Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001031740.3

Sequence Length

2363 nt

GC Content

0.6140

AGGCGCCACCACCUGCCGCCCAGGCAGCCAGGCGACUCUUCUUUCGCGGGUCACGCGGCCUGACUCAGGCCCCUGCUCCUGUGGCCCCGAAACUCGCCGUUCGCUGGGCCUUGCGUUGCACUCGGCGUGCAGUUCCCCCUCGGCUCGCGGCCACUUGGUCCGCGCCGCCUGCGUCCUGUGUGCCGAGCCCGCCCGCACUGCGGGGACAGGCCGGGCGCCGCCCACGCCGCGCUCUGCCGGGCGCACAGUCUGCCUGGGAAGCGCGCGGCCGGGCGGGCGGCCAUGGCGCGGCACGCUGGGAGGUAGCGCGGCGGCUGCAGGAGCGCACAGUCGGCCAUGGCCCGGCGGCGGCGCCGCGCCUGCAUCGCUCUGUUCCUGGUGCUGCUCUUCGCCUUCGGCACCCUCAUGGGUCUGCGCACGCUCAAGGCUCCGGACGGACUCCCGGCGCUGGGCCCGGGCCUGGAGCUGGCGCCCUUUGAGCGACGCCCAGAGGGGGCCCCCGCGCCCGCUGCCAGGGCCCCGGCAGCCCCUGCCGCGCCGCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCACCGCGGACCCUGGCGGCUCCCCUGGGCCGGCACCCGCGGAGGCCGAGCCCGCCCCCGUGCAGAGCCUGCGCGUCUACUCGGACCUGCACGCCUUCUACUACUCGUGGUACGGGAGCCCGCGGCGCGAGGGCCACUACAUUCACUGGGACCACGUCAUGGUGCCGCACUGGGACCCCAAGAUCUCGGCCAGCUACCCCCGCGGCCGCCACAGCCCCCCAGACGACUUGGGCUCCAGCUUCUACCCGGAGCUGGGGCCCUACAGCUCCCGGGACCCCGAAGUGCUGCGGGAGCAUAUGACCCAGCUCAAGGAAGCCGCCAUCGGCGUCCUGGUCCUGUCCUGGUACCCACCUGGCAUGGCUGAUGAUAACGGGGAGCCCUCAGAUGACCUGGUGCCCGCCAUUCUGGACACCGCCCAUCAGUACAGCAUCCAGGUGGCCUUCCACAUCCAACCCUACAAGGGCCGGGAUGACAUCACUGUACAUGACAACAUCAAGUACAUCAUUGACACAACUGGAAAGCUGUGAAGAACUUUUGUGAUGCCAACAACCUCAUGUUCAUCCCCAGUGUGGGGCCUGGCUACAUAGACACCAGCAUUCGGCCCUGGAACAACCACAAUACGCGCAACAGGGUCAAUGGCAAGUACUAUGAGACGGCCCUGCAGGCGGCCCUGACAGUGAGGCCCGAGAUCGUUUCCAUUACCUCCUUCAAUGAGUGGCACGAGGGCACCCAGAUUGAGAAGGCCAUUCCCAAGAAGACACCCACCCGCCUGUAUUUGGACUACCUGCCUCACCAGCCCAGCCUGUACCUGGAGCUGACACGCCGCUGGGCGGAGCACUUCAUCAAAGAGAAGGAGCAGUGGCUCAUGUGAGGGGCCUGUAAAUGGGCGUGAGGUGCUGAUGUCCUUGCCUUGCUGGAAGAUGUCACCAUGUGGGGUUCAGCUGAGGUUGUAGCCACUCACUCGUUCCCAGGUCAGAGGUCAGCAGAUGGGUGUUUCUGGGUGGGCCGUCAGGCAUGGGCCUGUGCAACACAGAGCCCGUUCCUCAGGCGAGUGGUGCUGAGGUGCUCUGUGGUGAUGGGAACGGCAGAGGCUGGCAGGUGACUGAACUUAGCCCAGGGCAGCUCCACAUCCUGGGAACACUUUCAUGUAACCCCUUCUAGUUUUGAACUCUGCAGCAGGCUGGUGCUGUGUAGUGGCCACCCAGUCACCACCCUUGGAAGGGUGUCAGGGUCUGGGCUCGCAUGCACCCUGCUCCCUUCUGCCAGCCUGCAUCCUCUCCUCAGGCCUCCUUCCCACAUCAUCUGUCUUCUCUAAGUUAGGGAACCAUAUUUGAGACUUUCAAAAAGGGAACUUCUAGGUUUAAGCUCCUCCCAGUAGAUUCCUGAACCCAAUUAUCAGGAAAUCAUCCUGAGCACUCACAGGUUCAUUUAACACUCACUCAUCAAGCACCUUCCUAUGUGCUAGGUGCUGGGGAAAACUUGACCAAGGAAGAGUUCCUGUCCUGAAGCUUCCAGGACCCAGCUUUCCUUUUCUGGUGUGGCCUUGUAGCUAGUGCCUGGGCACAGGUGUUUUUCUUUUUGCAGUUUUACCUAGUGCUGGGAGUUCAGUUCUUUUUCCUCUAGAAAAAUACCUCUGUGCUCCAGAGCCUAAUUUUUCCCAGAUGCAUAUUUAGCUCUAGGGAGAGGACUAGGAGGAAAUCCCCCUCCCUUUAGCUGCCUGAACUGACUGAGGCCCACUCACUAGAGCCAUGUUCAGUGCUACUGUGAUUAGUAGUAAUUAAAUAUGAACUGGUAUUCUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1012.