Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001020819.3
Sequence Length
3118 nt
GC Content
0.5394
AGACCCUUCCAGCUGCCGCUGUCGUCUUUGCUUCAGCCGCAGUCGCCACUGGCUGCCUGAGGGCGUUCGAUCCCUAGAGGGAGGAGCCUGUCCAAACGGACGCUAACGGCCUACCUCCCCCUCAGGUGCUCUUACAGCCUGUUCCAAGUGUGGCUUAAUCCGUCUCCACCACCAGAUCUUUCUCCGUGGAUUCCUCUGCUAAGACCGCUGCCAUGCCAGUGACGGUAACCCGCACCACCAUCACAACCACCACGACGUCAUCUUCGGGCCUGGGGUCCCCCAUGAUCGUGGGGUCCCCUCGGGCCCUGACACAGCCCCUGGGUCUCCUUCGCCUGCUGCAGCUGGUGUCUACCUGCGUGGCCUUCUCGCUGGUGGCUAGCGUGGGCGCCUGGACGGGGUCCAUGGGCAACUGGUCCAUGUUCACCUGGUGCUUCUGCUUCUCCGUGACCCUGAUCAUCCUCAUCGUGGAGCUGUGCGGGCUCCAGGCCCGCUUCCCCCUGUCUUGGCGCAACUUCCCCAUCACCUUCGCCUGCUAUGCGGCCCUCUUCUGCCUCUCGGCCUCCAUCAUCUACCCCACCACCUAUGUCCAGUUCCUGUCCCACGGCCGUUCGCGGGACCACGCCAUCGCCGCCACCUUCUUCUCCUGCAUCGCGUGUGUGGCUUACGCCACCGAAGUGGCCUGGACCCGGGCCCGGCCCGGCGAGAUCACUGGCUAUAUGGCCACCGUACCCGGGCUGCUGAAGGUGCUGGAGACCUUCGUUGCCUGCAUCAUCUUCGCGUUCAUCAGCGACCCCAACCUGUACCAGCACCAGCCGGCCCUGGAGUGGUGCGUGGCGGUGUACGCCAUCUGCUUCAUCCUAGCGGCCAUCGCCAUCCUGCUGAACCUGGGGGAGUGCACCAACGUGCUACCCAUCCCCUUCCCCAGCUUCCUGUCGGGGCUGGCCUUGCUGUCUGUCCUCCUCUAUGCCACCGCCCUUGUUCUCUGGCCCCUCUACCAGUUCGAUGAGAAGUAUGGCGGCCAGCCUCGGCGCUCGAGAGAUGUAAGCUGCAGCCGCAGCCAUGCCUACUACGUGUGUGCCUGGGACCGCCGACUGGCUGUGGCCAUCCUGACGGCCAUCAACCUACUGGCGUAUGUGGCUGACCUGGUGCACUCUGCCCACCUGGUUUUUGUCAAGGUCUAAGACUCUCCCAAGAGGCUCCCGUUCCCUCUCCAACCUCUUUGUUCUUCUUGCCCGAGUUUUCUUUAUGGAGUACUUCUUUCCUCCGCCUUUCCUCUGUUUUCCUCUUCCUGUCUCCCCUCCCUCCCACCUUUUUCUUUCCUUCCCAAUUCCUUGCACUCUAACCAGUUCUUGGAUGCAUCUUCUUCCUUCCCUUUCCUCUUGCUGUUUCCUUCCUGUGUUGUUUUGUUGCCCACAUCCUGUUUUCACCCCUGAGCUGUUUCUCUUUUUCUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAGACGGAUUCUCACUCUGUGGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCGAUCUCGACUCACUGCAACCCCCGCCUCCUGGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCCCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAGGACAGGUGUGAGCUGCCGCACCCAGCCUGUUUCUCUUUUUCCACUCUUCUUUUUUCUCAUCUCUUUUCUGGGUUGCCUGUCGGCUUUCUUAUCUGCCUGUUUUGCAAGCACCUUCUCCUGUGUCCUUGGGAGCCCUGAGACUUCUUUCUCUCCUUGCCUCCACCCACCUCCAAAGGUGCUGAGCUCACAUCCACACCCCUUGCAGCCGUCCAUGCCACAGCCCCCCAAGGGGCCCCAUUGCCAAAGCAUGCCUGCCCACCCUCGCUGUGCCUUAGUCAGUGUGUACGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUUUGGGGGGUGGGGGGUGGGUAGCUGGGGAUUGGGCCCUCUUUCUCCCAGUGGAGGAAGGUGUGCAGUGUACUUCCCCUUUAAAUUAAAAAACAUAUAUAUAUAUAUAUUUGGAGGUCAGUAAUUUCCAAUGGGCGGGAGGCUUUAAGCACCGACCCUGGGUCCCUAGGCCCCGCCUGGCACUCAGCCUUGCCAGAGAUUGGCUCCAGAAUUUUUGCCAGGCUUACAGAACACCCACUGCCUAGAGGCCAUCUUAAAGGAAGCAGGGGCUGGAUGCCUUUCAUCCCAACUAUUCUCUGUGGUAUCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGAGUCGGGGCCGGGCGUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGACCAAGUCAGGCAAUCAUCUGAAGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAAGCAUGUCUCUAUUAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCGGGCGCCUGUAAUCCCAGGUAUUUGGGGGGACUGAGACAGGAGAAUCCCUUCAACCCGGGAGGUGGAGGUUGCAGUAAGUCAAGAUGGCACCACUGUGCUCCAGCCUGGGGGACAGAGCGAGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAGGAAUCGGACGAAGAACCACAGGAUGUUGAAGACAACUGUCUGAAGUAUUUGUGAGGGACAGCGAUGUGGCCCUCUGUGUUAAGAAUAACGUGUCCUGCUUUGGCAGAGAGAAGAAAAUAGCCACUGCCCGCUUUCAAGGCAAGAUCGACCUUUUCUGUUUUGUUUUGUUUUUCUUUCUUUUUCCUGGCCAUGAGGACAAAAAUUACUGAGUGGCCCUUAAAGAGGGAAGUUUGUUUUCAGCUGUUCUCUUUUGCCCGUAGGUGGGAGGGUGGGGAUUGCUGCGUCCUAGCUAGAGGAAUGGCUUUGCUUGAAUGUGUAGUGCACACGCACGGGUGUUUCUGUGUGCUAGUUGCUUCUUGCUGCUGCUUCCUGCUUGUCUGGGACUCACAUACAUAACGUGAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAAAUGUAUAAAUAUAUAUUUUAUUUUUUUUUAAAUCCCUGGAGCUUCUGGUUCCUAUCAGUUCCUGUUGUUAAUCGUAGAACCGUUGUCCCUUCCCCCAUUCCCGUAUCCAUCAUGUUCUUUUUCUUUUAAAUAUCAAUAUAAAGGUAAAAGAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1169.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1222.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 739.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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