Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001025237.2
Sequence Length
1489 nt
GC Content
0.6400
CCAUUUCCCAGCAGAGCCCCUGAGAUCUGGAGACUGCCCCAGCCUCAGGCUCUGUGCAUCUCCCCCGAGCCCCCACCACAUAUGUGCGGAGGCCCCUGGGGGCCCAGGCCUGUCCUCAGUCCCGACUGGGCUCUACCUGAGGACCCUGGGGAGCCUGGGCCUGGCCCUCCUCAGAGCUUGGGGCUUCCUUGGUCGCACCCACCACCUGCCUGCCCACUGGUCAGCCUUCAGGGACCCUGAGCACCGCCUGGUCUCUUUCCUGUGGCCAGCCCAGAACUGAAGCGCUGCGGCAUGGCGCGCGCCUGCCUCCAGGCCGUCAAGUACCUCAUGUUCGCCUUCAACCUGCUCUUCUGGCUGGGAGGCUGUGGCGUGCUGGGUGUCGGCAUCUGGCUGGCCGCCACACAGGGGAGCUUCGCCACGCUGUCCUCUUCCUUCCCGUCCCUGUCGGCUGCCAACUUGCUCAUCAUCACCGGCGCCUUUGUCAUGGCCAUCGGCUUCGUGGGCUGCCUGGGUGCCAUCAAGGAGAACAAGUGCCUCCUGCUCACUUUCUUCCUGCUGCUGCUGCUGGUGUUCCUGCUGGAGGCCACCAUCGCCAUCCUCUUCUUCGCCUACACGGACAAGAUUGACAGGUAUGCCCAGCAAGACCUGAAGAAAGGCUUGCACCUGUACGGCACGCAGGGCAACGUGGGCCUCACCAACGCCUGGAGCAUCAUCCAGACCGACUUCCGCUGCUGUGGCGUCUCCAACUACACUGACUGGUUCGAGGUGUACAACGCCACGCGGGUACCUGACUCCUGCUGCUUGGAGUUCAGUGAGAGCUGUGGGCUGCACGCCCCCGGCACCUGGUGGAAGGCGCCGUGCUACGAGACGGUGAAGGUGUGGCUUCAGGAGAACCUGCUGGCUGUGGGCAUCUUUGGGCUGUGCACGGCGCUGGUGCAGAUCCUGGGCCUGACCUUCGCCAUGACCAUGUACUGCCAAGUGGUCAAGGCAGACACCUACUGCGCGUAGGCCGCCCACCGCCCGCUUCUCUGCCAAAAGGACGCCCACGGGGAGAUGGCCGCACCCACAGCUGCCUUUCCCACCACCAGCCUCGGUGCUCUGCCCCAUGCUGGGAGGAGGGAGGGAGGGACAGGUGCCUGGAGCCCCCGGAACCCUGUUUCUGGAAGGCCCUAGCUCAGGUGGCUUCAGGGCCUCCGGACCCCCCCUGGGAGGGGUGGCCACGUGCUGGCUGCGGAACCCAGGGCAGGGGUGGGAGGGGCCUCCAGCACUUUUUAUAUUUACGUAUUCUCCAAAGCAGUGUUCACACGGGAGCCAGCCUGUGGCCCCCAGCCUCCUGGAAAACAGGUUGGCGCUGGAGGAGCCGGGUCUUGGCAUCCUGGAGGUGGCCCCACUGGUCCUGGUGCUCCAGGCGGGGCCGUGGACCCCUCACCUACAUUCCAUAGUGGGCCCGUGGGGCUCCUGGUGCAUCUUAAUAAAGUGUGAGCAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-683.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -705.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 339.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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