Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001032291.3
Sequence Length
1720 nt
GC Content
0.5628
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAGGCGGCGCGGGAAGUGGACACAGGGUGGGCUGGAGCUCAGAUCUAACUGGACUCUCGCUCCUGCUGGCUGGACAUGGAGGAUUUGGAGGAAGAUGUAAGGUUUAUUGUGGAUGAGACCUUGGACUUUGGGGGGCUGUCACCAUCUGACAGCCGUGAGGAGGAAGACAUAACAGUGUUGGUGACUCCAGAGAAACCACUUCGACGGGGCCUCUCCCACCGAAGUGACCCAAAUGCAGUGGCACCUGCCCCCCAGGGUGUGAGGCUCAGCCUAGGCCCCCUCAGUCCAGAGAAGCUGGAGGAGAUCCUCGAUGAGGCCAACCGGCUGGCCGCUCAGCUGGAGCAGUGUGCCCUGCAGGAUCGGGAGAGCGCAGGCGAGGGCCUGGGGCCUCGCCGAGUGAAGCCCAGUCCUCGGCGGGAGACCUUUGUGCUGAAGGAUAGUCCUGUCCGAGACCUGCUGCCCACUGUGAACUCUUUGACGCGGAGCACCCCCUCCCCAAGCAGCCUGACGCCUCGACUCCGGAGUAAUGAUAGGAAGGGGUCAGUCAGGGCUCUCCGGGCUACAUCUGGAAAGAGGCCCUCCAACAUGAAGAGGGAGUCACCCACUUGCAAUCUGUUCCCUGCAUCCAAAAGCCCAGCAUCUUCUCCUCUUACCCGAUCGACUCCCCCAGUCCGGGGGAGAGCCGGGCCCAGUGGGAGAGCAGCAGCCAGCCCACCCACCCCCAUCAGAUCCGUCCUGGCCCCACAGCCUUCUACCAGCAACUCUCAACGCCUGCCCCGGCCGCAGGGAGCAGCUGCUAAAUCUUCCAGUCAACUGCCCAUUCCCUCGGCCAUCCCCAGGCCUGCCAGCCGAAUGCCACUCACCAGCCGGAGUGUGCCACCUGGCAGAGGUGCCCUACCUCCGGAUUCUCUGUCAACUCGAAAAGGGCUUCCAAGACCAAGCACUGCAGGACACAGAGUGCGGGAAAGUGGACACAAGGUUCCUGUUUCCCAGCGACUAAAUCUUCCUGUCAUGGGUGCCACUCGCAGCAAUCUGCAGCCCCCCAGGAAAGUGGCAGUCCCAGGACCUACCAGGUAAAGAGAUCAGGACAGCAAGCAAGACUUCAGUAGCAAACCACUACAGUCAGUACCUGGACUCGCCUCUACCCAGCAGACCCUGACUCCAGCAGAUUCUGGCCCAGGGACAGGAGGAAGAGAUGCCACCAGGGCUGGUCUCCCAGGAGUAGAGACCAUGGGAAAUGGGGUGGAUUAGGAUUGAGCUGGAGAAGACUUAAACUCUCUGGGUUGAAAGAAGAUUAGGGGAAAAGAGGUCACCUUCCAGCAGUGAAAUGAACAAAUAGAAGAUGAGAAGUACAGGCAAGUGGUUUGUCUUUAUCCACCCCCACUGUUGUGGUCAGCCCCAGAGAAUUUUAUCUUCUUCCUUGGCAUUGGUUCACUGGACAUUUCCACGUGAGCGGCCUCCGUAGCUAACCUCCCUGCCCUCUGAGGAGCCAUCUUCCUGAAUCGCAUUCUCUACUGGACUCUGGCCUGCUUGGAGAGGUGGCAGCAGGCACCUGGUCUUCAGAAAUUGUUUCCUGUGAAUUCUGUGACUCCUAAUAGGCCAGUUUGUGAUAAGCUUACUCUAUGAGUCUUCAUUUUUCUAAAAUAAAGUGAAUGUAUUUUUAUAUUCUCUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-647.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -678.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 432.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.(((...))).))))((((((..(((((.(((((((....((.(((.(((((.((((.....(((((((((((.(((....(((.(((((.(((..((((((.((((((((....((((((((.((((((((((((..(((((....((((((((.(((........))).((((((((.....))))))))....((((..(((......((((..(((((((((........(((((((..(((......)))..)))))))..((...(((((.(((((((((...((((..((.(.(((.(((((..((((.((((..(((((.....))))).))).........).))))....)))))))).).)).)))).)))).))))))))))))....(((((((.(((((....)))))((((.((((...)))).)))).(((.(((((((((..(((((.....)))))....))))).)))))))(((((......(((.((....)).))).((((......))))...)))))(((((((((((...(((............))).)))))..)))))))))))))(((((...(((....))))))))..............))))))))))))).....))).)))))).)))))).)))))..))))))..)))))).....))))