Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001025238.2

Sequence Length

1279 nt

GC Content

0.6403

GUGUCCGCUUGACUGACAGCUGCGCGGCGGGAGCGGGCGGCGCGAGCGGGAGGCGGCGGCGCAGAACUGAAGCGCUGCGGCAUGGCGCGCGCCUGCCUCCAGGCCGUCAAGUACCUCAUGUUCGCCUUCAACCUGCUCUUCUGGCUGGGAGGCUGUGGCGUGCUGGGUGUCGGCAUCUGGCUGGCCGCCACACAGGGGAGCUUCGCCACGCUGUCCUCUUCCUUCCCGUCCCUGUCGGCUGCCAACUUGCUCAUCAUCACCGGCGCCUUUGUCAUGGCCAUCGGCUUCGUGGGCUGCCUGGGUGCCAUCAAGGAGAACAAGUGCCUCCUGCUCACUUUCUUCCUGCUGCUGCUGCUGGUGUUCCUGCUGGAGGCCACCAUCGCCAUCCUCUUCUUCGCCUACACGGACAAGAUUGACAGGUAUGCCCAGCAAGACCUGAAGAAAGGCUUGCACCUGUACGGCACGCAGGGCAACGUGGGCCUCACCAACGCCUGGAGCAUCAUCCAGACCGACUUCCGCUGCUGUGGCGUCUCCAACUACACUGACUGGUUCGAGGUGUACAACGCCACGCGGGUACCUGACUCCUGCUGCUUGGAGUUCAGUGAGAGCUGUGGGCUGCACGCCCCCGGCACCUGGUGGAAGGCGCCGUGCUACGAGACGGUGAAGGUGUGGCUUCAGGAGAACCUGCUGGCUGUGGGCAUCUUUGGGCUGUGCACGGCGCUGGUGCAGAUCCUGGGCCUGACCUUCGCCAUGACCAUGUACUGCCAAGUGGUCAAGGCAGACACCUACUGCGCGUAGGCCGCCCACCGCCCGCUUCUCUGCCAAAAGGACGCCCACGGGGAGAUGGCCGCACCCACAGCUGCCUUUCCCACCACCAGCCUCGGUGCUCUGCCCCAUGCUGGGAGGAGGGAGGGAGGGACAGGUGCCUGGAGCCCCCGGAACCCUGUUUCUGGAAGGCCCUAGCUCAGGUGGCUUCAGGGCCUCCGGACCCCCCCUGGGAGGGGUGGCCACGUGCUGGCUGCGGAACCCAGGGCAGGGGUGGGAGGGGCCUCCAGCACUUUUUAUAUUUACGUAUUCUCCAAAGCAGUGUUCACACGGGAGCCAGCCUGUGGCCCCCAGCCUCCUGGAAAACAGGUUGGCGCUGGAGGAGCCGGGUCUUGGCAUCCUGGAGGUGGCCCCACUGGUCCUGGUGCUCCAGGCGGGGCCGUGGACCCCUCACCUACAUUCCAUAGUGGGCCCGUGGGGCUCCUGGUGCAUCUUAAUAAAGUGUGAGCAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-582.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -604.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 288.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((..((..(.(((((((..(((.((.(((((.((((((((.(.(((((((((((((((((.........)))))))(((((((.(((.(((((....))))))))........)))))))))))))).....(((((((((..(((..((((((.(.((((((.....)))))).).)).)))).)))..)))))))))..)))).)))))))).)))))..)))))..)))))))).))..))(((((((.((((((((((((((..(((..(((((((..((((((((((..((((((((((....(((((.........)))))((((((.....(((((((((((.(((.(((((.(((.((((((((.......))).)))((((.((((......)))).))))....(((((.(((...)))..))))).))..)))...))))).)))))))).))))))....))))))(((((......(((((......))))).......(((((....((((((((((.(((((.......))))).))).......)))))))))))).....((((((........))))))..)))))....(.((((.....)))).))))))))(((((..((((((((........)))))((((((..((((.(((((..(((.((..((((((.(((((....)).))).)))))))).))).....)))))))))..))))))(((.(((((((..........))))))).))).....(((((.....)))))..)))..))))).((......))....)))..)))))))))).)))))))(((........)))(((((((.((.(((((...((.((...))))...)))))..)).)))))))...)))))))))).(((((((((((..((((((..(((((.((((((((((.....))))..)))))))))))((((((((((((....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))(((((((((((((((((((((((((((....)))).....)))).)))))).....((((((((((((..((((((((((((((((.....))))..)).))))).)).)))))))..)))).))))))))).((((((....(.(((((....)))))))))))).....)))))).))........)))).))..))).)))))))).))))............))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{{..{{..|.|((((((..(((.((.(((((.((((((((.(.(((((((((((((((((.........))))))){(((((({(((.(((((....))))))))...},...,)}))},))))))).....(((((((((..(((..((((((,(,(((((({...,)))))).).)).)))).)))..)))))))))..)))).)))))))).)))))..)))))..))))))||,||,,||(({{{{{.,((((((((((((,.,(((..(((((((..((((((((((..(((({(((((....(((((.........)))))(({{{(,{{,,{({{((({{((,(({.(((((.(({{,.((((((.......))).)))((((.((((......)))).))))...,(((((.|||...|||,{,|||}.,,..)))},,))))),)),})))),}))|||,...||||||,,,,({..{{,(((((......)))))..,,...,{(({.{{.((((((((((.{{(((...,..,|||},.},}||||...}))))}}}}||,,.,{(((((((........))))}}))),},,,,|||,((((.....)))).))))},,)|||||..|||||||{||..,,.,},||{((((((..((({{(((((..(((.((..((((((.((({(....)).))).)))))))).))).....)))))))))..))))))|||.(((((((..........))))))).}||{{....,,.|,}}}})),)).,)))}})})))}{{......))....)))..)))))))))).))))))){({......,,|,|(((((((.((.(((((...((.((...))))...)))))..)).))))))).,,)))))))))).(((((((((((..((((((..((((,,((((((((((.....))))..)))))))))))((((((((((((....(((((((.....)))))))....)))))))..)))))(((((((({{(((((((((,{{{,,,,....,,,,.....}}}}.))))),..,.|((((((((((((..((((((((((((((((.....))))..)).))))).)).))))))}..)))).)))))}})},((((((.,,,(.{({{{.,..))))},))))))}.}}.)))))).))........)))).))..))).)))))))).))))..........,,))}))})))),..