({({{({{(((,((,((((((..(((...((((.(((((.((......))...))))).))))....)))..)))))).|},||||||,|||||}||..}}}}..((((((...(((..(((((.(((....))).)))))..))).)))))).......,,|||}|{{,{....|||,,,,,})},,..,|||||{.||,||.,....}},}},,...)),)))))),})))))))))))..}.)).))))..)))))}}.)}),)),.)}}.}}}},,|.(((..(((.(((((....((((.(((((((((...))))){(((.((((..,......,,}})).)))},(((..((({((({.....,)))),.))))..))),..{((......)))))).))))..))))).)))..)))..,..........(((((((..((((({.....,(((.(((((.{{..(((((.....(((.,..(((((((((((((((((({{{(((.((((({{({(,,,...,.}||||((((((((,..,(({....,,|,|,,|||,.,({((({{{.,,|||{{{(((((((....))),)))){{{|,||{{||||||.{||,,..}})}}))||,||,.}}}},)))}}}.||{(({.......,}}|{|||,,((((......)))),)))),.),,.}))))}}}..))))))))...,,,,..}}},,,,))))))))))))..)).))))..))),.))))).)))))))..)))))))))...))))))).,|||.}})),)|(((((((...(((..((((((({.{(((...((((...((.((((((((((((..(((,,(((.(((((.....,((({(................,))))))))).)))))))...,,.((((((.((((...{..(((((((((.,,......,,.....(((....)))....(((((...)))))....)))}})))))..}...)))).)))))){||.,.....,,}}....((((.((((((.(((((((....((((....))))|.(((((.....((((((((((((((((((.....)))))))))))..)))))))...)))))....((((.....))))..})))))).}))))).)))).))))))))))))).))...))))...))))},..})))))).)))..))))))),)))).))))).)))..{(.((((((((......)))))))))}.........)))))((((((.....))))))....((((..((((((.........))))))..))),....
Back