..)))).)))).)))).)).)))).))).))))).)))....)))..)))))))))))....))))........)))))))))).....)))))))))))).........(((((....(((((.(((((((((.((((.........)).)).))))....)))))))))).....)))))(((((((......(((((((........))))).))...)))))))((((((((((((((.(((..((((.((.....))..))))..)))....(((((((.....((.(.((((((.(((((((..(((........)))..))))))..........((((((((((.(((((((((((.((((....))))...((....))..)))))))....((((..((.(..(((..((((...((..(((...((..((((...((((.......)))))))).))..)))..))...)))))))..).))..))))...((((......))))))))..))))))))))((((((((...(((((.(((.((((((((.((((.((((((((.(...(((((((((.(((((...(((((((..(((((....(((((.((((.......)))).)))))....)))))...))))))).((.......)).............(((.(((......))).)))))))).)))))))))...).)))))))).(((...(((((.......)))))....)))....((((((((((....)))).))))))(((.......))).......)))).).))).)))))))...)))))....))).)))))...).)))))))))))))))).))))))).....)))))))(.(..(((.((((((...(((((.................))))).)))))).)))..).)..((((...))))......)))))).......((.(((((((....))))))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{((((.(((...|}}.)))||({.,{..,(((({{((({((...,((,(((.(((((.,(((,....(((((((((((.(((,...(((.(((((.{{(,.((((((.((((((((....(((((({{.((((((((((((..(((({....((((((,,.((({,.....,)))}((((((((.....))))))))....((,({(({(.....,((((..(((((((((........(((((((..((({....})))..)))))))..({...(((((.(((((((((...{{{({.((.{.(((.(((((..((((.,{((..(((((.....)))||,|}}..|}}},,.).))))....)))))))).).)).)))).)))).))))))))))}}....(((((((.(((((....)))))((((.((((...)))).)))).({,((((((((((..(((((.....)))))....))))).)))))}}{(((({{.,.,,((.{,....,}.})}.((((......))))...}))))(((((((((((...(((............))).)))))..)))))))))))))(((((...(((....)))))))),,............))))))))))))),}...),).)))))).)))))).}))))..)))))),,))))}}...,.})}}..)))).)))).)))).)).)))).))).))))).)))..,.)))..)))))))))))....}}},....,}},))))))))}}...,,)))))}))))))}},.,,...(((((....(((((.(((((((((.((((.........)).)).))))....)))))))))).....))))){((((((......(((((((.,.....,))))).)),..))))))|(((((,..}}}}}}.(((..((((.{{.....)}..))))..))).,,,{,{.{{,{{((((((...,,(((((((((((..(((,.....},)))..)))))).)).}))......}|||||{.{((({(({{({.((((....)))).,|{{....))..))))))),,)))}|)||{,.,,||||,..(((,,{{({..,{...,,..((((...(({(.......))}})))).,}.||||,..{(((((((.((.(((((.{(,.((.(((((.{((.,,{(({{(((((,{{(((((,,{,((((({,...(((((((.,(((((((........)).)))))...(((((((((.,,,,,...(((((((..(((((....(((((.{(((.......)))}.)))))....)))))..}})))))).,{.......,}.....,,,,,,..{((.{((,,,,..}}},))))))))})))))))))(((....)))}}))))))..{{{{,.....}}))))},,.})))}}}.((((((((((....)))).))))))(({..,,.,.}},..}}},,})))})},,,.)),)))}...,,,,}|,,.,,,,,}))).))))).)).)).))))).))))))))))..,))))},}})))}}}}{{{{{,{||,,,|||||,,.,}}}}.{{{{{...{{|||..{(({{,,,.,}}))).,,,}}}}))))).||{{{{|........,,||,||(((((....))))))).))...
Back