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1049.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 455.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.((.....)).))))((((((((.(((((.......(((((.(((((((((((((((...))))))...))....))))))))))))..((((((.(((((((((.((.((((.(((....((((.(((((....(((((.((((((....)).))))(((((((((.((((((((((((.(((..(((((...)))))....((((..((.((((((..(((((((.((.(((((((.......)))))))..)).))))))).))))))))))))..))).)))))))).)))).)))).))))))))))..)))))))))))))))))).)))))))))))))))...)))))(((.((((........)))).))).....(((((.(((((((....))))........))).)))))...(((((((((((((((((((((...((((.(((.(..(((.(((((((.((...)).))))))).))))))).))))((((.((((((((((((((...)))))(((((((....(((((((...((((........))))....)))))))......((((((((..(....)..)))).))))((.(((((((((.((.((((.((((....)))).)))).)))).............))))))).))..))))))).((((((....................((((.(((.((((((((((............(((((.((.......))))))).((((((...((((.......(((((((((((((.....))))))))))))).((((...(((((((.((((.(.((.((..((((..........))))......)).))).)))).)))))))..))))..(((...((((((((.((((((((((.....((((...))))........(((((.(((......))).)))))..)))))))....)))))))))))....)))(((((..((((...))))...))))).......(((((.(((.....))).)))))............))))...))))))....((....))((((..((((......)))))))))))))))))).)))))))..(((((((.....((((.(((((((.....................)))))))))))....)).)))))....))))))...)).))))))).))))((((((.(((..(((((((((((((((.......)))...(((.(((((((((((.........(((((((((.....(((.(((((((((((..(((((....((((.((((((((((((((.......)))).))))...((((....)))).....((((........))))((((....))))..))))))((((((..(((((..(((((..((((........(((((((((...(((.((((...)))).))))))).)))))..))))..))))))))))..))))))..))))...)))))))))......)))))))..)))(((.(((((((((((...))))).)))))).)))..)).))))))).))).)))))))))))))))))))))))(((((((((((.(((..((((((.....(((((((..........)))))))......)))).))....))).)))))......)))))).((((((((((...(((..(((((......))))))))....(((((((.(.((((((....((......))))))))).)))))))))))))))))........))).))))))..................(((((((...))))))).......(((((((..(((((((((((((.(((((........)))...)).)).))))((((((......((((((.....)))))).........)))))).................((((((((.((((.(((((((.(((.(((....(((.((..(((((.(((((...((((((.......))))))..)))))))))).)).)))....))).))).))))))).))))...))))))))..))))))).)))))))))))))))))))))))).))))((((((.....))))))...(((((.....)))))......((((((((((.((.......))))).))))))).....(((((.......))))).....))))))))