Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001025236.2
Sequence Length
1425 nt
GC Content
0.6435
CGUGCGGCCAGGGUCCCGUGGCCGGAGGUGUCCGACCGGGAGCGGCUGGAGCCGGACGCGAGCGGGGCGCGCGAGUUCGAGCCCAGAGCCGACACGCAGCAACAAGUGGGAGCUUGGGGCUUCCUUGGUCGCACCCACCACCUGCCUGCCCACUGGUCAGCCUUCAGGGACCCUGAGCACCGCCUGGUCUCUUUCCUGUGGCCAGCCCAGAACUGAAGCGCUGCGGCAUGGCGCGCGCCUGCCUCCAGGCCGUCAAGUACCUCAUGUUCGCCUUCAACCUGCUCUUCUGGCUGGGAGGCUGUGGCGUGCUGGGUGUCGGCAUCUGGCUGGCCGCCACACAGGGGAGCUUCGCCACGCUGUCCUCUUCCUUCCCGUCCCUGUCGGCUGCCAACUUGCUCAUCAUCACCGGCGCCUUUGUCAUGGCCAUCGGCUUCGUGGGCUGCCUGGGUGCCAUCAAGGAGAACAAGUGCCUCCUGCUCACUUUCUUCCUGCUGCUGCUGCUGGUGUUCCUGCUGGAGGCCACCAUCGCCAUCCUCUUCUUCGCCUACACGGACAAGAUUGACAGGUAUGCCCAGCAAGACCUGAAGAAAGGCUUGCACCUGUACGGCACGCAGGGCAACGUGGGCCUCACCAACGCCUGGAGCAUCAUCCAGACCGACUUCCGCUGCUGUGGCGUCUCCAACUACACUGACUGGUUCGAGGUGUACAACGCCACGCGGGUACCUGACUCCUGCUGCUUGGAGUUCAGUGAGAGCUGUGGGCUGCACGCCCCCGGCACCUGGUGGAAGGCGCCGUGCUACGAGACGGUGAAGGUGUGGCUUCAGGAGAACCUGCUGGCUGUGGGCAUCUUUGGGCUGUGCACGGCGCUGGUGCAGAUCCUGGGCCUGACCUUCGCCAUGACCAUGUACUGCCAAGUGGUCAAGGCAGACACCUACUGCGCGUAGGCCGCCCACCGCCCGCUUCUCUGCCAAAAGGACGCCCACGGGGAGAUGGCCGCACCCACAGCUGCCUUUCCCACCACCAGCCUCGGUGCUCUGCCCCAUGCUGGGAGGAGGGAGGGAGGGACAGGUGCCUGGAGCCCCCGGAACCCUGUUUCUGGAAGGCCCUAGCUCAGGUGGCUUCAGGGCCUCCGGACCCCCCCUGGGAGGGGUGGCCACGUGCUGGCUGCGGAACCCAGGGCAGGGGUGGGAGGGGCCUCCAGCACUUUUUAUAUUUACGUAUUCUCCAAAGCAGUGUUCACACGGGAGCCAGCCUGUGGCCCCCAGCCUCCUGGAAAACAGGUUGGCGCUGGAGGAGCCGGGUCUUGGCAUCCUGGAGGUGGCCCCACUGGUCCUGGUGCUCCAGGCGGGGCCGUGGACCCCUCACCUACAUUCCAUAGUGGGCCCGUGGGGCUCCUGGUGCAUCUUAAUAAAGUGUGAGCAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-663.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -682.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 227.17
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((...((((((((......((((((.(((((.((((((.(.((..(((.(.((((((((.((((..((((.(((((.((((...(((..........)))...)))).)))))((((((((.(((((((......((..(((((((((.(((((..(((((((...(((.((.((.((((..((((((((((((((((((((..(....)..))).))).))))(((((((.((((((.(((((...((((.....((........))...))))....))))).))))))...)))))))(((..((((((.....))))))..)))))))))))))....)))).)).)).))).........)))))))..))))))))...............((((.(((........)))..))))....)))))).)).))))))).))))))))))))..)))).)))))))).)..)))..)).).)))))).))))).........((((((.......))).)))((((.((((......)))).))))...((((((.......(((((.(((......))))))))))))))..((((.((.((((...((((((....((.(((((((((......))))).......((((..((..(((((((((((.(((...((.((((...(.(((((.((..(((.(((((.(.(((((((((........)))).)))).)..).)))))))))).))))))))))))..)))))).)))))))).))..)).)).(((((((((..((((.(((((..(((.((..((((((.(((((....)).))).)))))))).))).....)))))))))..))))))))).(((((((..........)))))))..((((.......)))))))).))..)))))).)))))).....))))....))))))))))))))...))))))))).....((((((((((((.((.(((((...((.((...))))...)))))..)).))))))).((((...(((((.(((((((((((..((((((..(((((.((((((((((.....))))..)))))))))))((((((((((((....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))(((((((((((((((((((((((((((....)))).....)))).)))))).....((((((((((((..((((((((((((((((.....))))..)).))))).)).)))))))..)))).))))))))).((((((....(.(((((....)))))))))))).....)))))).))........)))).))..))).)))))))).))))).))))............)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((...((((((((.,,,,,{{{|||,{{(((.((((((.(,((..(((.(.((((((((.((((..((((,(((((.((((...(((..........)))...)))).)))))|(((((((.(((((((......((..(((((((((.(((((..(((((((...(((.((.((.((((..((((((((((((((((((((..(....}..))).))).))))(((((((.((((((.(((((..,(({,.....{(........}}...})}},,,.))))).))))))...))))))){{(|,((((((.....)))))),,)),))))))))))....)))).)).)).))).........)))))))..))))))))...............((((.(((........)))..))))....)))))).)).))))))).)))))))}))))..)))).)))))))).).,))},,)},),)))))),))|||{,,{{,...((((((.......))).)))((((.((((......)))).))))...((((((.......(((((.(((......)))))))))))))).,((((.({.((((...((((((....((.(((((((((......))))).,,,.,,{{((..((..(((((((((({{(((...((.({((...{.(((((.{,.,{((.{((((.(.{((((((((........))))}}))).}..},|||}||||}}.}}))))}))))}..)))))),,))))))).))..)).)},|||((((((..((({{(((((..(((.((..((((((.((({(....)).))).)))))))).))).....)))))))))..))))))|||.(((((((..........))))))).,||{{.......}}}})))).))..)))))).)))))).....))))....))))))))))))))...))))))))).....((((((((((((.((.(((((...((.((...)))).,.)))))..)).))))))).,{{,.,,(((((.(((((((((((..((((((..((((,,((((((((((.....))))..)))))))))))((((((((((((....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))(((((((({{(((((((((,{{{,,,.....,,,,.....}}}}.))))),..,.|((((((((((((..((((((((((((((((.....))))..)).))))).)).))))))}..)))).)))))}})},((((((.,,,(.{({{{.,..))))},))))))}.}}.)))))).))........)))).))..))).)))))))).))})),))),............)))))..
Back