Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001029989.3

Sequence Length

1969 nt

GC Content

0.4083

CCUUGUCCAGUGAAACACCCUCGGCUGGGAAGUCAGUUCGUUCUCUCCUCUCCUCUCUUCUUGUUUGAACAUGGUGCGGACUAAAGCAGACAGUGUUCCAGGCACUUACAGAAAAGUGGUGGCUGCUCGAGCCCCCAGAAAGGUGCUUGGUUCUUCCACCUCUGCCACUAAUUCGACAUCAGUUUCAUCGAGGAAAGAGCAUGUCCUUUGCAACCUGAUCACACAAAUGAUGAAAAAGAAUAGAACUUUCUCAUUCAUCUUUGAAUAACGUCUCCUUGUUUACCCUGGUAUUCUAGAAUGUAAAUUUACAUAAAUGUGUUUGUUCCAAUUAGCUUUGUUGAACAGGCAUUUAAUUAAAAAAUUUAGGUUUAAAUUUAGAUGUUCAAAAGUAGUUGUGAAAUUUGAGAAUUUGUAAGACUAAUUAUGGUAACUUAGCUUAGUAUUCAAUAUAAUGCAUUGUUUGGUUUCUUUUACCAAAUUAAGUGUCUAGUUCUUGCUAAAAUCAAGUCAUUGCAUUGUGUUCUAAUUACAAGUAUGUUGUAUUUGAGAUUUGCUUAGAUUGUUGUACUGCUGCCAUUUUUAUUGGUGUUUGAUUAUUGGAAUGGUGCCAUAUUGUCACUCCUUCUACUUGCUUUAAAAAGCAGAGUUAGAUUUUUGCACAUUAAAAAAUUCAGUAUUAAUUAAACAUUACUUAUUCUACCCUCUUUUUUGGCAAGGAGGACAAAUACGCAAUGUUGGAAAACCUUGGAUGGAUAUCUUCUCUUUAAAAAAAUGUAAAGAUAAUUUGGUCUUGAGGGUUUAAACGGUUGAUAAUGCCUCUACAACAACAAGAAAAAAGAUAAAAUACUAGGAUAGAAUCAUGGUGGGCACAGUGGCUUCUCAGGAGGCUGAGGAGGGAGGUUUGCUUGAGUCCAGGAGUUGGAGACCAGCCCAGGCAACAUAGCGUAAACCCUAUCUCUAAAACAAUUUUUAGCCGGGUGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUCUGGGAGGCCGAGGCGGGUGGAUCAUGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGCCUAACAAGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCGCGGUGGCGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGCGUGAACCCGGGAAGUGGAGCUUGCAGUGAGCCGAGAUUGCGCCACUGCAGUCGGCAGUCCGGCUUGGGCGACAGAGCGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUUUUAAAAAAGGCUGAGUGCAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCAGGUGGAUCACCUGAGAUAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAGCAUGGUGAAACUGUCACUACUAAAAAUGAAAAAAUGAGCCAGGCAUGGUGGCACAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCCAGAUUGUGCCACUGCACUCCAGCCUGAACAACAGAGUGAGACAAUGUCUUAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAAAAUAUAUAUUUAUAUAUGAACAAUAAAAAAUUAGCCUGGCAUGGUGGCACACACAGUGGAACCAGAUCCCAUCUCUUAAAAGAAAUUUUCCUAGGAUUUGCAUUUGAUUCGCUAUCAUAAAAUAUAAUUUUAAAGUUGGAAGUCAAUAUAACAUGAAAGGCAAAUCAUGCCAUAAACCCAUAGGCAUGGCAAAACUCCUAAGAGCUACUAUGACAUUUUUCAACAUAACCAGAGGUAUAAUUGAAGAAGUGGGUAUAAUAUUCCUCAUCACCCUUUUUGCAGCAGCCUGUUGUCAAAAGUAAUCAUAUUUUAGUAGGCAUAUUUUUCUGAAAUACGUUUGUAAUAAAUGCAUACUUAUUUUUACAAUACACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-550.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -588.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 538.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((..((((..((((((((((((((((....(((...(((((((((..((((.((((((..((((..(((((((((.((..(((((..(((..((((((((((.........(((.((((.....)))).)))...))))))))))......))).)))))...)).)))).)))))..)))).)))))).))))..........((..(((((.....((((.((((((..((((.......))))..))))))))))......(((.(..((((((((.(((((((((((.(((((....)))))....(((((((((((((......)))..))))))))))..........(((((((((.....((((((((..(((..(((.((((((.......((((...((((.((((..........))))))))..))))(((((((((((.((((((((((....................((((....)))))))))))).)).)))))))))))....)))))).))).)))))))))))....)))))))))((((((..((.((((((((...((((.....))))..))))))))))..((((((((..((....((((((((....))))).)))..(((((((........)))))))............((((((.(.((((....(((((((......)))))))...)))).).))))))...(((((((((((.((((((((..(...........)..))))))..)).))))..)))))))....)).))))))))....)))))).....................)))))))...)))).))))))))..).)))...)))))..)).)))))))))((((((((((.((((.((.(((((...))))))).))..)).))).)))))))..........)))..))))))))))))...))))..))))(((.....((((((....))))))))).((((((((.(..((((.(((.(((((...........))))))))......))))..)))))))))((((((((.............(((((((((((((((((((.((((((((.(((.((.((((((.......(.((......)).).....)))))).))))).)).))))).).))).......)))))))))((.(((.((((..((((.(....).))))..))))))).))..............................(((((((((((((((((.((..(((....((((((....)))))).....)))((((((...)))))).....((.(((((..(((((((((((((...((((((.....))))))...............)).))))))).))))(((....)))((((((((((.((.((((((((((.((..(....)..))))))...)))))))).))).))))))).)))))))....)).))))))))))).))))))...........((((((...))))))............................((((((....))))))................)))))))((((((((.......((((.........)))).(((....))).....((.((((((((((..((((((..(.((..((((((...))))))..)).)..))))))...................((((((...........)))))))))))..))))).)))))))))).((.((((((((....(((...)))....))))))))))((((...............))))(((((((((((...))))).))))))........)))))))))))).........((((((.((.((((.....)))).)).))))))............

