Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001029991.2

Sequence Length

1612 nt

GC Content

0.5236

GUUUCCGGUUCGCCUCCGGAGCCAUGGCGGCGGCACUGAAGUGUCUACUGACAUUAGGAAGAUGGUGCCCCGGCCUUGGAGUGGCUCCCCAGGCCCGGGCGCUCGCCGCCUUAGUACCCGGAGUGACCCAGGUAGAUAACAAGUCCGGUUUCCUGCAGAAGAGGCCUCAUCGCCAGCACCCUGGCAUCCUAAAGCUGCCGCACGUGCGGCUGCCACAGGCACUGGCUAACGGUGCCCAGUUAUUGCUACUUGGGAGCGCUGGGCCCACUAUGGAGAAUCAGGUGCAAACACUGACCAGUUAUCUCUGGAGCAGACAUUUGCCUGUAGAGCCAGAGGAGUUGCAAAGACGGGCUAGGCAUCUUGAGAAAAAAUUCCUGGAAAACCCAGACUUAUCUCAGACAGAGGAGAAACUUCGUGGAGCAGUGCUACACGCACUACGUAAAACUACCUACCAUUGGCAAGAACUGAGCUACACUGAGGGACUGAGCCUGGUGUAUAUGGCAGCAAGACUGGAUGGUGGCUUUGCAGCAGUCUCCAGAGCAUUCCAUGAGAUCCGGGCUCGAAAUCCAGCAUUUCAGCCACAAACUUUGAUGGACUUUGGCUCAGGUACUGGUUCUGUCACCUGGGCUGCUCACAGUAUUUGGGGCCAGAGCCUACGUGAAUAUAUGUGUGUGGACAGAUCAGCUGCCAUGUUGGUUUUGGCAGAAAAACUACUGAAAGGUGGUUCAGAAUCUGGGGAGCCUUAUAUUCCAGGUGUCUUUUUCAGACAGUUUCUACCUGUAUCACCCAAGGUGCAGUUUGAUGUAGUAGUGUCAGCUUUUUCCUUAAGUGAACUGCCCAGCAAGGCUGACCGCACUGAGGUAGUUCAAACCUUAUGGCGUAAGACAGGUCAUUUCCUGGUACUGGUGGAGAAUGGAACAAAAGCUGGGCACAGCCUUCUCAUGGAUGCCAGGGAUCUGGUCCUUAAGGGAAAAGAGAAGUCACCUUUGGACCCUCGACCUGGUUUUGUCUUUGCCCCGUGUCCCCAUGAACUCCCUUGUCCCCAGUUGACCAACCUGGCCUGUAGCUUCUCACAGGCGUACCAUCCCAUCCCCUUCAGCUGGAACAAGAAACCAAAGGAAGAAAAGUUCUCUAUGGUGAUCCUUGCUCGGGGGUCUCCAGAGGAGGCUCAUCGCUGGCCCCGUAUCACUCAGCCUGUCCUUAAACGGCCUCGCCAUGUGCAUUGUCACUUGUGCUGUCCAGAUGGGCACAUGCAGCAUGCUGUGCUCACAGCCCGCCGGCACGGCAGGUAUGGGGGGUGUGACCAAAAUCAGUGGGAUGUGGCAGGAAGCUGCAGCCCACGCCAGCAUCUGUUUCCACAGGGAUUUGUAUCGUUGUGCCCGUGUCAGCUCCUGGGGAGAUCUUUUACCUGUGCUUACUCCGUCUGCGUUUCCUCCAUCUACGGCUCAGGAUCCCUCUGAGAGUUGAUGAGGAUGUGUAACAAGUAUUUUCUUCUAUCGUGCCUGCCAGGGCUGAAGCUGCCUGGUAUCCAGGAGGGGAAUGCUGGUAUCCCCAUAUGUCUGUGUUUGUUUGAGAUUUUUAAUAAUAAAUAAUAAAUUUUUGAAGAAUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-583.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -612.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 449.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((.((((((((((((.((((((((.(((((((((((....)))))).((..(..(((((((.(((((.((((...))))..))))).)))))))..)..))))))).))((((((((.(((((((((..........((((((((.(((..((((((.....(((((....)))))..(((((.((.(((((....))))).))....(((((((.....))))))).(((....)))..)))))((((.((((((..((.((((((....(((((.....(((.((((......))))..)))......((((((.......(((((((((((......(((((((.....(((((........((((.....)))).....)))))(((((.((((....(((((((...(((((.....)))))..(((........)))(((.((((((.((.((((((...((((((...((((((((....(((((..((....(((((.((..(((....)))..))))))).))...)))))....))))))))(((((.....)))))((((((((...))).))).))..(((((((((((.......)).)))))))))((((.(((..((((..(((((((((.(((((.....