Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001025235.2
Sequence Length
1420 nt
GC Content
0.6430
CGUGCGGCCAGGGUCCCGUGGCCGGAGGUGUCCGACCGGGAGCGGCUGGAGCCGGACGCGAGCGGGGCGCGCGAGUUCGAGCCCAGAGCCGACACGCAGCAACAAAGCUUGGGGCUUCCUUGGUCGCACCCACCACCUGCCUGCCCACUGGUCAGCCUUCAGGGACCCUGAGCACCGCCUGGUCUCUUUCCUGUGGCCAGCCCAGAACUGAAGCGCUGCGGCAUGGCGCGCGCCUGCCUCCAGGCCGUCAAGUACCUCAUGUUCGCCUUCAACCUGCUCUUCUGGCUGGGAGGCUGUGGCGUGCUGGGUGUCGGCAUCUGGCUGGCCGCCACACAGGGGAGCUUCGCCACGCUGUCCUCUUCCUUCCCGUCCCUGUCGGCUGCCAACUUGCUCAUCAUCACCGGCGCCUUUGUCAUGGCCAUCGGCUUCGUGGGCUGCCUGGGUGCCAUCAAGGAGAACAAGUGCCUCCUGCUCACUUUCUUCCUGCUGCUGCUGCUGGUGUUCCUGCUGGAGGCCACCAUCGCCAUCCUCUUCUUCGCCUACACGGACAAGAUUGACAGGUAUGCCCAGCAAGACCUGAAGAAAGGCUUGCACCUGUACGGCACGCAGGGCAACGUGGGCCUCACCAACGCCUGGAGCAUCAUCCAGACCGACUUCCGCUGCUGUGGCGUCUCCAACUACACUGACUGGUUCGAGGUGUACAACGCCACGCGGGUACCUGACUCCUGCUGCUUGGAGUUCAGUGAGAGCUGUGGGCUGCACGCCCCCGGCACCUGGUGGAAGGCGCCGUGCUACGAGACGGUGAAGGUGUGGCUUCAGGAGAACCUGCUGGCUGUGGGCAUCUUUGGGCUGUGCACGGCGCUGGUGCAGAUCCUGGGCCUGACCUUCGCCAUGACCAUGUACUGCCAAGUGGUCAAGGCAGACACCUACUGCGCGUAGGCCGCCCACCGCCCGCUUCUCUGCCAAAAGGACGCCCACGGGGAGAUGGCCGCACCCACAGCUGCCUUUCCCACCACCAGCCUCGGUGCUCUGCCCCAUGCUGGGAGGAGGGAGGGAGGGACAGGUGCCUGGAGCCCCCGGAACCCUGUUUCUGGAAGGCCCUAGCUCAGGUGGCUUCAGGGCCUCCGGACCCCCCCUGGGAGGGGUGGCCACGUGCUGGCUGCGGAACCCAGGGCAGGGGUGGGAGGGGCCUCCAGCACUUUUUAUAUUUACGUAUUCUCCAAAGCAGUGUUCACACGGGAGCCAGCCUGUGGCCCCCAGCCUCCUGGAAAACAGGUUGGCGCUGGAGGAGCCGGGUCUUGGCAUCCUGGAGGUGGCCCCACUGGUCCUGGUGCUCCAGGCGGGGCCGUGGACCCCUCACCUACAUUCCAUAGUGGGCCCGUGGGGCUCCUGGUGCAUCUUAAUAAAGUGUGAGCAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-658.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -677.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 225.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((...((((((((......((((((.(((((.((((((.(.((..(((.(.((((((((.((((..((((.(((((.((((.................)))).)))))((((((((.(((((((......((..(((((((((.(((((..(((((((...(((.((.((.((((..((((((((((((((((((((..(....)..))).))).))))(((((((.((((((.(((((...((((.....((........))...))))....))))).))))))...)))))))(((..((((((.....))))))..)))))))))))))....)))).)).)).))).........)))))))..))))))))...............((((.(((........)))..))))....)))))).)).))))))).))))))))))))..)))).)))))))).)..)))..)).).)))))).))))).........((((((.......))).)))((((.((((......)))).))))...((((((.......(((((.(((......))))))))))))))..((((.((.((((...((((((....((.(((((((((......))))).......((((..((..(((((((((((.(((...((.((((...(.(((((.((..(((.(((((.(.(((((((((........)))).)))).)..).)))))))))).))))))))))))..)))))).)))))))).))..)).)).(((((((((..((((.(((((..(((.((..((((((.(((((....)).))).)))))))).))).....)))))))))..))))))))).(((((((..........)))))))..((((.......)))))))).))..)))))).)))))).....))))....))))))))))))))...))))))))).....((((((((((((.((.(((((...((.((...))))...)))))..)).))))))).((((...(((((.(((((((((((..((((((..(((((.((((((((((.....))))..)))))))))))((((((((((((....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))(((((((((((((((((((((((((((....)))).....)))).)))))).....((((((((((((..((((((((((((((((.....))))..)).))))).)).)))))))..)))).))))))))).((((((....(.(((((....)))))))))))).....)))))).))........)))).))..))).)))))))).))))).))))............)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((...((((((((.,,,,,{{{|||,{{(((.((((((.(,((..(((.(.((((((((.((((..((((,(((((.((((.................)))).)))))|(((((((.(((((((......((..(((((((((.(((((..(((((((...(((.((.((.((((..((((((((((((((((((((..(....}..))).))).))))(((((((.((((((.(((((..,(({,.....{(........}}...})}},,,.))))).))))))...))))))){{(|,((((((.....)))))),,)),))))))))))....)))).)).)).))).........)))))))..))))))))...............((((.(((........)))..))))....)))))).)).))))))).)))))))}))))..)))).)))))))).).,))},,)},),)))))),))|||{,,{{,...((((((.......))).)))((((.((((......)))).))))...((((((.......(((((.(((......)))))))))))))).,((((.({.((((...((((((....((.(((((((((......))))).,,,.,,{{((..((..(((((((((({{(((...((.({((...{.(((((.{,.,{((.{((((.(.{((((((((........))))}}))).}..},|||}||||}}.}}))))}))))}..)))))),,))))))).))..)).)},|||((((((..((({{(((((..(((.((..((((((.((({(....)).))).)))))))).))).....)))))))))..))))))|||.(((((((..........))))))).,||{{.......}}}})))).))..)))))).)))))).....))))....))))))))))))))...))))))))).....((((((((((((.((.(((((...((.((...)))).,.)))))..)).))))))).,{{,.,,(((((.(((((((((((..((((((..((((,,((((((((((.....))))..)))))))))))((((((((((((....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))(((((((({{(((((((((,{{{,,,.....,,,,.....}}}}.))))),..,.|((((((((((((..((((((((((((((((.....))))..)).))))).)).))))))}..)))).)))))}})},((((((.,,,(.{({{{.,..))))},))))))}.}}.)))))).))........)))).))..))).)))))))).))})),))),............)))))..
Back