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{({,..((((..((((((((((((((({....,,,...(((((((((.{((((.((((((..((((,.(((((((((.,,..(((((..(((..((((((((((.........(((.((((.....)))).)))...))))))))))......))).)))))...,,.)))).))))),,)))).)))))).,|||.{.,{,{{.{{{.{((((({....((((.((((((..((((.......))))..))))))))))...,{,(......||||{{.(((((((((|{|{.(({((,,,.|}}}}....(((((((((((((,.....}}),,))))))))))..........||||||{||,,,|,{{{{{{||,,{{,.,(((,(({{{{.,,{,{{{{{{.,{(((({(({({{,{{{{,,,|}|||||||||||,,{{{{{{{(((.((((((((,,.....|}}}}}|,,,},,..||||...,))))})))}})),)}.))))}}))))},.,,,|||||.|||.}))})}}}}}|,}|,,)))}}}||((((({.,{{,(((({{{{,,.{(((,,.,,||}}.||}}}}}}|||,,.,{{(({,|{{{{{{{{{((((({....})))}}}},,}||{((((........)))}}},.{{{{..,,,,.,,,,,}}},.,,,.,..{{{{{{|...}}.)))))))}}}}.,,.}|||||||...(((((((((((.((((((((..(,{{.....,,.)..))))))..)).))))..))))))).,,,{{{,,.....)))..}}))))}},..............})))))))).},},}))).)))}}))).}).|||,{|}},})}})|,))))))))}((((((((((.((((.((.(((((...))))))).))..}).))).)))))))..........,,,..})))))))))))...))))..))))(((,....{(((((....))))))))).((((((((.(..((((,(((.(((((,........,.))))))))..},..))))..))))))))),{{{{{,,.............(((((((((((((((((((.((((((((.(({,((.((((((,.{{,.,{.(,...,..))}).}...)))))).))))).))}})))).).))).......))))))))){(.(((.{(((,.{(({.{....}.}))),.)}))))),)),....................}}}}.....(((((((((((((((((.((,,((({,..((((({....}))))).....}))((((((...)))))).....((.(((((..(((((((((((((...((((((.....))))))...............)).))))))).))))(((....)))((((((((((.((.((((((((((.((..(....)..))))))...)))))))).))).))))))).)))))))....)).)))))))))))},)))))...........{(((((...)))))}............................((((({....})))}}................))))))|((((((((.,.....||((,......},}}}|,{{,....}}}.....{{.((((({((((..,{((({.,({,{{{(,,{({...}||||}..,.,}},)}}}}}},,...}}},..}}).,,,{(((((,{.......,.))))))))))}..))))).)))))))))),{{.((((((((....(((...)))....))))))))}}((({.........,.....}}}|{((({((((({...))))),}))))}......,,}}}}})))}}}...,,}},,,|||||{.((.((((.....})}}.}).)))))),}}},..,....