((.(((....))).)).......))))).))))))))).....(((((((....)))))))))))..)))..)))).......((((((((.(((((...((((.(..(((((((((((......)))))))......)))).).))))..(((((((((((((((((((((((((...((....))...))).)))))))))...(((((...))))).((((((....(((((((.(.(((.((((..........((((....)))).))))))).).)))))))))))))...)))))))))))))))))).))))..))))))))))...)))))).)).))))))..)))...))))))))))).))))).............))))))))))))))))))))))))))))).......(((((..(((.(((.(.....((((.(((((......))).)).))))).)))..))).))))))))))).))..)))))).))))(((...((...))...)))...........))))))..((.(((......))).)).((((...(.(((((((((.((((.((((((.(((((((.(((.(((..((.....)).)))))).))))).........(((((.((((((.....)))))).))))))))))))))))).(((....)))..........))))))))).)))))..))))))))))).)))))))).).))))))))..((((..(((((.(((.((..((((((.....)))))).)).))))))))..))))..(((......)))...(((.((((....))))))).)))))))))).))).))))).))..))))).....((((...((...(((((((....(((......)))....)))))))....))...))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,{(((({{{.{,{||||||(((.((((((({,.((,.{(((((....)))))),||.....(((((((.(((((.((((...))))..))))).)))))))})))))).,|{{.{{(((,((,,{((((((((({{{{......((((((,{.,,,..||||||.....(((((....)))))........((.(((((....))))).))....(((((((.....))))))).,|}}},..})}}))))),||,}||||{{.,||.{{((({.(({((({,..||.|}|}((((......)))).((({.....,||({(({{{....((((((,(((,..{{{(((,(((({{,..(((((..,...,.((((.....)))),.}}.)))))(((((.((((....(((((((.{.(((((.....))))).,(((....,,,.,,,{{{.((((((.((.((((((...((((((..,((((((((..,.(((((.,((....(((((.({,,(({....))),.}}))))).)).,.)))))....))))))))|{{,{,{,,.|||||,{(((({....,|,.}||.{{{{((((((((((({{,..,.||{,,,,,))),|..|.|||}}|||}},|||||||||,(((({....,||}|||||||,||{,,...||||}}}},.}}}}})))),,...{{{{{{{....))))))}|||,.,)))||||}},.....,|||(((((.(((((...((((.{..(((((((((((......)))))))......)))).}.))))..(((((((((((((((((((((((((...((....))...))).)))))))))..{(,,,.}}..,,,|,((((((....(((((((.(.(({{((((.{,.......((((....))))}))))))).).))))))))))))).,,)))))))))))))))))).))))}.,))}))))))...)))))).)).))))))..}))...))))))))))).)))))..{{{,,,.....}}))||||||||}}}}}}}}}))),,,........{((((...(((,(((.(,.,..((((.(((((......))).)).)))),.)}),,)}).})||||||||,.,)}}))))}}.}|||{{(||{{{,.,.....|||||{.......,))}}},||{{.((({.....}}}.}},{{((.,...{((((((({.((({.{{{{{|,|||||{{,{{{.{{|,,,{,,,.))),))))))}))))).........(((((.((((((.....)))))).)))))))))))}}}}}}.,,({{{{,||{....}}}.}))))}}})},,)))),.}})))))}}}}.,,}}}}}),)})))}))))}}||||.,||||}.{||,||,,((((((.....}))))).},.}|||}|||,.,},,.,.{({{{{{{|||{,.,{,,({{({{{,||||,,..}},))))))),}}),)))))}))}})))}),},},{|||...||.,,||||||{...,|{{,,,...}}}....}}}}})}....}}...))))..