..(((..((((.....)))).))).((((.(((((.((((((((....))))))))........)))))))))........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((.({.....}).))))((((((((.((((({......(((((.(((((((((((((((...))))))...))....))))))))))))..,((((,,(((((((((.((.(({(.{{{,,,,((((.(((((....(((((.((((((....)).))))(((((((((.((((((((((((.(((,.(((((...)))))....((((..((.((((((..(((((((.((.(((((((.......}))))))..}).))))))).))))))))))))..))).)))))))).)))).)))).))))))))))..)))))))))})))))))).))))))))))))))|{.{||||,{,,.,,...,}.....))))},)}...,}||||.,{({((((....)))),,|,,,..}},.,||||{{.((({(((((((((((((((((..,((((.(((.(..(((.(((((((.((...)).))))))).)))}))).))))|(((.((((((({((((((...)))))|{(((((,,.,((((((({.(((((,{{{,...))))....,))))))......((((((((..(....)..)))).))))((.(((((((((.((.((((.((((....)))).)))).))},..|,,.....,,}))))))).))..)))))))},||||{...........,{{,,,,..((({.(({.((((((((((............(((((.((.......))))))).((((((...((((.......(((((((((((((.....)))))))))))))....(((((((({((......}},||.}))))))....{{,,..|,,|.{(({.((({....)))).)))))),,}})}..(((...((((((((.((((((((((.....((({..,))}|.,......{((((.(({......})).))))}..))))))).,,.)))))))))))....)))(((((..((((...))))...))))).......(((((.(((.....))).)))))....,}......))))...))))))..|{{{....||((((..,{{{......}))))}}}))))))))||,|||}|}|,.((((({{.,..,((((.(((((((.....................))))))))))),,..)).))))),,.,)))))),}.)).))))))).))),((((((.(((..(((((((((((((.,.......,||.{((((..,(((((((,{.,{{.{,.((((...(((,,({(((((((((.{.({{((..{{{{{...,||,.((((((((((((((.......)))).))))...((((....)))),....((((.,,.....))))((((....))))..))))))((((((..(((({|.(((((..((((.....,..((((((((({,.,{(.((((...)))).))))))).)))))..))))..)))))}))))..))))))..)))})))).).)))))))))))))).,)))).|}{((.(((((((((((...))))).)))))).)))}}},}..,.)))))),.,)))))))}.)))))))))))))(((((((((((.(((..((((((.....(((((({..........}))))))......)))).))..,.))).)))))......)))))).((((((((((...({(,.(((((......))))),))....(((((((.(.((((((,,,.,,...},.),))))))).)))))))))))))))))........))).))))))..,,,,........,|,.{((((({...})))))).......(((((((..(((((((((((((.{{{((........}}},,.)).}}.}}}}((((((......((((((.....)))))).........)))))).................{(((((((.((((.(((((((.(((.(((....(((.((..(((({{(((((...((((((.......))))))..)))))))))).)).)))....))).))).))))))).))))...)))))))}..))))))).))))))}))))))))))))))))).}}}}{{{{((.....)))))}...{{,{|.,.,})})))}}}..,{{((((((((.((.......))))).)))))))}....(((((.......))))).....)))))))).......((((.....)))}.,||,{(((.(((((,((((((((....)))))))}.....,,.)))))))))..,,,...